RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G059040
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 15122965-15126161 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2976 bp · TkA08G059040|TK1151|cDNA

AGCTTTTCACGGGTACATATAACATACTCCATACAAAAAGACAAACCCCCTAAATTACTATATGTCACTCTCACTTCACGGATTCACCTTCTTCACCATATCTCCCCCTTTCTCTCTGTTACTTCTCCAATGGCGTCTCACTGTCCACTCTCACTCTCACTCACATTCCTCCTACTCTTCACCATTAATGCTTCATCATCACCTTCGCCATCAACTTCATCAGAAGCCGACATTCTTTTGACCTTCAAATCCGCCATTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2778 bp · TkA08G059040|TK1151|CDS

AGCTTTTCACGGGTACATATAACATACTCCATACAAAAAGACAAACCCCCTAAATTACTATATGTCACTCTCACTTCACGGATTCACCTTCTTCACCATATCTCCCCCTTTCTCTCTGTTACTTCTCCAATGGCGTCTCACTGTCCACTCTCACTCTCACTCACATTCCTCCTACTCTTCACCATTAATGCTTCATCATCACCTTCGCCATCAACTTCATCAGAAGCCGACATTCTTTTGACCTTCAAATCCGCCATTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

925 aa · TkA08G059040|TK1151|PROTEIN

SFSRVHITYSIQKDKPPKLLYVTLTSRIHLLHHISPFLSVTSPMASHCPLSLSLTFLLLFTINASSSPSPSTSSEADILLTFKSAINDPMNYLASWSNTTITHHCNWTGVVCTSTTTAAAAVSSLILQNFNLSGEISPSVCQLANLVTLNLADNFFNQPIPLHISQCSSLNTLNLSSNLIWGTIPDQISQFKSLKFLDLSKNHVEGRIPDGVGSLLNLQVLNFGNNLLSGSVPTVIGNFTELIVLDLSLNPFMESEIPSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G059040
TK1151 IDTkA08G059040
OH-1004 IDLXL04_018416
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.757
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G059040
位置Chr08:15122965-15126161 (-)
描述Similar to At5g06940: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g06940
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06940 可能失活的富含亮氨酸重复结构受体样蛋白激酶 At5g06940。 暂无已核实直接文献
At5g49660 受体激酶参与 C 末端编码的植物信号肽 的感知以及根和芽发育的后续调节。
XYLEM INTERMIXED WITH PHLOEM1, a leucine-rich repeat receptor-like kinase required for stem growth and vascular development in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1489-6
CEP5 and XIP1/CEPR1 regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw231
At5g65700 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶，与CLV1和BAM3共同感知CLAVATA类肽CLE25、CLE26和CLE45，经CIK及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化传递信号，调控原生韧皮部分化和分生组织维持。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At3g49670 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018416 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0045490 pectin catabolic process 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050829 defense response to Gram-negative bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28440
ath:AT4G28490
ath:AT4G28650
ath:AT5G06940
ath:AT5G65710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.867
排名 1 · TkA08G059040 · TK1151
内质网0.089
排名 2 · TkA08G059040 · TK1151
细胞质0.062
排名 3 · TkA08G059040 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA08G059040 · TK1151
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · TkA08G059040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_274-113 aa
PF29594LRR_SKP2114-275 aa
PF25013LRR_Zer-1118-152 aa
PF13855LRR_8123-180 aa
PF00560LRR_1124-143 aa
PF12799LRR_4124-156 aa
PF23598LRR_14139-249 aa
PF23952LRR_EndoS143-202 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G059040PF08263LRRNT_2741134.6e-1246.7
TkA08G059040PF29594LRR_SKP21142750.004517.0
TkA08G059040PF25013LRR_Zer-11181521.7e-0835.4
TkA08G059040PF13855LRR_81231801.8e-2176.4
TkA08G059040PF00560LRR_11241432.9e-32104.4
TkA08G059040PF12799LRR_41241561.9e-2176.3
TkA08G059040PF23598LRR_141392495.9e-1968.7
TkA08G059040PF23952LRR_EndoS1432020.0614.3
TkA08G059040PF24758LRR_At5g563701442050.002718.1
TkA08G059040PF13516LRR_61441540.3811.6
TkA08G059040PF00560LRR_11451672.9e-32104.4
TkA08G059040PF13855LRR_81452031.8e-2176.4
TkA08G059040PF24048LRR_NXF1-51622050.0001222.4
TkA08G059040PF25013LRR_Zer-11652051.7e-0835.4
TkA08G059040PF13516LRR_61661780.3811.6
TkA08G059040PF29247LRR_MHP1-HER1-GIP31682030.03713.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FL51拟南芥sp|Q9FL51|Y5694_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g0694052.700%Swiss-Prot低置信
Q9FGL5拟南芥sp|Q9FGL5|CEPR1_ARATH Receptor protein-tyrosine kinase CEPR135.600%Swiss-Prot低置信
O49545拟南芥sp|O49545|BAME1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM136.000%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393036.400%Swiss-Prot低置信
Q9M2Z1拟南芥sp|Q9M2Z1|BAME2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM235.100%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看