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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G065250
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 16683020-16689926 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4946 bp · TkA08G065250|TK1151|cDNA

GGTAAGTATACTCATGTGGTTCATAGCGAGCTCGACTTTCCACATATAAAACCCCTTTCCTTATTCACACTTATACTCATCTCCCAACAACAAATCGAAAACGCACACAGAAAGCAAGAACGATGGCGAGCAGCAAACCAACGGAAATCGGCAGCTCAAAAATATTTGAAGGTTTCAACAAACGATACAAGCATGACTCACCGACCCTCGGTTGCTCCATGAACTTCCACATCTATTTCCCTCCCTCAACTTCTCCTGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3066 bp · TkA08G065250|TK1151|CDS

ATGAGCTCTCACGTCCGAAGTGATACAAGAGATAATAGGCCTAGGTTTCCTCGTCGTCAAGAATGGATTCCCAGAGGATCCTCCACTGCCACGACCACCACCAGTACCACTGCAGTGGATGCTAATTCCTCGCCAGCAGTTGCTCCAATTCCAGATGGAAATGGTAATATTAGATCACAAAATGGTGTTAATAGAGGAAATCAAAGGAGGCACCATATACCTCGACAAAATCAGACTAGAGATAGGAGAAAAGATGCTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1021 aa · TkA08G065250|TK1151|PROTEIN

MSSHVRSDTRDNRPRFPRRQEWIPRGSSTATTTTSTTAVDANSSPAVAPIPDGNGNIRSQNGVNRGNQRRHHIPRQNQTRDRRKDAPREERVSTGALPQLVQEIQDKLLKGTIECMICYDMVRRSAPVWSCSSCFSIFHLHCIKKWARAPTSIDLSAEKNQGFNWRCPGCQSVQLTSSKDIRYVCFCGKRQEPPSDPYLTPHSCGEPCGRPLEKEVPGSGSGSGSHSRDDLCPHRCVLQCHPGPCPPCKAFAPPRLCPCG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G065250
TK1151 IDTkA08G065250
OH-1004 IDLXL04_012237
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)35.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 50.441 / OH-1004 61.682
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G065250
位置Chr08:16683020-16689926 (-)
描述Similar to NFXL2: NF-X1-type zinc finger protein NFXL2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g10170 介导依赖E2的泛素化（相似性预测）。
The AtNFXL1 gene encodes a NF-X1 type zinc finger protein required for growth under salt stress.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.07.079
AtNFXL1, an Arabidopsis homologue of the human transcription factor NF-X1, functions as a negative regulator of the trichothecene phytotoxin-induced defense response.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03353.x
The AtNFXL1 gene functions as a signaling component of the type A trichothecene-dependent response.2008 · DOI: 10.4161/psb.6291
At2g41530 丝氨酸水解酶，催化S-甲酰谷胱甘肽水解为谷胱甘肽和甲酸（可能）。
Cloning and characterization of an S-formylglutathione hydrolase from Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1006/abbi.2002.2772
Unique regulation of the active site of the serine esterase S-formylglutathione hydrolase.2006 · DOI: 10.1016/j.jmb.2006.03.048

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012237 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010310 regulation of hydrogen peroxide metabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0051865 protein autoubiquitination 生物过程
GO:0160062 cutin-based cuticle development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G05660
dme:Dmel_CG3647
hsa:152518
xla:779353
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.775
排名 1 · TkA08G065250 · TK1151
细胞质0.299
排名 2 · TkA08G065250 · TK1151
线粒体0.036
排名 3 · TkA08G065250 · TK1151
细胞膜0.031
排名 4 · TkA08G065250 · TK1151
内质网0.018
排名 5 · TkA08G065250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01422zf-NF-X1202-208 aa
PF01422zf-NF-X1234-249 aa
PF01422zf-NF-X1289-304 aa
PF01422zf-NF-X1353-370 aa
PF01422zf-NF-X1400-405 aa
PF01422zf-NF-X1411-429 aa
PF01422zf-NF-X1455-460 aa
PF01422zf-NF-X1466-477 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G065250PF01422zf-NF-X12022081.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X12342491.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X12893041.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X13533701.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X14004051.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X14114291.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X14554601.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X14664771.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X14934991.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X15055231.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X15525561.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X15625791.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X16046091.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X16156301.1e-0629.2
TkA08G065250PF01422zf-NF-X16576661.1e-0629.2
TkA08G065250PF01424R3H8028450.01516.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SY59拟南芥sp|Q9SY59|NFXL1_ARATH NF-X1-type zinc finger protein NFXL164.600%Swiss-Prot高置信
Q8LAS8拟南芥sp|Q8LAS8|SFGH_ARATH S-formylglutathione hydrolase80.200%Swiss-Prot高置信

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