TkA08G058710 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G058710

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 15008264-15010525 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1719 bp · TkA08G058710|TK1151|cDNA

ATGTCCCAATTGAAAGAATCGGAACACCTTAAAATACCATTCAAAGAGATAGAATCAGCAACCAACAACTTCCAAACTTGTATCGGAAAAGGTGGATACGGTCGGGTGTACAGAGGAGAGCTTCCCATATCCGGAACCCTCACCACAGTCGCTGTAAAACGCCTCTACGAGCAATTCGGACAAGGATCCAAGGATATATTTGACCTGAGAGTCTCAGGTCAAAAACACCCAAATCTGATCTCGCTTCTTGGTTATTGCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1605 bp · TkA08G058710|TK1151|CDS

ATGTCCCAATTGAAAGAATCGGAACACCTTAAAATACCATTCAAAGAGATAGAATCAGCAACCAACAACTTCCAAACTTGTATCGGAAAAGGTGGATACGGTCGGGTGTACAGAGGAGAGCTTCCCATATCCGGAACCCTCACCACAGTCGCTGTAAAACGCCTCTACGAGCAATTCGGACAAGGATCCAAGGATATATTTGACCTGAGAGTCTCAGGTCAAAAACACCCAAATCTGATCTCGCTTCTTGGTTATTGCGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

534 aa · TkA08G058710|TK1151|PROTEIN

MSQLKESEHLKIPFKEIESATNNFQTCIGKGGYGRVYRGELPISGTLTTVAVKRLYEQFGQGSKDIFDLRVSGQKHPNLISLLGYCEEGNEKIIVYEFVERGSLDKYIKHPDLTWPERLKICVHIARGLEHLHNHVGKHQTIIHRDIKSANILVDQNWVAKISDLGLSKLTLSGLNRSAIISHACGTPGYCEPEYITTGIVKKESDVYSFGVVLLEILCGRLCTIRDGHGLLLLDYYKMKKLEEIIDPSLRKQMSSYSMN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G058710`
TK1151 ID	TkA08G058710
OH-1004 ID	LXL04_018398
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 55.431 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G058710

位置 Chr08:15008264-15010525 (+)

描述 Similar to At1g05150: Uncharacterized TPR repeat-containing protein At1g05150

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g38990`	可能的受体样蛋白激酶At5g38990。	暂无已核实直接文献
`At5g39000`	推测的受体样蛋白激酶At5g39000。	暂无已核实直接文献
`At2g23200`	可能的受体样蛋白激酶At2g23200。	暂无已核实直接文献
`At1g01540`	可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。	暂无已核实直接文献
`At5g18500`	可能的受体样蛋白激酶At5g18500。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018398 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005768 endosome 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0005509 calcium ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G05150

ath:AT2G32450

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.543

排名 1 · TkA08G058710 · TK1151

内质网0.172

排名 2 · TkA08G058710 · TK1151

细胞质0.166

排名 3 · TkA08G058710 · TK1151

细胞核0.130

排名 4 · TkA08G058710 · TK1151

高尔基体0.073

排名 5 · TkA08G058710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr24-287 aa

PF00069Pkinase26-285 aa

PF03109ABC127-59 aa

PF03109ABC190-168 aa

PF01636APH128-159 aa

PF00036EF-hand_1335-357 aa

PF13405EF-hand_6335-357 aa

PF13499EF-hand_7335-357 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G058710	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	24	287	7.9e-39	134.2
TkA08G058710	`PF00069`	Pkinase	26	285	8.7e-37	127.7
TkA08G058710	`PF03109`	ABC1	27	59	0.11	12.3
TkA08G058710	`PF03109`	ABC1	90	168	0.11	12.3
TkA08G058710	`PF01636`	APH	128	159	0.05	14.1
TkA08G058710	`PF00036`	EF-hand_1	335	357	0.00012	22.1
TkA08G058710	`PF13405`	EF-hand_6	335	357	0.00017	21.8
TkA08G058710	`PF13499`	EF-hand_7	335	357	0.015	16.4
TkA08G058710	`PF13202`	EF-hand_5	336	357	4.2e-05	23.6
TkA08G058710	`PF13833`	EF-hand_8	336	358	0.073	13.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FID9`	拟南芥	sp\|Q9FID9\|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g38990	43.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FID8`	拟南芥	sp\|Q9FID8\|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g39000	42.300%	Swiss-Prot	中等置信
`O22187`	拟南芥	sp\|O22187\|Y2232_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g23200	42.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q3EDL4`	拟南芥	sp\|Q3EDL4\|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g01540	39.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8LEB6`	拟南芥	sp\|Q8LEB6\|Y5185_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g18500	39.100%	Swiss-Prot	中等置信

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