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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G427280
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 108092914-108094257 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1344 bp · TkA07G427280|TK1151|cDNA

ATGCGAAATGGGCAAAACGTACATGCTTGGATTGAATTCGATGGATCTAGAACGGAAATCAACGTTACAATTGCGCCGGCGGGTATGTCTAAACCAATCAGACCGTTACTCACTTATACCAATCCAGCTATTGCGAATTATATATCTTCTGATATGTATGTTGGATTTTCTGCTTCTAAAACAACTTGGATCGAAGCACAGAGGGTCCTCGCATGGAGTTTTAGCGACACCGGCGTTGCCAGAAACATCAATACCACCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1344 bp · TkA07G427280|TK1151|CDS

ATGCGAAATGGGCAAAACGTACATGCTTGGATTGAATTCGATGGATCTAGAACGGAAATCAACGTTACAATTGCGCCGGCGGGTATGTCTAAACCAATCAGACCGTTACTCACTTATACCAATCCAGCTATTGCGAATTATATATCTTCTGATATGTATGTTGGATTTTCTGCTTCTAAAACAACTTGGATCGAAGCACAGAGGGTCCTCGCATGGAGTTTTAGCGACACCGGCGTTGCCAGAAACATCAATACCACCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

447 aa · TkA07G427280|TK1151|PROTEIN

MRNGQNVHAWIEFDGSRTEINVTIAPAGMSKPIRPLLTYTNPAIANYISSDMYVGFSASKTTWIEAQRVLAWSFSDTGVARNINTTNLPVFLPQSASNSGLSTGAKVGIVIGSVVFFLCVLGVCYFIWRKHHSRNEEDEIEDWELEYWPHRYSYEELKQSTNGFSDTEVLGAGGFGKVYKGTLPNKTLVAVKCINHDSKQGLREFMAEISSMGRLQHKNLVQMKGWCRKRNELLLVYDYMPNGSLNTWIFDKPKQILNWE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G427280
TK1151 IDTkA07G427280
OH-1004 IDLXL04_030741
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 71.065
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G427280
位置Chr07:108092914-108094257 (-)
描述Similar to LECRKS1: L-type lectin-domain containing receptor kinase S.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15530 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At3g55550 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At2g37710 含L型凝集素结构域的受体激酶 IV.1。 暂无已核实直接文献
At3g53810 花粉发育期间必需。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0531400 含凝集素结构域的受体激酶，参与盐胁迫反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030741 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:1901001 negative regulation of response to salt stress 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15530
ath:AT3G53810
ath:AT3G55550
ath:AT4G29050
dosa:Os04g0531400
osa:4336489
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.856
排名 1 · TkA07G427280 · TK1151
细胞质0.087
排名 2 · TkA07G427280 · TK1151
内质网0.084
排名 3 · TkA07G427280 · TK1151
细胞核0.048
排名 4 · TkA07G427280 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA07G427280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB2-89 aa
PF05808Podoplanin93-131 aa
PF29119F13C5_C108-131 aa
PF28423Epiregulin_C109-137 aa
PF00069Pkinase165-431 aa
PF03109ABC1166-204 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr167-433 aa
PF17667Pkinase_fungal265-350 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G427280PF00139Lectin_legB2894.6e-1866.4
TkA07G427280PF05808Podoplanin931310.3212.0
TkA07G427280PF29119F13C5_C1081310.2411.9
TkA07G427280PF28423Epiregulin_C1091370.212.2
TkA07G427280PF00069Pkinase1654312.8e-51175.2
TkA07G427280PF03109ABC11662040.0009119.2
TkA07G427280PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1674332.6e-47162.0
TkA07G427280PF17667Pkinase_fungal2653500.02813.9
TkA07G427280PF03109ABC12753150.0009119.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M9E0拟南芥sp|Q9M9E0|LRKS1_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase S.166.100%Swiss-Prot高置信
Q9M2S4拟南芥sp|Q9M2S4|LRKS4_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase S.447.900%Swiss-Prot中等置信
O80939拟南芥sp|O80939|LRK41_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.145.300%Swiss-Prot中等置信
Q9M345拟南芥sp|Q9M345|LRK42_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.243.400%Swiss-Prot中等置信
Q7XUN6水稻sp|Q7XUN6|SIT2_ORYSJ L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT245.700%Swiss-Prot中等置信

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