基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA08G088240
当前版本: TK1151
染色体: Chr08
坐标: 22848338-22849822
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1410 bp · TkA08G088240|TK1151|cDNA
ATGGGTTACCTCTCTTGTAATGCCGAATCCGCCATTTCCACCTGCGATTCTTACAATTTGAATTTGTCCAGGAAGAAATCGCCTTCCAATCCACATAATAAGCACTTTAAGATCAGGGATTTCTGTTTTTCTGATCTCGAAGCGGCTACCACGGGATTCTCACAGACCAATTTCCTTGGGAAAGGAAGCCATGGTTCTGTCTATAGAGCTATTCTTGACGGTGGCGCTTTGATTGCGGCCGTTAAACGAACCACCAATCA...
CDS
下载 CDS FASTA1410 bp · TkA08G088240|TK1151|CDS
ATGGGTTACCTCTCTTGTAATGCCGAATCCGCCATTTCCACCTGCGATTCTTACAATTTGAATTTGTCCAGGAAGAAATCGCCTTCCAATCCACATAATAAGCACTTTAAGATCAGGGATTTCTGTTTTTCTGATCTCGAAGCGGCTACCACGGGATTCTCACAGACCAATTTCCTTGGGAAAGGAAGCCATGGTTCTGTCTATAGAGCTATTCTTGACGGTGGCGCTTTGATTGCGGCCGTTAAACGAACCACCAATCA...
469 aa · TkA08G088240|TK1151|PROTEIN
MGYLSCNAESAISTCDSYNLNLSRKKSPSNPHNKHFKIRDFCFSDLEAATTGFSQTNFLGKGSHGSVYRAILDGGALIAAVKRTTNHHSPEKSIASPAENEIETLSRVRSPRLVNLLGFGSDPVDGRKLIVVEYMPNGSLYDLLHKNDAKTPGLARRVRIAVQVAKAVHHLHTSNPPVIHRDIKSSNVLFDGKWNARLGDFGLALRGNVEDVKVRCTPPAGTLGYLDPCYLAPGDLSSKSDVFSFGILLLEIFSGRNAID...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA08G088240 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA08G088240 |
| OH-1004 ID | LXL04_031122 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Probable |
| 蛋白一致性 (%) | 94.700 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA08G088240 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr08:22848338-22849822 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At1g28390: Serine/threonine-protein kinase-like protein At1g28390 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0009786 regulation of asymmetric cell division 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0010311 lateral root formation 生物过程 GO:0032877 positive regulation of DNA endoreduplication 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0048364 root development 生物过程 GO:0048439 flower morphogenesis 生物过程 GO:0048829 root cap development 生物过程 GO:0090392 sepal giant cell differentiation 生物过程 GO:0090627 plant epidermal cell differentiation 生物过程 GO:0099402 plant organ development 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G28390 ath:AT3G51990 ath:AT3G59420 ath:AT5G23170 dosa:Os03g0637800 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.631
细胞核0.270
细胞质0.238
内质网0.041
质体0.029
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069Pkinase54-324 aaPF07714PK_Tyr_Ser-Thr56-326 aaPF01636APH60-171 aaPF01636APH171-194 aaPF22841CATSPERE_NTD1251-275 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA08G088240 | PF00069 | Pkinase | 54 | 324 | 4.7e-37 | 128.5 |
| TkA08G088240 | PF07714 | PK_Tyr_Ser-Thr | 56 | 326 | 6.3e-36 | 124.7 |
| TkA08G088240 | PF01636 | APH | 60 | 171 | 0.19 | 12.2 |
| TkA08G088240 | PF01636 | APH | 171 | 194 | 0.19 | 12.2 |
| TkA08G088240 | PF22841 | CATSPERE_NTD1 | 251 | 275 | 0.23 | 12.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SGN7 | 拟南芥 | sp|Q9SGN7|CCR12_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein At1g28390 | 53.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SV05 | 拟南芥 | sp|Q9SV05|CCR35_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein At3g51990 | 48.600% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9FMY3 | 拟南芥 | sp|Q9FMY3|STPKL_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein At5g23170 | 42.400% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q75J39 | 水稻 | sp|Q75J39|CKI4_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase-like protein CR4 | 43.600% | Swiss-Prot | 中等置信 |