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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G431650
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 109205895-109214502 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

915 bp · TkA07G431650|TK1151|cDNA

GAAAAACACAAGAACCACGTATAAGAGGGGGTTTAACGTGAATATATATATAGTCATGCATGCATGACTAGCTAGCTAGCCCACCGAATAACAAAGAAGCAGCATGCATCAGAACCAATCCTCCTCCTCTTCACACGCGGTTGGTCCTCCGTCGCACATGGCCAAACCGTATATTTGCAGTGATATATGCATGCGTCATCTTAGCCATTCTATATCACCAAACCACCCTTCTCTTTCACTCCACCAACACCATAGTTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

387 bp · TkA07G431650|TK1151|CDS

ATGATTATCCGACGGATAAATTCGGTTTATTTATTTGTCGGACGATGGAGGATCGAAGCTTACATTGTTTGCTTTCACACCGAAGCTTCGGAGTTTGCAAAACAGTGGTTGCCATATTGCAAGAAGAATGGAATAATGGAGAGATGCCCTGAAGCTCATTTTCGTTCCCACTATACTCGCTTCCCTGAGACCCAAGAAATCAAGTCAATGTATGAGAAAATGAAAGTCAAAGTGGAAGAGGCAGTTGTCAGTGGAAATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

128 aa · TkA07G431650|TK1151|PROTEIN

MIIRRINSVYLFVGRWRIEAYIVCFHTEASEFAKQWLPYCKKNGIMERCPEAHFRSHYTRFPETQEIKSMYEKMKVKVEEAVVSGNVYPNEKWAHVFNHWDADFTRSNHPTVIQVLFFVGFCCLTSTK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G431650
TK1151 IDTkA07G431650
OH-1004 IDLXL04_030791
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 70.312 / OH-1004 12.535
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G431650
位置Chr07:109205895-109214502 (+)
描述Similar to CSLG3: Cellulose synthase-like protein G3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g55850 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
At5g17420 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
Multiple cellulose synthase catalytic subunits are required for cellulose synthesis in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.12.2529
Structure of cellulose-deficient secondary cell walls from the irx3 mutant of Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1016/s0031-9422(02)00199-1
Impairment of cellulose synthases required for Arabidopsis secondary cell wall formation enhances disease resistance.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048058
At4g32410 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
Fractionation of carbohydrates in Arabidopsis root cell walls shows that three radial swelling loci are specifically involved in cellulose production.2000 · DOI: 10.1007/s004250000301
PROCUSTE1 encodes a cellulose synthase required for normal cell elongation specifically in roots and dark-grown hypocotyls of Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.12.2409
Morphology of rsw1, a cellulose-deficient mutant of Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1007/bf01280308
Wall architecture in the cellulose-deficient rsw1 mutant of Arabidopsis thaliana: microfibrils but not microtubules lose their transverse alignment before microfibrils become unrecognizable in the mitotic and elongation zones of roots.2001 · DOI: 10.1007/bf01280312
Alpha-glucosidase I is required for cellulose biosynthesis and morphogenesis in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1083/jcb.200111093
Functional analysis of the cellulose synthase genes CesA1, CesA2, and CesA3 in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.010931
Genetic complexity of cellulose synthase a gene function in Arabidopsis embryogenesis.2002 · DOI: 10.1104/pp.102.010603
Genetic evidence for three unique components in primary cell-wall cellulose synthase complexes in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706592104
Organization of cellulose synthase complexes involved in primary cell wall synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706569104
Molecular analysis of cellulose biosynthesis in Arabidopsis.1998 · DOI: 10.1126/science.279.5351.717

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0725300 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
Os07g0424400 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030791 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016759 cellulose synthase activity 分子功能
GO:0016760 cellulose synthase (UDP-forming) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55850
ath:AT4G23990
ath:AT4G24000
ath:AT4G24010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.902
排名 1 · TkA07G431650 · TK1151
细胞质0.081
排名 2 · TkA07G431650 · TK1151
细胞核0.065
排名 3 · TkA07G431650 · TK1151
细胞膜0.022
排名 4 · TkA07G431650 · TK1151
质体0.013
排名 5 · TkA07G431650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03552Cellulose_synt27-117 aa
PF23661SHMOOSE92-110 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G431650PF03552Cellulose_synt271172.2e-1040.4
TkA07G431650PF23661SHMOOSE921100.2112.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZK9拟南芥sp|Q8VZK9|CSLE1_ARATH Cellulose synthase-like protein E139.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SWW6拟南芥sp|Q9SWW6|CESA7_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 7 [UDP-forming]33.700%Swiss-Prot中等置信
O48946拟南芥sp|O48946|CESA1_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 1 [UDP-forming]34.600%Swiss-Prot中等置信
Q0DXZ1水稻sp|Q0DXZ1|CSLE2_ORYSJ Cellulose synthase-like protein E235.900%Swiss-Prot中等置信
Q69V23水稻sp|Q69V23|CESA3_ORYSJ Probable cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]34.000%Swiss-Prot中等置信

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