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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G374850
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 94056264-94058629 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1479 bp · TkA07G374850|TK1151|cDNA

CGAAAGTTGTTCATATAAAGTTTAGGGGGACGATCTGAGAACTTAAGATAATGGGTGTCGATTATCATAAAAACAGTAAACACTGTGTAGTCATCATCTTTCTCTTTGGACTCCAGAAAACCCAAAAGAAAGGAAGAAAACCATCGATTTTTATGCATTTATCAAACTAAATTATTTACAAGTTCAAAATTTTTGCCTTCCCGATCTCTGTTCAAAAGCTAAGAATTTTATCAGAAGTTTGTTCATATGCATATTAATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

894 bp · TkA07G374850|TK1151|CDS

ATGTATATCTCGAGATCAACCAAAACTATGAGTCCATCGAGGGTTTTGCGAACTGGGTTTATTCTATTGGCGATTCTTGCTCGGCTAACGTACGCCGATGAGCTCTCTAGGGTTTCCAATCCTGTCTGCCCCACAAAGTCGATTACTTCTGCGATCCTTGGAAATGGAGCTTCCATTTGTCCCTGGAGTGGAATTAGTTATTCCCTCGGTGTGATTGAGGGAGATGACACATCAATTCAAAAGGCTTTGAGTAGGATTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

297 aa · TkA07G374850|TK1151|PROTEIN

MYISRSTKTMSPSRVLRTGFILLAILARLTYADELSRVSNPVCPTKSITSAILGNGASICPWSGISYSLGVIEGDDTSIQKALSRINTNTHDYISVLFYASWCPFSTIFKPSLSIMSSFYPSIPHFAIEESAVKPSLLSKYGVNGFPTLFILNSTMRVRYHGSRTLSSLVNFYSDVTGIEAESMDKTSLDKMDTFVQEKDDNISEPPEFCPFSWAKSPENLFRQETYLFLATVFVVFRSLYLTYPLIVTSARYARRTRLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G374850
TK1151 IDTkA07G374850
OH-1004 IDLXL04_030116
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G374850
位置Chr07:94056264-94058629 (+)
描述Similar to APRL4: 5'-adenylylsulfate reductase-like 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g34780 5'-腺苷硫酸还原酶样蛋白 4。 暂无已核实直接文献
At4g08930 5'-腺苷基硫酸还原酶样蛋白6。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0754900 5'-腺苷硫酸还原酶样蛋白3。 暂无已核实直接文献
Os08g0412401 5'-腺苷硫酸还原酶样蛋白 4。 暂无已核实直接文献
Os06g0220800 5'-腺苷硫酸还原酶样2。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030116 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0016853 isomerase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34780
ath:AT4G08930
dosa:Os02g0754900
dosa:Os06g0220800
dosa:Os08g0412401
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.438
排名 1 · TkA07G374850 · TK1151
高尔基体0.232
排名 2 · TkA07G374850 · TK1151
细胞核0.161
排名 3 · TkA07G374850 · TK1151
细胞质0.119
排名 4 · TkA07G374850 · TK1151
溶酶体／液泡0.113
排名 5 · TkA07G374850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13098Thioredoxin_281-154 aa
PF00085Thioredoxin90-172 aa
PF13905Thioredoxin_893-118 aa
PF13905Thioredoxin_8135-158 aa
PF27914APRL7_C219-281 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G374850PF13098Thioredoxin_2811540.0315.3
TkA07G374850PF00085Thioredoxin901723.2e-0731.0
TkA07G374850PF13905Thioredoxin_8931180.00418.2
TkA07G374850PF13905Thioredoxin_81351580.00418.2
TkA07G374850PF27914APRL7_C2192812.2e-1041.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SA00拟南芥sp|Q9SA00|APRL4_ARATH 5'-adenylylsulfate reductase-like 451.300%Swiss-Prot高置信
Q9ZPE9拟南芥sp|Q9ZPE9|APRL6_ARATH 5'-adenylylsulfate reductase-like 645.100%Swiss-Prot中等置信
Q84P95水稻sp|Q84P95|APRL3_ORYSJ 5'-adenylylsulfate reductase-like 344.300%Swiss-Prot中等置信
Q5DJV7水稻sp|Q5DJV7|APRL4_ORYSJ 5'-adenylylsulfate reductase-like 443.400%Swiss-Prot中等置信
Q67VZ8水稻sp|Q67VZ8|APRL2_ORYSJ 5'-adenylylsulfate reductase-like 243.800%Swiss-Prot中等置信

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