TkA07G325950 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G325950

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 81596496-81601735 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2869 bp · TkA07G325950|TK1151|cDNA

ACTGCCACCGTCATTTCCATTCTACGGCCGCTTGCCGCCGGTAAGAAGCACCACTTTCTCCGCCGTTCTTTCAGGAAATCCTCTCATTTTCTTAGATACTTTTTGGTTACTAAAGAAATTTTGGCATTTGGAATCATTTGGATCGTAAGCTATTTGTTCGTTTCTTCTTAAACATTCCTCAATTCATCTGTTTGATGTATGAGAAGCTAATTACGCATTATTGTCTTCAACTGTGACGAATTTGTTTGGAAAAGAGAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2400 bp · TkA07G325950|TK1151|CDS

ATGGATCAAGGAGGACGTGCGTTTGTGTCGGCGTTGAGTGTGGGAATAGGAATAGGCGTTGGGCTTGGGGTGGGGAGGACGGTGAATCGTTTGGCCGCCGGCAATGATTCTTCAACAAACCCTGTCACGCCACAAATAATGGAGCGTGAGATGCTTGGTTTGATCATGGATGGCAGAGATAGCAAGGTTACTTTCTATGAATTTCCGTATTACCTCAGTGAGCAGACAAGGGTCTTACTTACAAGTGCTGCATGTTTTTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

799 aa · TkA07G325950|TK1151|PROTEIN

MDQGGRAFVSALSVGIGIGVGLGVGRTVNRLAAGNDSSTNPVTPQIMEREMLGLIMDGRDSKVTFYEFPYYLSEQTRVLLTSAACFYLKNIDFSRHTRNLAPASRTILLSGPAELYQQMLAKALAHYFEAKLLLLDVTDFSLKLQNKYGASAKPNSLKRSISETTLARMSGLFEGLSMIQPKPERKGGLRRQSSVADLGSNQPLQNPPNLRRNASTAANLDQFASNPVNPAPQSNWSFDEKLFVQTLYKVLTFTSNNSPV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G325950`
TK1151 ID	TkA07G325950
OH-1004 ID	LXL04_029581
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	94.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 89.294 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA07G325950`
位置	Chr07:81596496-81601735 (+)
描述	Similar to atad1a: ATPase family AAA domain-containing protein 1-A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_029581` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程 GO:0002092 positive regulation of receptor internalization 生物过程 GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程 GO:0007019 microtubule depolymerization 生物过程 GO:0009653 anatomical structure morphogenesis 生物过程 GO:0031117 positive regulation of microtubule depolymerization 生物过程 GO:0034214 protein hexamerization 生物过程 GO:0045047 protein targeting to ER 生物过程 GO:0051013 microtubule severing 生物过程 GO:0051647 nucleus localization 生物过程 GO:0090258 negative regulation of mitochondrial fission 生物过程 GO:0140570 extraction of mislocalized protein from mitochondrial outer membrane 生物过程
KEGG 基因交叉引用	cel:CELE_C24B5.2 mmu:67979 sce:YGR028W spo:2539116 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.419

排名 1 · TkA07G325950 · TK1151

线粒体0.204

排名 2 · TkA07G325950 · TK1151

细胞核0.185

排名 3 · TkA07G325950 · TK1151

过氧化物酶体0.178

排名 4 · TkA07G325950 · TK1151

细胞膜0.077

排名 5 · TkA07G325950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20720nSTAND3103-131 aa

PF00625Guanylate_kin104-129 aa

PF05496RuvB_N105-131 aa

PF01057Parvo_NS1105-128 aa

PF07724AAA_2106-140 aa

PF00004AAA107-141 aa

PF13191AAA_16230-270 aa

PF00005ABC_tran272-319 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G325950	`PF20720`	nSTAND3	103	131	0.0015	18.9
TkA07G325950	`PF00625`	Guanylate_kin	104	129	0.05	14.0
TkA07G325950	`PF05496`	RuvB_N	105	131	1.4e-05	25.6
TkA07G325950	`PF01057`	Parvo_NS1	105	128	0.00012	21.9
TkA07G325950	`PF07724`	AAA_2	106	140	0.022	15.5
TkA07G325950	`PF00004`	AAA	107	141	8.8e-42	143.4
TkA07G325950	`PF13191`	AAA_16	230	270	0.00024	22.4
TkA07G325950	`PF00005`	ABC_tran	272	319	0.014	16.7
TkA07G325950	`PF24933`	DUF7751	364	423	4.6e-29	101.3
TkA07G325950	`PF13481`	AAA_25	512	548	0.0078	16.6
TkA07G325950	`PF12775`	AAA_7	522	564	0.033	14.4
TkA07G325950	`PF02367`	TsaE	523	554	0.098	13.3
TkA07G325950	`PF20720`	nSTAND3	524	558	0.0015	18.9
TkA07G325950	`PF05673`	DUF815	525	565	0.16	11.8
TkA07G325950	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	527	601	0.12	12.9
TkA07G325950	`PF13401`	AAA_22	528	611	0.00014	22.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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