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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G092390
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 23924426-23926024 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1506 bp · TkA08G092390|TK1151|cDNA

AAATACTTGGTGTCAAATTTAGAATCATGTGCTGATGTGCCAGCCAATCTACTCTCATACAGGTAATTAATTGCTCCACGCGCACACCCCAAGGACCCTACACTCCTCTGTGGGCTCTTTTCTTGCCACGTCATCATCTTTTTCTTCCGCTTCACGGAATTGCAGCACCACCACTAAATTTACGTTCATTTCCCCGGCATACCCTTCAACAGCGACTGCAATTACAATTTACAACCCTTTATCCATCTTATGACGTTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

834 bp · TkA08G092390|TK1151|CDS

ATGGCGACTAGTTTGGTACGTAGAGGTATTTCCAGGCTTCAAACGTCTCCGGCGGCGACACTTTTGCTTTCCCGAGCTCATGCTTCCGGGCCTCAAGCTCAACAATCGGAATCCGCCGCCAGTTCTTCACAAAATCTAAAGAATTTCCAAATCTACCGATGGAATCCGGACAATCCAGCCAAACCGGAGCTACGAAACTACCAGATAAACCTTAAGGAGTGTGGACCGATGGTACTCGATGCACTTATTAAGATCAAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

277 aa · TkA08G092390|TK1151|PROTEIN

MATSLVRRGISRLQTSPAATLLLSRAHASGPQAQQSESAASSSQNLKNFQIYRWNPDNPAKPELRNYQINLKECGPMVLDALIKIKNEIDPSLTFRRSCREGICGSCAMNIDGCNGLACLTKIPSEETTMVTPLPHMFVIKDLVVDMTNFYNQYKSIEPWLKRKSPAPSGWEGKEIPQSKKDRQKLDGMYECILCACCSTSCPSYWWNPESYLGPAALLHANRWIMDSRDEYTQERLDAVNDEFKLYRCHTILNCARACP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G092390
TK1151 IDTkA08G092390
OH-1004 IDLXL04_031185
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G092390
位置Chr08:23924426-23926024 (+)
描述Similar to SDH2-2: Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g40650 富含铁-硫蛋白（IP）亚基的琥珀酸脱氢酶（SDH），参与线粒体电子传递链的复合物Ⅱ，并负责将电子从琥珀酸转移到泛醌（辅酶Q）。 暂无已核实直接文献
At3g27380 富含铁-硫蛋白（IP）亚基的琥珀酸脱氢酶（SDH），参与线粒体电子传递链的复合物Ⅱ，并负责将电子从琥珀酸转移到泛醌（辅酶Q）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0120000 富含铁-硫蛋白（IP）亚基的琥珀酸脱氢酶（SDH），参与线粒体电子传递链的复合物Ⅱ，并负责将电子从琥珀酸转移到泛醌（辅酶Q）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031185 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006099 tricarboxylic acid cycle 生物过程
GO:0006121 mitochondrial electron transport, succinate to ubiquinone 生物过程
GO:0009060 aerobic respiration 生物过程
GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分
GO:0045273 respiratory chain complex II (succinate dehydrogenase) 细胞组分
GO:0000104 succinate dehydrogenase activity 分子功能
GO:0008177 succinate dehydrogenase (quinone) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G27380
ath:AT5G40650
dme:Dmel_CG3283
dosa:Os08g0120000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.958
排名 1 · TkA08G092390 · TK1151
细胞质0.053
排名 2 · TkA08G092390 · TK1151
细胞核0.052
排名 3 · TkA08G092390 · TK1151
细胞膜0.029
排名 4 · TkA08G092390 · TK1151
质体0.014
排名 5 · TkA08G092390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13085Fer2_348-151 aa
PF22179RickCE_cat66-88 aa
PF13237Fer4_1085-108 aa
PF00111Fer292-112 aa
PF13534Fer4_17104-109 aa
PF13183Fer4_8104-108 aa
PF12838Fer4_7104-108 aa
PF13746Fer4_18104-117 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G092390PF13085Fer2_3481515.8e-33113.8
TkA08G092390PF22179RickCE_cat66880.04714.8
TkA08G092390PF13237Fer4_10851081.7e-0731.8
TkA08G092390PF00111Fer2921120.03214.9
TkA08G092390PF13534Fer4_171041092.8e-0938.1
TkA08G092390PF13183Fer4_81041087.9e-0936.7
TkA08G092390PF12838Fer4_71041080.1613.2
TkA08G092390PF13746Fer4_181041170.2212.4
TkA08G092390PF13746Fer4_181752040.2212.4
TkA08G092390PF13183Fer4_81892637.9e-0936.7
TkA08G092390PF12838Fer4_71892040.1613.2
TkA08G092390PF00111Fer21901990.03214.9
TkA08G092390PF13534Fer4_171912642.8e-0938.1
TkA08G092390PF13237Fer4_101912601.7e-0731.8
TkA08G092390PF12838Fer4_71922620.1613.2
TkA08G092390PF13746Fer4_182452710.2212.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LB02拟南芥sp|Q8LB02|SDHB2_ARATH Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial79.400%Swiss-Prot高置信
Q8LBZ7拟南芥sp|Q8LBZ7|SDHB1_ARATH Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial76.400%Swiss-Prot高置信
Q9S827水稻sp|Q9S827|SDHB1_ORYSJ Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial69.700%Swiss-Prot高置信

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