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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G045100
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 11488558-11491228 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1945 bp · TkA08G045100|TK1151|cDNA

CTGCAACATGTGGAGAGTATGAGTTGGAGAGAGGAATCTCTGGATTACAGAGATATCACTCTTGTTTTTATCCCATCATCACTCATTTCTCCTCAACACCTCTCTCATTAATCATTCATTTTTATGAAAATGACAAAAACCCTTTTCATTCTGCTAACACTTTATACTTTCGGAGAAAGAAACCTTTTCATGAGTTCTTATCAAAGGGAGAGAAAGAGGTAAAAACACAACATTGAACAATCTCCCTTCGTTACTCAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1497 bp · TkA08G045100|TK1151|CDS

ATGGGAGCTTGTTGTTCTTGTTTTTCGTTCTCGTTGTGTCGATGTTGTTGTTTCAAATCCAAGCACCCTCGTTCCTCCGATCTAGAGAACCGCGGTGGTGACGATGACAAGCTAAAGTGGCCGTGTTTTCGGGAGTACAAACTAGACGAGCTTAAAACTGCAACCGGTGGGTTTTCCATCGAGAATGTGGTGTCGGAGCACGGCGAGAAGGCCCCCAACGTCGTCTACAAAGGAAAACTCCCGGACAGCGACTCTCTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

498 aa · TkA08G045100|TK1151|PROTEIN

MGACCSCFSFSLCRCCCFKSKHPRSSDLENRGGDDDKLKWPCFREYKLDELKTATGGFSIENVVSEHGEKAPNVVYKGKLPDSDSLIAVKRFNKSAWPDTRQFLDEAKAVGQLRSHRLANLLGCCYEGDERLLIAEFMPNETLSKHLFHWENQPLKWSMRLRVALYLAQALEYCSIKGRSLYHDLNAYRVLFDQDCNPRLSCFGLMKNSRDGKSYSTNLAFTPPEYMKTGRINAESVIYSFGTILLDLLSGKHIPPSHAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G045100
TK1151 IDTkA08G045100
OH-1004 IDLXL04_017860
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.598 / OH-1004 97.093
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G045100
位置Chr08:11488558-11491228 (-)
描述Similar to BSK5: Serine/threonine-protein kinase BSK5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g59010 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
A mutation in Arabidopsis BSK5 encoding a brassinosteroid-signaling kinase protein affects responses to salinity and abscisic acid.2012 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.08.118
At3g54030 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 (BR) 信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献
At1g63500 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 (BR) 信号传导的正调节因子。 暂无已核实直接文献
At5g41260 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为受体激酶 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175
A kinase-phosphatase signaling module with BSK8 and BSL2 involved in regulation of sucrose-phosphate synthase.2014 · DOI: 10.1021/pr5003164

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0684200 可能的丝氨酸/苏氨酸激酶，作为 BRI1 下游油菜素甾醇 信号传导的正调节因子。
OsBRI1 Activates BR Signaling by Preventing Binding between the TPR and Kinase Domains of OsBSK3 via Phosphorylation.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01668
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017860 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63500
ath:AT3G54030
ath:AT5G41260
ath:AT5G59010
dosa:Os04g0684200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.627
排名 1 · TkA08G045100 · TK1151
细胞质0.236
排名 2 · TkA08G045100 · TK1151
细胞核0.213
排名 3 · TkA08G045100 · TK1151
内质网0.051
排名 4 · TkA08G045100 · TK1151
高尔基体0.035
排名 5 · TkA08G045100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr74-312 aa
PF00069Pkinase74-311 aa
PF07719TPR_2120-127 aa
PF00515TPR_1168-174 aa
PF01921tRNA-synt_1f326-384 aa
PF25575TPR_BSK1_C352-469 aa
PF07719TPR_2399-418 aa
PF29407CFAP70_TPR_C399-473 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G045100PF07714PK_Tyr_Ser-Thr743122.8e-2589.8
TkA08G045100PF00069Pkinase743111.8e-2177.5
TkA08G045100PF07719TPR_21201270.03515.0
TkA08G045100PF00515TPR_11681740.2212.1
TkA08G045100PF01921tRNA-synt_1f3263840.2411.0
TkA08G045100PF25575TPR_BSK1_C3524696.1e-61204.2
TkA08G045100PF07719TPR_23994180.03515.0
TkA08G045100PF29407CFAP70_TPR_C3994730.0513.8
TkA08G045100PF13174TPR_63994220.2213.0
TkA08G045100PF00515TPR_13994170.2212.1
TkA08G045100PF03041Baculo_LEF-24054490.02914.9
TkA08G045100PF07719TPR_24304590.03515.0
TkA08G045100PF00515TPR_14304500.2212.1
TkA08G045100PF13174TPR_64384480.2213.0
TkA08G045100PF07719TPR_24644830.03515.0
TkA08G045100PF13174TPR_64644860.2213.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIL1拟南芥sp|Q9FIL1|BSK5_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK572.900%Swiss-Prot高置信
Q9M324拟南芥sp|Q9M324|BSK6_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK670.100%Swiss-Prot高置信
F4I3M3拟南芥sp|F4I3M3|BSK7_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK768.600%Swiss-Prot高置信
Q9FHD7拟南芥sp|Q9FHD7|BSK8_ARATH Serine/threonine-protein kinase BSK869.200%Swiss-Prot高置信
B9FDE0水稻sp|B9FDE0|BSK3_ORYSJ Probable serine/threonine-protein kinase BSK371.900%Swiss-Prot高置信

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