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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G061390
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 15729067-15733425 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3343 bp · TkA08G061390|TK1151|cDNA

GATTCAACGTCCATGATCTGTCGGCTCCTTACAACGGACCCTACAGATTCGAATTCAAACCAGGACTAACGGTCATCTCTGCAACTTAATTGAAAACTCCACATTCCCATGGTTCTTCTGCCAAGAAGATACACATATTGAACCCACTATTCACTTCACTCACTAATCCTTCTCTCTCGATTTTAGGGTTTTCACTTTCCTCTCTCTACTTTCAGTACAAAATTGTCGTTGACGTAGAAAACCCTTTTTTCTCGACGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2724 bp · TkA08G061390|TK1151|CDS

ATGGAGGTGATTGCGTCAAGAACAAGTCATGATTTTAATTTGGCTTCAAGAAAAGCCCAAGAAGCTGTTTGGAGGAGGTATCAAGCTACCGAATGGCTTGAGAGTTTCGTGGGTTCATTAGGTATATCAAAGCAGCCATCGGAGAAGGAGTTCATTTCTTGCTTGAGAAATGGATTGATTCTCTGCAACGCCATTAACAAAATTCAACCTGGGTCTGTCCCAAAGGTGGTGGAGATTACTCGGTTTCATTCCCAACCGCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

907 aa · TkA08G061390|TK1151|PROTEIN

MEVIASRTSHDFNLASRKAQEAVWRRYQATEWLESFVGSLGISKQPSEKEFISCLRNGLILCNAINKIQPGSVPKVVEITRFHSQPHTWDSQPLPAYQFFENVRNFLKAVEGLNLPVFEASVFERDNLEAGSSTKIVDCVLGLKDYTERKNGSSKRTMRSPLMHSSSKIPRSGLNLDPNRQLDLSTNREKQSPSQNDAKKLEDLLLKALDDCMIDAKENLDGNLLSSIRNGNMDSIKSLSRILSSTLQEQLQLKLNPNLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G061390
TK1151 IDTkA08G061390
OH-1004 IDLXL04_018914
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)47.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 78.390 / OH-1004 74.227
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G061390
位置Chr08:15729067-15733425 (+)
描述Similar to KIN14I: Kinesin-like protein KIN-14I
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g10310 类动力蛋白 KIN-14L。 暂无已核实直接文献
At5g27000 微管结合运动蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0243100 类动力蛋白蛋白KIN-14A。 暂无已核实直接文献
Os11g0672400 类动力蛋白 KIN-14P。 暂无已核实直接文献
Os12g0547500 沿着微管运输肌动蛋白丝的负端定向运动蛋白。
Dynamic bridges--a calponin-domain kinesin from rice links actin filaments and microtubules in both cycling and non-cycling cells.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp094
A kinesin with calponin-homology domain is involved in premitotic nuclear migration.2010 · DOI: 10.1093/jxb/erq164
The non-processive rice kinesin-14 OsKCH1 transports actin filaments along microtubules with two distinct velocities.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.111
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018914 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007097 nuclear migration 生物过程
GO:0031534 minus-end directed microtubule sliding 生物过程
GO:0051647 nucleus localization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0015629 actin cytoskeleton 细胞组分
GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0003779 actin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G47500
ath:AT5G27000
dosa:Os03g0301800
dosa:Os12g0547500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.708
排名 1 · TkA08G061390 · TK1151
细胞核0.288
排名 2 · TkA08G061390 · TK1151
细胞膜0.109
排名 3 · TkA08G061390 · TK1151
高尔基体0.044
排名 4 · TkA08G061390 · TK1151
线粒体0.041
排名 5 · TkA08G061390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00307CH26-144 aa
PF27821CEP162_helical_3184-204 aa
PF15035Rootletin252-335 aa
PF10368YkyA295-360 aa
PF25764KIF21A_4th296-366 aa
PF07926TPR_MLP1_2305-348 aa
PF14197Cep57_CLD_2321-337 aa
PF27821CEP162_helical_3325-334 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G061390PF00307CH261441.2e-1042.3
TkA08G061390PF27821CEP162_helical_31842046.17.8
TkA08G061390PF15035Rootletin2523350.1313.0
TkA08G061390PF10368YkyA2953602.08.8
TkA08G061390PF25764KIF21A_4th2963660.4610.8
TkA08G061390PF07926TPR_MLP1_23053482.29.0
TkA08G061390PF14197Cep57_CLD_23213371.69.6
TkA08G061390PF27821CEP162_helical_33253346.17.8
TkA08G061390PF29809YycH_C3373830.1112.5
TkA08G061390PF16796Microtub_bd3495082e-41142.2
TkA08G061390PF00225Kinesin3976894.3e-106355.3
TkA08G061390PF29809YycH_C4755170.1112.5
TkA08G061390PF27821CEP162_helical_36927216.17.8
TkA08G061390PF15035Rootletin6947200.1313.0
TkA08G061390PF07926TPR_MLP1_26947322.29.0
TkA08G061390PF14197Cep57_CLD_26957211.69.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4J2M6拟南芥sp|F4J2M6|KN14L_ARATH Kinesin-like protein KIN-14L53.800%Swiss-Prot高置信
O81635拟南芥sp|O81635|KN14G_ARATH Kinesin-like protein KIN-14G46.300%Swiss-Prot中等置信
B9EUM5水稻sp|B9EUM5|KN14A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14A47.300%Swiss-Prot中等置信
B9G8P1水稻sp|B9G8P1|KN14P_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14P46.700%Swiss-Prot中等置信
Q0IMS9水稻sp|Q0IMS9|KN14Q_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14Q48.400%Swiss-Prot中等置信

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