TkA08G095350 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G095350

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 24628622-24632049 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1646 bp · TkA08G095350|TK1151|cDNA

CTTCTCCCCTGCGATTTGGTCTGTGGAGCTCGATTTCGTGAGTAAAATCATTGATATGGCGCACCTGAATCCCTCGCTCTTACTTTTCCTATCTCTAAACTTGCTCCATTTGCTTCATACGGTCATTGCTAGAGGCGGTGAACGTGATTCAGGTTTTGTGGATATAACATATGCTGCTTCAGGAAGGCATTTGTCCGAAGAAACCCACTTTCAAAAACTTAATAAGTTAGCTCAGGGGTATATGACTAATTCTGATCTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1458 bp · TkA08G095350|TK1151|CDS

ATGGCGCACCTGAATCCCTCGCTCTTACTTTTCCTATCTCTAAACTTGCTCCATTTGCTTCATACGGTCATTGCTAGAGGCGGTGAACGTGATTCAGGTTTTGTGGATATAACATATGCTGCTTCAGGAAGGCATTTGTCCGAAGAAACCCACTTTCAAAAACTTAATAAGTTAGCTCAGGGGTATATGACTAATTCTGATCTTGAGAAGGCTATCAAGGCATTCCATGGTAGATGTGGTCACATTTCCAGAATATACAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

485 aa · TkA08G095350|TK1151|PROTEIN

MAHLNPSLLLFLSLNLLHLLHTVIARGGERDSGFVDITYAASGRHLSEETHFQKLNKLAQGYMTNSDLEKAIKAFHGRCGHISRIYSIGTSVVGVPLWVMEISNNPGKEEAKPAFKFIGNVHGDEPVGRELLLLLANWLCDNYNKDPLATLIVDNVHLHILPSMNPDGFSLRKRGNAYNIDLNRDFPDQFFPINDDMDERQPETKAIMRWLKDIRFTASASLHGGALVANYPWDGTEDKSKSYFACPDDETFKYMAKLYS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G095350`
TK1151 ID	TkA08G095350
OH-1004 ID	LXL04_031215
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.454 / OH-1004 45.253 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G095350

位置 Chr08:24628622-24632049 (-)

描述 Similar to Alpha-isocomene synthase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g71696`	具有针对 C 末端精氨酸和赖氨酸残基的体外羧肽酶活性。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031215 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016102 diterpenoid biosynthetic process 生物过程

GO:0051762 sesquiterpene biosynthetic process 生物过程

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0010333 terpene synthase activity 分子功能

GO:0052682 epi-cedrol synthase activity 分子功能

GO:0080016 (-)-E-beta-caryophyllene synthase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:AAF80333

ag:AAL79181

ag:AFM43735

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.376

排名 1 · TkA08G095350 · TK1151

溶酶体／液泡0.208

排名 2 · TkA08G095350 · TK1151

内质网0.192

排名 3 · TkA08G095350 · TK1151

细胞质0.145

排名 4 · TkA08G095350 · TK1151

细胞膜0.119

排名 5 · TkA08G095350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24942Fn3_Dep-1_1st56-86 aa

PF00246Peptidase_M1469-325 aa

PF24827AstE_AspA_cat118-211 aa

PF10994DUF2817156-190 aa

PF24942Fn3_Dep-1_1st237-266 aa

PF13620CarboxypepD_reg375-414 aa

PF24942Fn3_Dep-1_1st379-411 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G095350	`PF24942`	Fn3_Dep-1_1st	56	86	0.051	14.3
TkA08G095350	`PF00246`	Peptidase_M14	69	325	5e-63	214.1
TkA08G095350	`PF24827`	AstE_AspA_cat	118	211	0.0031	17.8
TkA08G095350	`PF10994`	DUF2817	156	190	0.0024	18.2
TkA08G095350	`PF24942`	Fn3_Dep-1_1st	237	266	0.051	14.3
TkA08G095350	`PF13620`	CarboxypepD_reg	375	414	0.036	15.1
TkA08G095350	`PF24942`	Fn3_Dep-1_1st	379	411	0.051	14.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M9H7`	拟南芥	sp\|Q9M9H7\|SOL1_ARATH Carboxypeptidase SOL1	63.600%	Swiss-Prot	高置信

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