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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G078060
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 20029004-20034902 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3765 bp · TkA08G078060|TK1151|cDNA

CTTCATTAGAAAGGAATATTTTTAGCCGATTTACATGAATCAAACGTTTAAAATAAACCTATCCAAAGTTTATGAACCAGAAAAATATAAAACATAGTTATCACATTGAAAATTAACAAATAATCCGAGTATTGAATTCAAAAAGCGAACAATTCGAAGTACAGCGCCCCCAAAAAAGAGGGTTTAGATCCAGCTTAGCTTTGATGGCCTCCACTTGTCTCCGCCATTAACAATTCTCCTCTTAATTTGCAATTCAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

2793 bp · TkA08G078060|TK1151|CDS

ATGACAACTGAGATTCCATGCTCTTCTGGTCAATGGCTTAAGCAAGAACCACCACATTCAGTTCTCAAAGATGGAGTGTTGGCTGGGAAGACTTCAAAGAACAACATATCCATACGAACAGGTGAGGAGTTCTCCATGGAATTTCTTCAAGATCGTGGTATAGTAAATCAAGTACATAATGGACATAGTAACGTCTTATCAAACGGTAATGGAAATGGAAACCGTCATTTAGGTTATGAAGAACTTAGTGTTATGCTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

930 aa · TkA08G078060|TK1151|PROTEIN

MTTEIPCSSGQWLKQEPPHSVLKDGVLAGKTSKNNISIRTGEEFSMEFLQDRGIVNQVHNGHSNVLSNGNGNGNRHLGYEELSVMLGLQRVDSVCSSENTSVKGSLSRPNAPSAIDPVPSLAHKPSDDSQSGKIKFICSSGGKILPRPSDGKLRYVGGETRIVSIQKNITWQELVKRTSEYCNQPHTIKYQLPGEDLDALISVSSNEDLQNMIEEYNGLGNLDGSQRLRIFLIPLSEIESSCSIESNGNQQQNPDYQYVV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G078060
TK1151 IDTkA08G078060
OH-1004 IDLXL04_018692
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G078060
位置Chr08:20029004-20034902 (+)
描述Similar to SIS8: Probable serine/threonine-protein kinase SIS8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g79570 类 RAF 蛋白激酶，与 RAF24 一起作为生长素快速反应通路的中央介质，该通路涉及蛋白质磷酸化，并导致快速的细胞反应，包括膜去极化和细胞质流动。 暂无已核实直接文献
At2g35050 类 RAF 蛋白激酶，与 RAF20 一起作用，作为生长素快速反应途径的核心介质，涉及蛋白质磷酸化，并导致包括膜去极化和胞质流动在内的快速细胞反应。 暂无已核实直接文献
At1g73660 作为耐盐负调节剂。
The genetic locus At1g73660 encodes a putative MAPKKK and negatively regulates salt tolerance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9306-8
SIS8, a putative mitogen-activated protein kinase kinase kinase, regulates sugar-resistant seedling development in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12404
At2g17700 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018692 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010928 regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0071365 cellular response to auxin stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G79570
ath:AT2G35050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.503
排名 1 · TkA08G078060 · TK1151
细胞膜0.399
排名 2 · TkA08G078060 · TK1151
细胞核0.287
排名 3 · TkA08G078060 · TK1151
高尔基体0.051
排名 4 · TkA08G078060 · TK1151
内质网0.040
排名 5 · TkA08G078060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08300HCV_NS5a_1a132-160 aa
PF26130PB1-like133-214 aa
PF00564PB1150-232 aa
PF26130PB1-like453-473 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr456-498 aa
PF27616DUF8351538-592 aa
PF00069Pkinase648-908 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr649-910 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G078060PF08300HCV_NS5a_1a1321600.1812.7
TkA08G078060PF26130PB1-like1332140.05414.5
TkA08G078060PF00564PB11502322.2e-2176.3
TkA08G078060PF26130PB1-like4534730.05414.5
TkA08G078060PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4564981e-65222.3
TkA08G078060PF27616DUF83515385920.1812.4
TkA08G078060PF00069Pkinase6489081.8e-48166.0
TkA08G078060PF07714PK_Tyr_Ser-Thr6499101e-65222.3
TkA08G078060PF08300HCV_NS5a_1a6626720.1812.7
TkA08G078060PF08300HCV_NS5a_1a8588850.1812.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SAJ2拟南芥sp|Q9SAJ2|RAF20_ARATH RAF-like serine/threonine-protein kinase 2036.200%Swiss-Prot中等置信
O64768拟南芥sp|O64768|RAF24_ARATH RAF-like serine/threonine-protein kinase 2478.000%Swiss-Prot低置信
Q9C9U5拟南芥sp|Q9C9U5|SIS8_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase SIS840.900%Swiss-Prot低置信
O22558拟南芥sp|O22558|STY8_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY837.600%Swiss-Prot低置信

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