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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G428360
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 108336920-108339260 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2093 bp · TkA07G428360|TK1151|cDNA

AAATAATCCCATAGATATTGCTTGAATTTTTTTAGTAATAACTAATGTAATTATTAAATTAAATAAATAATTCATTTGTTTTTTTATCTTAGTATATAAAATTACAAAATACTACCCTCCAAGAATTGCTCCGAGATATTGCATCGCATGACTAAATACCGTTGCGGTTATCATTCGGTCTTGTTCAACATCTACGTCGCGAGAATTGCATGCAAATCTAGAACTCAGATTCATAAATCTCCGAAAATCTGCTTGAATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1569 bp · TkA07G428360|TK1151|CDS

ATGAATCAATCTTCACACACTACAAACAACACTCCCATGGATCCAAACCCCAAAAACTTCCCAATTCTCTCCTACGTCATGACCAGACTGCCCACCATGAAACACCCCAACATGCACGAAGGCGACATTGAAACGGCGACGCCGCGTTCCGCTACTTTTGTAACCCCTAAAACGTCTTTTAATCCGGCACCGAATTTCGAGCTCACTGAACGGATGCCTCACCTATCAGATCCTCAGCTCATGGCTTCCATGCGTTCCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

522 aa · TkA07G428360|TK1151|PROTEIN

MNQSSHTTNNTPMDPNPKNFPILSYVMTRLPTMKHPNMHEGDIETATPRSATFVTPKTSFNPAPNFELTERMPHLSDPQLMASMRSAVADVSQTRSLLKTLGDRPDHEAVDAAKARLAEIESKFSNDLDEIKLSDKVDPEEEKQKKAIERERQMHKTLISLDQMHKSYDKMLSEAEKKLEKLYESVNAGKQSLQDIDEGSSGVTEEVKEEVVAILSDAMSNGAERIDLSERRLPFLPEAFGKIRTLVYLNLSSNQLEVIP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G428360
TK1151 IDTkA07G428360
OH-1004 IDLXL04_030746
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G428360
位置Chr07:108336920-108339260 (+)
描述Similar to PIRL1: Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g05850 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。
PIRL1 and PIRL9, encoding members of a novel plant-specific family of leucine-rich repeat proteins, are essential for differentiation of microspores into pollen.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1242-6
Effect of sporophytic PIRL9 genotype on post-meiotic expression of the Arabidopsis pirl1;pirl9 mutant pollen phenotype.2011 · DOI: 10.1007/s00425-010-1324-5
At3g11330 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。
PIRL1 and PIRL9, encoding members of a novel plant-specific family of leucine-rich repeat proteins, are essential for differentiation of microspores into pollen.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1242-6
Effect of sporophytic PIRL9 genotype on post-meiotic expression of the Arabidopsis pirl1;pirl9 mutant pollen phenotype.2011 · DOI: 10.1007/s00425-010-1324-5
At1g12970 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0593600 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
Os04g0476700 富含亮氨酸的重复蛋白，可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030746 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0055046 microgametogenesis 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G11330
ath:AT3G26500
ath:AT5G05850
dosa:Os02g0593600
dosa:Os04g0476700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.297
排名 1 · TkA07G428360 · TK1151
细胞膜0.262
排名 2 · TkA07G428360 · TK1151
细胞核0.247
排名 3 · TkA07G428360 · TK1151
高尔基体0.113
排名 4 · TkA07G428360 · TK1151
质体0.102
排名 5 · TkA07G428360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11712Vma1251-83 aa
PF20667Sec10_N120-197 aa
PF21121Nup49_C122-131 aa
PF00378ECH_1126-205 aa
PF23406ZNF380_CC131-183 aa
PF11712Vma12137-215 aa
PF30842LEKR1138-210 aa
PF25368PUB10_N138-211 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G428360PF11712Vma1251830.9710.1
TkA07G428360PF20667Sec10_N1201972.19.2
TkA07G428360PF21121Nup49_C1221310.07614.3
TkA07G428360PF00378ECH_11262050.2211.6
TkA07G428360PF23406ZNF380_CC1311830.0216.1
TkA07G428360PF11712Vma121372150.9710.1
TkA07G428360PF30842LEKR11382100.05914.4
TkA07G428360PF25368PUB10_N1382115.08.5
TkA07G428360PF23598LRR_141521833.2e-2795.9
TkA07G428360PF21121Nup49_C1602170.07614.3
TkA07G428360PF24758LRR_At5g563702212790.0003221.1
TkA07G428360PF00560LRR_12252424.1e-1965.3
TkA07G428360PF23286LRR_132332778e-0626.4
TkA07G428360PF24048LRR_NXF1-52362800.0005920.2
TkA07G428360PF13855LRR_82372797.2e-2896.9
TkA07G428360PF23598LRR_142403193.2e-2795.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FFJ3拟南芥sp|Q9FFJ3|PIRL1_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 161.300%Swiss-Prot高置信
Q8VYG9拟南芥sp|Q8VYG9|PIRL9_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 962.400%Swiss-Prot高置信
Q8W4Q3拟南芥sp|Q8W4Q3|PIRL3_ARATH Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 351.100%Swiss-Prot高置信
Q6ZH85水稻sp|Q6ZH85|PIRL2_ORYSJ Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 254.500%Swiss-Prot高置信
Q7XK44水稻sp|Q7XK44|PIRL3_ORYSJ Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 357.500%Swiss-Prot高置信

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