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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G087770
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 22738208-22746789 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4130 bp · TkA08G087770|TK1151|cDNA

CTCTATAGTCTGTATCCAGCCACATCAGTGCCCTCGCCTAAACCTGCACTTCCTACTTCTTTCCGCATCGCAACCATCCTACCCCCACTCCGTTCTTCATTATAAATACCACATAAACACTCAAAAGCCCTTAAACAAATAATTTTCCCCTTTCAATCATTACATTTTCTACAGGATAATACGTAGAAATTAGAGATTTAAAATACACCATTTCATCAATTCTCTGTAACAATCGTCTGCGAAACCAACTCCGAACCCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

3582 bp · TkA08G087770|TK1151|CDS

ATGGTTGAAACAAGGCGCACCTCCTCTTCTTCCAAACGCACACTCTCGTCACCATGTTCTTCTCCACAGTCAGGCAAAAGATCTAAGGCTGCAGAAGCGGCATCGTCATCTACTACAGGCTTACCTGAACAGCCAATTGATGCGGAGGTGAAGAAATCAGGTGCGTGCGAGTCTCAAGAGCAAGAGTTCGGATCGGCTGATCTTTCTAAGAAAGAGATCGATGGTTGTGGTGACGTTGTGGTTGCTGATGCTCTAGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1193 aa · TkA08G087770|TK1151|PROTEIN

MVETRRTSSSSKRTLSSPCSSPQSGKRSKAAEAASSSTTGLPEQPIDAEVKKSGACESQEQEFGSADLSKKEIDGCGDVVVADALDEKCPVIQVNGEPLVSPMSLGDSLIEVETTKANGGSAVLNIPKKRQSKPNVGVAWGKLLSQSSQIPHVVMDRSLFTVGQSHQCDLCIGDPSISKSLCTIRFIESERGGSSITLLEITGGKGVVKVNGKIYPSKSTVPLKAGDEVIFSSSRGHAYIFQRLLNDTNVTPSLSLLKAH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G087770
TK1151 IDTkA08G087770
OH-1004 IDLXL04_018882
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G087770
位置Chr08:22738208-22746789 (+)
描述Similar to atad1a: ATPase family AAA domain-containing protein 1-A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018882 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002092 positive regulation of receptor internalization 生物过程
GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程
GO:0009653 anatomical structure morphogenesis 生物过程
GO:0034214 protein hexamerization 生物过程
GO:0045047 protein targeting to ER 生物过程
GO:0140570 extraction of mislocalized protein from mitochondrial outer membrane 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0140567 membrane protein dislocase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
bta:506045
mmu:67979
rno:309532
sce:YGR028W
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.572
排名 1 · TkA08G087770 · TK1151
细胞质0.329
排名 2 · TkA08G087770 · TK1151
细胞膜0.096
排名 3 · TkA08G087770 · TK1151
内质网0.059
排名 4 · TkA08G087770 · TK1151
质体0.042
排名 5 · TkA08G087770 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24883NPHP3_N79-87 aa
PF16697Yop-YscD_cpl159-226 aa
PF00498FHA161-231 aa
PF13401AAA_22403-459 aa
PF13481AAA_25442-480 aa
PF18129SH3_12568-613 aa
PF00004AAA614-662 aa
PF13173AAA_14636-692 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G087770PF24883NPHP3_N79870.1612.9
TkA08G087770PF16697Yop-YscD_cpl1592260.1213.5
TkA08G087770PF00498FHA1612313.7e-0524.8
TkA08G087770PF13401AAA_224034590.0004421.3
TkA08G087770PF13481AAA_254424800.008916.4
TkA08G087770PF18129SH3_125686130.0007820.1
TkA08G087770PF00004AAA6146622.9e-40138.5
TkA08G087770PF13173AAA_146366920.0003221.4
TkA08G087770PF07724AAA_26446570.02515.3
TkA08G087770PF13479AAA_246696950.02814.8
TkA08G087770PF01057Parvo_NS17377870.4810.1
TkA08G087770PF24933DUF77517908493e-2279.5
TkA08G087770PF13173AAA_148679080.0003221.4
TkA08G087770PF02367TsaE9229530.2412.1
TkA08G087770PF12775AAA_79239640.03414.4
TkA08G087770PF05673DUF8159249540.2111.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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