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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G092160
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 23823960-23824457 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

450 bp · TkA08G092160|TK1151|cDNA

ATGGTTCCACAATTGGAGAAGCTTCACATTACTGACACATCTTCTGCTAATAAGTTATATGAAGTTACTGTACCGAATTGCCCCCAGAAGATCAAGTCCTTCAAGTTGGACAAAGTGTGCATACATATAGGCATCACAAGTGACATTGATGCCCTTGCCATTGCAAACATCATGCCAGAGTTGCGCCATTTGCAGTTGTATGGCAATGCCATGTCAGACATTGGACTCAAAGCCATTCTTGATGGATGCCCTCACCTCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

450 bp · TkA08G092160|TK1151|CDS

ATGGTTCCACAATTGGAGAAGCTTCACATTACTGACACATCTTCTGCTAATAAGTTATATGAAGTTACTGTACCGAATTGCCCCCAGAAGATCAAGTCCTTCAAGTTGGACAAAGTGTGCATACATATAGGCATCACAAGTGACATTGATGCCCTTGCCATTGCAAACATCATGCCAGAGTTGCGCCATTTGCAGTTGTATGGCAATGCCATGTCAGACATTGGACTCAAAGCCATTCTTGATGGATGCCCTCACCTCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

149 aa · TkA08G092160|TK1151|PROTEIN

MVPQLEKLHITDTSSANKLYEVTVPNCPQKIKSFKLDKVCIHIGITSDIDALAIANIMPELRHLQLYGNAMSDIGLKAILDGCPHLESLDIRTCYNVDIHGNELKLCMERIKNFKGPEDSIENCGFHPRVLEYDEDYYFDEYDNPTHDD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G092160
TK1151 IDTkA08G092160
OH-1004 IDLXL04_031178
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.604 / OH-1004 78.488
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G092160
位置Chr08:23823960-23824457 (-)
描述Similar to FBL23: Putative F-box/LRR-repeat protein 23
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g05490 推测的 F-盒/LRR 重复蛋白 22。 暂无已核实直接文献
At4g05500 推定 F-box/LRR 重复蛋白 23。 暂无已核实直接文献
At4g05460 SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分，可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At4g05475 假定F-box蛋白At4g05475。 暂无已核实直接文献
At4g05470 假定F-box/LRR重复蛋白21。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031178 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:1905761 SCF ubiquitin ligase complex binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G05460
ath:AT4G05475
ath:AT4G05490
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.580
排名 1 · TkA08G092160 · TK1151
细胞核0.505
排名 2 · TkA08G092160 · TK1151
内质网0.068
排名 3 · TkA08G092160 · TK1151
细胞膜0.051
排名 4 · TkA08G092160 · TK1151
细胞外0.030
排名 5 · TkA08G092160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_43-12 aa
PF13855LRR_83-13 aa
PF13516LRR_65-12 aa
PF00560LRR_15-14 aa
PF24758LRR_At5g5637028-105 aa
PF23286LRR_1341-98 aa
PF12799LRR_444-74 aa
PF13855LRR_848-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G092160PF12799LRR_43122.4e-0731.5
TkA08G092160PF13855LRR_83130.005817.1
TkA08G092160PF13516LRR_65120.0006320.3
TkA08G092160PF00560LRR_15140.411.7
TkA08G092160PF24758LRR_At5g56370281058.8e-0832.8
TkA08G092160PF23286LRR_1341980.01216.0
TkA08G092160PF12799LRR_444742.4e-0731.5
TkA08G092160PF13855LRR_848920.005817.1
TkA08G092160PF12799LRR_459942.4e-0731.5
TkA08G092160PF25372LRR_FBXL15591020.03813.1
TkA08G092160PF13516LRR_661790.0006320.3
TkA08G092160PF00560LRR_161760.411.7
TkA08G092160PF13516LRR_683920.0006320.3
TkA08G092160PF00560LRR_1851010.411.7
TkA08G092160PF00560LRR_11211260.411.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M0U6拟南芥sp|Q9M0U6|FBL22_ARATH Putative F-box/LRR-repeat protein 2243.200%Swiss-Prot中等置信
Q9S9V9拟南芥sp|Q9S9V9|FBL23_ARATH Putative F-box/LRR-repeat protein 2344.600%Swiss-Prot中等置信
Q9M0U9拟南芥sp|Q9M0U9|SKI19_ARATH F-box protein SKIP1947.000%Swiss-Prot中等置信
Q9M0U7拟南芥sp|Q9M0U7|FB221_ARATH Putative F-box protein At4g0547548.100%Swiss-Prot中等置信
Q9M0U8拟南芥sp|Q9M0U8|FBL21_ARATH Putative F-box/LRR-repeat protein 2141.000%Swiss-Prot中等置信

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