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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G012130
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 2967531-2968378 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

441 bp · TkA08G012130|TK1151|cDNA

AAAACAGGAGCCGAATTGCACCTACAACAACAACATCAACATATCTCCTTCTCCCATTCCGAGCAAAGGGAGACGACTGAAGTGGAAGTGAAAGATACAAACGATGCGAGAAAAGTTCAGAAGGCCGACCGTGAAAAACTGAGAAGAGATAGATTGAACGAGCAATTCATCGAGTTGGGACATATACTCGACAGACCTAAAAACGACAAAGCCAGTATCATAATCGACACCATTCAAGTCCTGAAGGATCTGACAACCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

441 bp · TkA08G012130|TK1151|CDS

AAAACAGGAGCCGAATTGCACCTACAACAACAACATCAACATATCTCCTTCTCCCATTCCGAGCAAAGGGAGACGACTGAAGTGGAAGTGAAAGATACAAACGATGCGAGAAAAGTTCAGAAGGCCGACCGTGAAAAACTGAGAAGAGATAGATTGAACGAGCAATTCATCGAGTTGGGACATATACTCGACAGACCTAAAAACGACAAAGCCAGTATCATAATCGACACCATTCAAGTCCTGAAGGATCTGACAACCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

147 aa · TkA08G012130|TK1151|PROTEIN

KTGAELHLQQQHQHISFSHSEQRETTEVEVKDTNDARKVQKADREKLRRDRLNEQFIELGHILDRPKNDKASIIIDTIQVLKDLTTEVTRLKSECAALSEESSELTQEKNELREEKSSLKSDIENLNTQYQQRVGVMYPWGTIDHPS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G012130
TK1151 IDTkA08G012130
OH-1004 IDLXL04_007269
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 84.354 / OH-1004 34.711
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G012130
位置Chr08:2967531-2968378 (-)
描述Similar to BHLH121: Transcription factor bHLH121
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g19860 转录因子 bHLH121。 暂无已核实直接文献
At4g36060 转录因子bHLH11。 暂无已核实直接文献
At5g54680 转录因子。
An Arabidopsis basic helix-loop-helix leucine zipper protein modulates metal homeostasis and auxin conjugate responsiveness.2006 · DOI: 10.1534/genetics.106.061044

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0628500 在盐胁迫耐受中起正调控作用的转录因子。
OsJAZ9 acts as a transcriptional regulator in jasmonate signaling and modulates salt stress tolerance in rice.2015 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2014.12.010
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007269 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0010039 response to iron ion 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能
GO:1990837 sequence-specific double-stranded DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G19860
ath:AT4G36060
ath:AT5G54680
dosa:Os03g0379300
dosa:Os07g0628500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.935
排名 1 · TkA08G012130 · TK1151
细胞质0.243
排名 2 · TkA08G012130 · TK1151
细胞膜0.018
排名 3 · TkA08G012130 · TK1151
线粒体0.017
排名 4 · TkA08G012130 · TK1151
内质网0.010
排名 5 · TkA08G012130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30381CEP135_N5-130 aa
PF25994HH_AprE5-37 aa
PF24319DUF74917-45 aa
PF06657Cep57_MT_bd7-27 aa
PF07889DUF16647-32 aa
PF28219Spindly8-132 aa
PF28726CCDC1108-52 aa
PF27821CEP162_helical_38-63 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G012130PF30381CEP135_N51300.005416.4
TkA08G012130PF25994HH_AprE5370.009416.8
TkA08G012130PF24319DUF74917450.0005720.8
TkA08G012130PF06657Cep57_MT_bd7271.89.7
TkA08G012130PF07889DUF16647322.68.8
TkA08G012130PF28219Spindly81320.2111.2
TkA08G012130PF28726CCDC1108521.18.7
TkA08G012130PF27821CEP162_helical_38631.210.1
TkA08G012130PF04871Uso1_p115_C8462.19.3
TkA08G012130PF06156YabA9470.008917.3
TkA08G012130PF28159CEP8991271.77.7
TkA08G012130PF16043DUF479510490.02714.6
TkA08G012130PF30919CRWN_second_CC11520.005217.0
TkA08G012130PF24824PH_SPT1611571.69.4
TkA08G012130PF30907IPGA1_CC12330.01516.3
TkA08G012130PF10786HI_055212840.1512.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LT23拟南芥sp|Q9LT23|BH121_ARATH Transcription factor bHLH12169.700%Swiss-Prot高置信
Q8W2F2拟南芥sp|Q8W2F2|BH011_ARATH Transcription factor bHLH1167.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FH37拟南芥sp|Q9FH37|ILR3_ARATH Transcription factor ILR350.900%Swiss-Prot低置信
Q69V10水稻sp|Q69V10|BH062_ORYSJ Transcription factor BHLH06243.100%Swiss-Prot低置信

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