TkA08G034520 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G034520

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 8794193-8801859 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3415 bp · TkA08G034520|TK1151|cDNA

GGGTGGTATCTCATCGAGGGAAGGGTGTGTGGTGAAGTATAAAGAGACACTCATACACCTCAGGTGTAGAAAACCCTTTCCTCAACAAAACCAAATCTCTCTCTTTCTCTTTGGGGTTTGAGTACAATTCAAACTCCATTGATTCTCTCTCTTCATTATAACCTACTGGAGCTGCTCATTCATTAATTTCCCCCAAGCAACACATCTCTCCTGCTCTTTGATTCCTCGGCGTAGTCGCCGCCGCCGCCCAATCGGTGTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2088 bp · TkA08G034520|TK1151|CDS

ATGGCGGTGGAAATCGTCGTCATGTATCCAATCCAGAAAAGGCCGTACAGGAGCGGAATCGACAACCTCTTGGTTCTGTTGATCGGTGGAATCCCAATCGCTATGCCGACTGTGCTTTCCGTCACCATGGCTATCGGATCTCACAGGCTTTCACAGCAAGGTGCAATTACCAAGAGGATGACTGCGATTGAAGAAATGGCGGGAATGGACGTACTTTGCAGTGATAAAACAGGGACGCTTACTCTTAACAAGCTTTCTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

695 aa · TkA08G034520|TK1151|PROTEIN

MAVEIVVMYPIQKRPYRSGIDNLLVLLIGGIPIAMPTVLSVTMAIGSHRLSQQGAITKRMTAIEEMAGMDVLCSDKTGTLTLNKLSVDKNLIEVFAKGVDKEQVLLFAARASRTENQDAIDAAIVGTLADPKEARAGIREVHFFPFNPVDKRTALTYIDERGDWHRTSKGAPEQILTLCGCKEDLKKKVHAMIDKFAERGLRSLAVARQEVPEKSKDSAGGPWQFVGLLSLFDPPRHDSAETIRRALNLGVNVKMITGDQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G034520`
TK1151 ID	TkA08G034520
OH-1004 ID	LXL04_017998
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 72.851 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G034520

位置 Chr08:8794193-8801859 (+)

描述 Similar to PMA4: Plasma membrane ATPase 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g30190`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	Mechanism of proton transport by plant plasma membrane proton ATPases.2003 · DOI: 10.1007/s10265-003-0111-9 The effect of a genetically reduced plasma membrane protonmotive force on vegetative growth of Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.189167 Abscisic acid suppresses hypocotyl elongation by dephosphorylating plasma membrane H(+)-ATPase in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1093/pcp/pcu028 The plasma membrane H(+) -ATPase AHA2 contributes to the root architecture in response to different nitrogen supply.2015 · DOI: 10.1111/ppl.12305 Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306 Direct observation of proton pumping by a eukaryotic P-type ATPase.2016 · DOI: 10.1126/science.aad6429
`At2g24520`	植物和真菌的质膜 H⁺ ATP 酶产生质子梯度，通过 H⁺ 共转运驱动营养物质的主动运输。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0656100`	植物和真菌的质膜ATP酶是一种氢离子泵。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017998 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程

GO:0120029 proton export across plasma membrane 生物过程

GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008553 P-type proton-exporting transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G24520

ath:AT4G30190

dosa:Os04g0656100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.515

排名 1 · TkA08G034520 · TK1151

内质网0.193

排名 2 · TkA08G034520 · TK1151

细胞质0.119

排名 3 · TkA08G034520 · TK1151

高尔基体0.117

排名 4 · TkA08G034520 · TK1151

溶酶体／液泡0.088

排名 5 · TkA08G034520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00702Hydrolase69-346 aa

PF08282Hydrolase_383-117 aa

PF13246Cation_ATPase117-237 aa

PF08282Hydrolase_3328-366 aa

PF13246Cation_ATPase666-680 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G034520	`PF00702`	Hydrolase	69	346	1.3e-15	59.1
TkA08G034520	`PF08282`	Hydrolase_3	83	117	0.00014	22.4
TkA08G034520	`PF13246`	Cation_ATPase	117	237	8.7e-08	32.9
TkA08G034520	`PF08282`	Hydrolase_3	328	366	0.00014	22.4
TkA08G034520	`PF13246`	Cation_ATPase	666	680	8.7e-08	32.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P19456`	拟南芥	sp\|P19456\|PMA2_ARATH ATPase 2, plasma membrane-type	86.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SJB3`	拟南芥	sp\|Q9SJB3\|PMA5_ARATH ATPase 5, plasma membrane-type	84.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XPY2`	水稻	sp\|Q7XPY2\|PMA1_ORYSJ Plasma membrane ATPase	87.700%	Swiss-Prot	高置信

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