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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G429560
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 108718325-108727661 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

360 bp · TkA07G429560|TK1151|cDNA

ATGTCCAAAGCATCTAAGATTTATGATTTACCGATGCCGGATTTTGGGGGTACGACGCTAGGGCTTCGTCAAGAGCAGCGATTGATTCTTATTACGGCTTCGATTTTTGGAAGGAGGAGAAAGGATAACTCGGTTTACCTCGACATGAAAACCAACAGCCACCATCTTCTTCATCATTCGACCTCTGACAGCCAACACCGCCGCAAGCTTCCCTCCGGCAAGTTCTTCCTCTCAACCGTTGTTCTATATATCTCTGTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

4386 bp · TkA07G429560|TK1151|CDS

ATGAAAACCAACAGCCACCATCTTCTTCATCATTCGACCTCTGACAGCCAACACCGCCGCAAGCTTCCCTCCGGCAAGTTCTTCCTCTCAACCGTTGTTCTATATATCTCTGTTCTATGGTTGATCTCCATATTGAAGAAACGAAGGCAGATGGTGGTGATGGCGACGGTAATGGAGAGGAAAATGATGATGGTGGGATGTAGTGGCAAGAGTCCACATAGTCAAGTTCTTTCCAGAAGCTCTTGTTCTCGATCGACGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1461 aa · TkA07G429560|TK1151|PROTEIN

MKTNSHHLLHHSTSDSQHRRKLPSGKFFLSTVVLYISVLWLISILKKRRQMVVMATVMERKMMMVGCSGKSPHSQVLSRSSCSRSTIAMADDSYENNTTTIRILCRKLLLITKSESGIQWLIGSSFLPTFTVVSTFRCINTLPSDPLSPDFSKESDDMRALLPRGFEVIGSLIAGTTNPNVERSARDAIDASSKMRKALSQLEDRSLIGAVVDPNSGDIRFFVSNSVVELEPVTSAVFEDNPEKYVWERGCILHCELPIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G429560
TK1151 IDTkA07G429560
OH-1004 IDLXL04_030763
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.819
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G429560
位置Chr07:108718325-108727661 (+)
描述Similar to MRF1: MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g63190 参与雷帕霉素 靶标调节的翻译控制，尤其是在能量不足的条件下。
MRF Family Genes Are Involved in Translation Control, Especially under Energy-Deficient Conditions, and Their Expression and Functions Are Modulated by the TOR Signaling Pathway.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00563
At4g24800 参与雷帕霉素靶标 调节的翻译控制，尤其是在能量不足的条件下。
EIN2 regulates salt stress response and interacts with a MA3 domain-containing protein ECIP1 in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02363.x
At3g48390 参与雷帕霉素靶点（TOR）调控的翻译控制，尤其在能量缺乏条件下。
MRF Family Genes Are Involved in Translation Control, Especially under Energy-Deficient Conditions, and Their Expression and Functions Are Modulated by the TOR Signaling Pathway.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00563
At3g48380 含硫蛋白酶，可识别并水解 UFM1（一种与多个靶蛋白结合的泛素样修饰蛋白）C 端的甘氨酸肽键。 暂无已核实直接文献
At1g22730 参与雷帕霉素靶点（TOR）调控的翻译控制，尤其在能量缺乏条件下。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0285500 硫醇蛋白酶，可识别并水解富铁蛋白1（ufm-1，一种与多种靶蛋白结合的泛素样修饰蛋白）C端甘氨酸的肽键。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030763 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006417 regulation of translation 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0090549 response to carbon starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G48390
ath:AT4G24800
ath:AT5G63190
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.458
排名 1 · TkA07G429560 · TK1151
细胞核0.369
排名 2 · TkA07G429560 · TK1151
细胞膜0.123
排名 3 · TkA07G429560 · TK1151
内质网0.085
排名 4 · TkA07G429560 · TK1151
质体0.085
排名 5 · TkA07G429560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20908UfSP2_N401-490 aa
PF07910Peptidase_C78523-713 aa
PF02847MA3880-990 aa
PF25050TARBP1914-972 aa
PF02847MA31043-1154 aa
PF25393LTM1055-1071 aa
PF02847MA31179-1288 aa
PF25393LTM1274-1283 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G429560PF20908UfSP2_N4014901.6e-0732.1
TkA07G429560PF07910Peptidase_C785237131.1e-65221.8
TkA07G429560PF02847MA38809904e-120394.7
TkA07G429560PF25050TARBP19149720.2411.4
TkA07G429560PF02847MA3104311544e-120394.7
TkA07G429560PF25393LTM105510710.2412.0
TkA07G429560PF02847MA3117912884e-120394.7
TkA07G429560PF25393LTM127412830.2412.0
TkA07G429560PF02847MA3134214494e-120394.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94BR1拟南芥sp|Q94BR1|MRF1_ARATH MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 171.900%Swiss-Prot高置信
Q8W4Q4拟南芥sp|Q8W4Q4|MRF3_ARATH MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 371.900%Swiss-Prot高置信
Q9STL9拟南芥sp|Q9STL9|MRF4_ARATH MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 470.100%Swiss-Prot高置信
Q9STL8拟南芥sp|Q9STL8|UFSP_ARATH Probable Ufm1-specific protease59.700%Swiss-Prot高置信
O80548拟南芥sp|O80548|MRF2_ARATH MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 249.100%Swiss-Prot中等置信
Q0INW1水稻sp|Q0INW1|UFSP_ORYSJ Probable Ufm1-specific protease53.400%Swiss-Prot高置信

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