TkA08G018150 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G018150

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 4491871-4492920 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1005 bp · TkA08G018150|TK1151|cDNA

ATGGGGAAAGGAGGAGCCCTAAGCGAAGGCGTATTGAAGAAGATCATCCTTTCCTACACCTACGTCGCAATATGGATCACTCTCAGCTTCACCGTCATCGTCTACAACAAATACATCCTCGATCGGAAGATGTACGATTGGCCTTACCCAATCTCACTAACCATGATCCACATGGTCGTCGAACCAGTTCAGATGACTCGCGATATCTATTTCAAATCCGTCGTTCCAATCGGTTTGCTTTACTCTCTCAGTTTATGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1005 bp · TkA08G018150|TK1151|CDS

ATGGGGAAAGGAGGAGCCCTAAGCGAAGGCGTATTGAAGAAGATCATCCTTTCCTACACCTACGTCGCAATATGGATCACTCTCAGCTTCACCGTCATCGTCTACAACAAATACATCCTCGATCGGAAGATGTACGATTGGCCTTACCCAATCTCACTAACCATGATCCACATGGTCGTCGAACCAGTTCAGATGACTCGCGATATCTATTTCAAATCCGTCGTTCCAATCGGTTTGCTTTACTCTCTCAGTTTATGGCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

334 aa · TkA08G018150|TK1151|PROTEIN

MGKGGALSEGVLKKIILSYTYVAIWITLSFTVIVYNKYILDRKMYDWPYPISLTMIHMVVEPVQMTRDIYFKSVVPIGLLYSLSLWLSNSAYIYLSVSFIQMLKALMPVAVYSIGVLLKKEGFKGDTMTNMLSISFGVAIAAYGEAKFNSWGVMLQLGAVCFEATRLVLIQILLTSKGITFNPITSLYYVAPCCFAFLSIPWIIVEFPKLRDTSSFHFDYFIFGTNSLCAFALNLAVFLLVGKTSALTMNVAGVVKDWLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G018150`
TK1151 ID	TkA08G018150
OH-1004 ID	LXL04_018255
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	95.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G018150

位置 Chr08:4491871-4492920 (-)

描述 Similar to At5g25400: Probable sugar phosphate/phosphate translocator At5g25400

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g25400`	可能的糖磷酸/磷酸转运蛋白 At5g25400。	暂无已核实直接文献
`At2g25520`	可能的糖磷酸盐/磷酸盐转运蛋白 At2g25520。	暂无已核实直接文献
`At4g32390`	可能的糖磷酸/磷酸转运蛋白 At4g32390。	暂无已核实直接文献
`At5g11230`	推测为糖磷酸盐/磷酸盐转运蛋白 At5g11230。	暂无已核实直接文献
`At1g48230`	可能的糖磷酸/磷酸转运蛋白 At1g48230。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018255 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0015780 nucleotide-sugar transmembrane transport 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分

GO:0005768 endosome 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0015297 antiporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G25520

ath:AT3G17430

ath:AT4G32390

ath:AT5G11230

ath:AT5G25400

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.684

排名 1 · TkA08G018150 · TK1151

内质网0.251

排名 2 · TkA08G018150 · TK1151

细胞质0.113

排名 3 · TkA08G018150 · TK1151

细胞膜0.047

排名 4 · TkA08G018150 · TK1151

溶酶体／液泡0.029

排名 5 · TkA08G018150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03151TPT20-291 aa

PF00892EamA22-29 aa

PF08449UAA60-292 aa

PF00892EamA67-140 aa

PF11019DUF260880-134 aa

PF00892EamA151-288 aa

PF11019DUF2608281-313 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G018150	`PF03151`	TPT	20	291	7e-20	72.3
TkA08G018150	`PF00892`	EamA	22	29	0.0046	18.0
TkA08G018150	`PF08449`	UAA	60	292	0.0091	15.9
TkA08G018150	`PF00892`	EamA	67	140	0.0046	18.0
TkA08G018150	`PF11019`	DUF2608	80	134	0.013	15.7
TkA08G018150	`PF00892`	EamA	151	288	0.0046	18.0
TkA08G018150	`PF11019`	DUF2608	281	313	0.013	15.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q3E6T0`	拟南芥	sp\|Q3E6T0\|PT525_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At5g25400	82.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SKJ7`	拟南芥	sp\|Q9SKJ7\|PT225_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At2g25520	81.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SUV2`	拟南芥	sp\|Q9SUV2\|PT432_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At4g32390	79.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LFN3`	拟南芥	sp\|Q9LFN3\|PT511_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At5g11230	80.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LNH5`	拟南芥	sp\|Q9LNH5\|PT148_ARATH Probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g48230	46.100%	Swiss-Prot	中等置信

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