TkA08G065590 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G065590

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 16826673-16828296 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1033 bp · TkA08G065590|TK1151|cDNA

TTAAACTATAGTCAACGGCCAACAACTAGGGATATTATATATATACACACCGTCACTGAAACAATTAAGAGTACTGTAATCCCCAAATTCAAGTCGAGAATACGTCTTGCTGTTTCAATCAAATAATCGATCGGAAGATGGCGGAAGATCTGAAGCTGTATGGCGCCGGAGGAAGTCCATTCGTTTGCAGAGTGAAAATCGTGTTGAATATGAAGGGAATCAAGTACGAAAACATCGAAGAAGATCTCGCCAACAAGAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

654 bp · TkA08G065590|TK1151|CDS

ATGGCGGAAGATCTGAAGCTGTATGGCGCCGGAGGAAGTCCATTCGTTTGCAGAGTGAAAATCGTGTTGAATATGAAGGGAATCAAGTACGAAAACATCGAAGAAGATCTCGCCAACAAGAGTGCCGATCTTTTGAAGTATAATCCAATTCATAAGAAAGTTCCGGTGTTGGTGCATAACGGAAAACCGATCTGCGAATCTCTCGTGATCGTCGAGTACATCGATGATGTGTGGAAAGAGGTTCCGATTTTACCTCAAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

217 aa · TkA08G065590|TK1151|PROTEIN

MAEDLKLYGAGGSPFVCRVKIVLNMKGIKYENIEEDLANKSADLLKYNPIHKKVPVLVHNGKPICESLVIVEYIDDVWKEVPILPQDPYQRALDRFWAKFIDDKCNAAAFKVFGSNGDEQVVTEACEQLQVLENELKVKGTKFFGGDNINLVDISGTFIAYWLGLFEEATEITFFTKEKFPLLTKWSEDFVKCELVKEFLPPRDNMVAFFKKMFGKA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G065590`
TK1151 ID	TkA08G065590
OH-1004 ID	LXL04_018509
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 94.931 / OH-1004 35.826 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G065590

位置 Chr08:16826673-16828296 (-)

描述 Similar to HSP26-A: Probable glutathione S-transferase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g09270`	可能参与将还原型谷胱甘肽结合到大量外源性和内源性疏水性电亲分子上，并在对某些除草剂的解毒中起作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018509 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程

GO:0009407 toxin catabolic process 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0009735 response to cytokinin 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009739 response to gibberellin 生物过程

GO:0010038 response to metal ion 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004364 glutathione transferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G09270

gmx:100527851

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.817

排名 1 · TkA08G065590 · TK1151

细胞核0.174

排名 2 · TkA08G065590 · TK1151

内质网0.077

排名 3 · TkA08G065590 · TK1151

线粒体0.069

排名 4 · TkA08G065590 · TK1151

细胞膜0.050

排名 5 · TkA08G065590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02798GST_N4-75 aa

PF13417GST_N_37-76 aa

PF22441CLIC-like_N11-77 aa

PF13409GST_N_213-76 aa

PF17172GST_N_414-106 aa

PF13409GST_N_2118-134 aa

PF00043GST_C120-191 aa

PF25907DUF7962120-192 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G065590	`PF02798`	GST_N	4	75	4e-22	79.0
TkA08G065590	`PF13417`	GST_N_3	7	76	7.9e-18	65.3
TkA08G065590	`PF22441`	CLIC-like_N	11	77	0.0001	23.1
TkA08G065590	`PF13409`	GST_N_2	13	76	4.7e-15	56.7
TkA08G065590	`PF17172`	GST_N_4	14	106	0.0011	20.3
TkA08G065590	`PF13409`	GST_N_2	118	134	4.7e-15	56.7
TkA08G065590	`PF00043`	GST_C	120	191	2.2e-09	38.2
TkA08G065590	`PF25907`	DUF7962	120	192	0.00066	20.5
TkA08G065590	`PF14497`	GST_C_3	127	200	0.05	14.5
TkA08G065590	`PF13410`	GST_C_2	128	188	0.23	12.3
TkA08G065590	`PF17172`	GST_N_4	167	180	0.0011	20.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SR36`	拟南芥	sp\|Q9SR36\|GSTU8_ARATH Glutathione S-transferase U8	56.700%	Swiss-Prot	高置信

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