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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G040160
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 10199390-10202465 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2870 bp · TkA08G040160|TK1151|cDNA

CAAGAGGAAGACCTTGTACCACCTGTCTCTCTCTTCTCTACCCAATAACTATTCTTGGCACATGCCTTCTCTCTTTCTATCTCTCTTTCTCTCTCTCCCTAACATGTCTTCTTTTCTTTGTTGTCGCCTTTCTTTCTTCATGCCCACACAATCACATTTCATTCTCAAGTTTTCCGTTTCCCTAACAGCAGCCACAATTGCCTTCTGCAATAGCCCCTTTAATGGGCGCGCACTCGTATGTGCGCGCACCACTGCCATCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1956 bp · TkA08G040160|TK1151|CDS

ATGGGCGCGCACTCGTATGTGCGCGCACCACTGCCATCCTCCTGTTCCATGTTTGCCCGATCGACTTTGAGTCATCTCGTTGTCCTCCTCTTCCTAATCTCCACAATCCAACTTGCCAACGGTTTGGATAAAGAATCGCTTTTGAAGTTCAAACGTTCGTTAGTCAATGGCAGGAATTTAGCCACCTGGATTGCCTCCGAGGATCCATGCCATAATAGCACAGCTAATTGGGAAGGCGTTCTTTGCACCATTAATGGAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

651 aa · TkA08G040160|TK1151|PROTEIN

MGAHSYVRAPLPSSCSMFARSTLSHLVVLLFLISTIQLANGLDKESLLKFKRSLVNGRNLATWIASEDPCHNSTANWEGVLCTINGTVWAIKLEGMGLEGNIDPTILARLKSLEIINFMNNSLKGAFPDFGMLYGIREILLSDNKYSGEISGNAFKGLKLLEKLYLANNKLIGQIPVSLTTLPNLKELMLENNHLEGEIPKFSKSNLTFANFADNHFTGRIPDGFLNFTASQFLGNDRLCGPPLEECERNGASTPTIIII...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G040160
TK1151 IDTkA08G040160
OH-1004 IDLXL04_028486
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)52.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.705 / OH-1004 95.315
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G040160
位置Chr08:10199390-10202465 (+)
描述Similar to PRK1: Pollen receptor-like kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g07040 受体样激酶参与花粉萌发和花粉管极性生长的控制。
A distinct mechanism regulating a pollen-specific guanine nucleotide exchange factor for the small GTPase Rop in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0705874104
AtPRK2 promotes ROP1 activation via RopGEFs in the control of polarized pollen tube growth.2013 · DOI: 10.1093/mp/sss103
The juxtamembrane and carboxy-terminal domains of Arabidopsis PRK2 are critical for ROP-induced growth in pollen tubes.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert323
At3g20190 参与控制花粉萌发和花粉管极性生长的受体样激酶。 暂无已核实直接文献
At5g35390 受体样激酶参与花粉萌发和花粉管极性生长的控制。
AtPRK2 promotes ROP1 activation via RopGEFs in the control of polarized pollen tube growth.2013 · DOI: 10.1093/mp/sss103
At1g50610 受体样激酶参与花粉萌发和花粉管极性生长的控制。
GRIM REAPER peptide binds to receptor kinase PRK5 to trigger cell death in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.15252/embj.201488582
At4g31250 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g31250。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028486 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0045177 apical part of cell 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50610
ath:AT2G07040
ath:AT3G20190
ath:AT4G31250
ath:AT5G35390
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.887
排名 1 · TkA08G040160 · TK1151
内质网0.077
排名 2 · TkA08G040160 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA08G040160 · TK1151
细胞核0.045
排名 4 · TkA08G040160 · TK1151
溶酶体／液泡0.021
排名 5 · TkA08G040160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_243-83 aa
PF23211LRR_LRWD187-168 aa
PF13855LRR_8101-145 aa
PF14580LRR_9102-122 aa
PF12799LRR_4110-123 aa
PF00560LRR_1112-129 aa
PF23211LRR_LRWD1133-194 aa
PF00560LRR_1136-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G040160PF08263LRRNT_243832.7e-0834.7
TkA08G040160PF23211LRR_LRWD1871680.07113.5
TkA08G040160PF13855LRR_81011454.1e-1040.0
TkA08G040160PF14580LRR_91021220.1112.8
TkA08G040160PF12799LRR_41101231.7e-0731.9
TkA08G040160PF00560LRR_11121291.1e-0834.2
TkA08G040160PF23211LRR_LRWD11331940.07113.5
TkA08G040160PF00560LRR_11361511.1e-0834.2
TkA08G040160PF13855LRR_81371954.1e-1040.0
TkA08G040160PF14580LRR_91411960.1112.8
TkA08G040160PF00560LRR_11611821.1e-0834.2
TkA08G040160PF12799LRR_41611951.7e-0731.9
TkA08G040160PF00560LRR_11842011.1e-0834.2
TkA08G040160PF00560LRR_12062271.1e-0834.2
TkA08G040160PF12799LRR_42062231.7e-0731.9
TkA08G040160PF20558DUF67692592850.2412.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84JQ4拟南芥sp|Q84JQ4|PRK2_ARATH Pollen receptor-like kinase 245.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LJY0拟南芥sp|Q9LJY0|PRK4_ARATH Pollen receptor-like kinase 443.200%Swiss-Prot中等置信
C0LGU0拟南芥sp|C0LGU0|PRK1_ARATH Pollen receptor-like kinase 145.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LPT1拟南芥sp|Q9LPT1|PRK5_ARATH Pollen receptor-like kinase 543.300%Swiss-Prot中等置信
C0LGR9拟南芥sp|C0LGR9|Y4312_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3125041.700%Swiss-Prot中等置信

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