TkA07G437630 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G437630

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 110790474-110795027 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1112 bp · TkA07G437630|TK1151|cDNA

TAAACTTCATCAGCATTCTGTAATTCTCCTAAACGCCTTACATGTTTTCCGCTAATTTGGACCCTACGATCGTGTTTTGATTTCAACATTTCAAACAGATTCTGCGCGGGGAACATTTACTATCAGTAAACGAAAAACGAAAACGGAAACGGTGGATTTCATGGATCAGAAAAAAGCAAGATTCAGGTGAAGAATTTGACGAGATTTTTAGATAAAGGAGTTTCGATCCTTCAAAATGTGAGTCTGGAGATACCTAGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

471 bp · TkA07G437630|TK1151|CDS

ATGCTGTTTCAGCTTCCAGTTTTGTTCGAAGGTACAGTTGCAGACAACATAAGATACGGGCCACAATTACAAGGAAAGAAACTAAGCGATGAACAAGTCTACAAGTTATTGACTTTTGCTGATCTCGACTCCTCTTTCTTCCATAAACATGGGAGCGAACTATCGGTAGGTCAAGCTCAAAGAGTTGCACTTGCTAGAACATTAGCAAACGACCCCGAGGTTTTGTTGTTAGATGAGCCGACAAGTGCATTGGATCCGGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

156 aa · TkA07G437630|TK1151|PROTEIN

MLFQLPVLFEGTVADNIRYGPQLQGKKLSDEQVYKLLTFADLDSSFFHKHGSELSVGQAQRVALARTLANDPEVLLLDEPTSALDPVSTENIEDLLVKLKSKGMTIAIVSHSIKQIQKIADVVCVVVGGEIVEVLMSEELSEAKHPMAKRFLELGS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G437630`
TK1151 ID	TkA07G437630
OH-1004 ID	LXL04_030867
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	75.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 60.577 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G437630

位置 Chr07:110790474-110795027 (-)

描述 Similar to ABCI17: ABC transporter I family member 17

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g67940`	ABC 转运蛋白 I 家族成员 17。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0695800`	与 STAR2 结合形成根中铝 (Al) 解毒所需的功能性跨膜 ABC 转运蛋白。	A bacterial-type ABC transporter is involved in aluminum tolerance in rice.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.064543

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030867 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0010044 response to aluminum ion 生物过程

GO:0015786 UDP-glucose transmembrane transport 生物过程

GO:0035435 phosphate ion transmembrane transport 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0012506 vesicle membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0005460 UDP-glucose transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0015415 ATPase-coupled phosphate ion transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

afu:AF_1359

ath:AT1G67940

dosa:Os06g0695800

tte:TTE0320

tte:TTE1628

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.752

排名 1 · TkA07G437630 · TK1151

细胞核0.385

排名 2 · TkA07G437630 · TK1151

过氧化物酶体0.054

排名 3 · TkA07G437630 · TK1151

线粒体0.054

排名 4 · TkA07G437630 · TK1151

细胞膜0.030

排名 5 · TkA07G437630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00005ABC_tran1-82 aa

PF02463SMC_N22-125 aa

PF09818ABC_ATPase59-130 aa

PF13304AAA_2163-112 aa

PF21270SOGP_4th83-133 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G437630	`PF00005`	ABC_tran	1	82	1.1e-12	49.5
TkA07G437630	`PF02463`	SMC_N	22	125	0.0036	17.5
TkA07G437630	`PF09818`	ABC_ATPase	59	130	0.036	13.8
TkA07G437630	`PF13304`	AAA_21	63	112	0.0004	21.1
TkA07G437630	`PF21270`	SOGP_4th	83	133	0.045	14.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C9W0`	拟南芥	sp\|Q9C9W0\|AB17I_ARATH ABC transporter I family member 17	77.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q0D9V6`	水稻	sp\|Q0D9V6\|STAR1_ORYSJ Protein STAR1	72.400%	Swiss-Prot	高置信

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