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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G044290
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 11287700-11291977 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3259 bp · TkA08G044290|TK1151|cDNA

CAAAGATATAATTTAAAGAATCAATTGTGGAATCGTGGTGTGCAAAATGTAGCCTCAGATACTCGTGCAAAATGTAGCCTGACACGATGCATTTGAGAATTGTTTAATTACAAATTTATTTTAGGGAATCAAATTGAGCAAAATTTTATCTATATTGTCCGATGTTTACAAAAACACGAAGGAAAAACGAAGGCAGAAACTTCAATGGTCCACAAATCTTCTTCAACCTCCATCCTCTCTCTCTCCCTCTGAGATAATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2220 bp · TkA08G044290|TK1151|CDS

ATGGCAGCTATTGAAACGCTTCGACCTATAATTCACGGTCAAATCCATGTAAACTCTTCGAATTACAATTCAAAACATTCATACAGGCACACTTCTTTCGTAGATAGATTCCATGTCCTACATAATAAGTCGAATGTTCTTGTAACCAAATCGTCATTATCCATTCGTCCAGCCACCAATTTGTACAGAGAATCTAGGGTTTTCAATTTAAATTCATGGTGTGGAGGGTCAGGGTTTCTGAAGATGAATCAAAACTGTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

739 aa · TkA08G044290|TK1151|PROTEIN

MAAIETLRPIIHGQIHVNSSNYNSKHSYRHTSFVDRFHVLHNKSNVLVTKSSLSIRPATNLYRESRVFNLNSWCGGSGFLKMNQNCRRRNKLGVNNTSCEHDTESSGQKSESDSNKVSKKREKGDKKGKGGGWGWGKGGGKWTWQPIIQAQEIGVLLLQLGIVMFVMRLLRPGLPLPGSEPRVPTAFVSVPYSDFLTKVSTNQVQKVEVDGVHIMFKLKQEQGTPESDITSSLNKMQDSELLLRTVAPTKRIVYTTTRPN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G044290
TK1151 IDTkA08G044290
OH-1004 IDLXL04_017872
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.023 / OH-1004 86.804
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G044290
位置Chr08:11287700-11291977 (+)
描述Similar to FTSH9: ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 9, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58870 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
At3g47060 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0649700 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017872 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0004176 ATP-dependent peptidase activity 分子功能
GO:0004222 metalloendopeptidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
amr:AM1_D0237
ath:AT3G47060
ath:AT5G58870
dosa:Os02g0649700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.923
排名 1 · TkA08G044290 · TK1151
线粒体0.079
排名 2 · TkA08G044290 · TK1151
细胞核0.030
排名 3 · TkA08G044290 · TK1151
细胞质0.020
排名 4 · TkA08G044290 · TK1151
细胞膜0.013
排名 5 · TkA08G044290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20720nSTAND313-62 aa
PF06480FtsH_ext162-247 aa
PF00004AAA210-275 aa
PF01078Mg_chelatase328-364 aa
PF13191AAA_16372-410 aa
PF05496RuvB_N376-450 aa
PF06068TIP49376-412 aa
PF07728AAA_5377-500 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G044290PF20720nSTAND313620.03914.4
TkA08G044290PF06480FtsH_ext1622475.8e-0627.2
TkA08G044290PF00004AAA2102751.8e-44152.1
TkA08G044290PF01078Mg_chelatase3283640.0813.0
TkA08G044290PF13191AAA_163724103.4e-0525.1
TkA08G044290PF05496RuvB_N3764500.000720.1
TkA08G044290PF06068TIP493764120.001119.0
TkA08G044290PF07728AAA_53775000.0001422.6
TkA08G044290PF00004AAA3785111.8e-44152.1
TkA08G044290PF13401AAA_223784330.0004521.3
TkA08G044290PF07724AAA_23784560.001819.1
TkA08G044290PF13173AAA_143784480.00517.5
TkA08G044290PF20720nSTAND33784430.03914.4
TkA08G044290PF13671AAA_333784050.06214.3
TkA08G044290PF01078Mg_chelatase3783960.0813.0
TkA08G044290PF13207AAA_173814580.0116.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIM2拟南芥sp|Q9FIM2|FTSH9_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 9, chloroplastic70.800%Swiss-Prot高置信
Q9SD67拟南芥sp|Q9SD67|FTSH7_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 7, chloroplastic82.100%Swiss-Prot高置信
Q6H6R9水稻sp|Q6H6R9|FTSH7_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 7, chloroplastic78.500%Swiss-Prot高置信

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