RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G304290
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 76355291-76355915 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

480 bp · TkA07G304290|TK1151|cDNA

ATGTCCTCTTTCAAGAGAGAGTTTGCGCACCTCAGAATTGCTCTAGAGTCCATACAGATTGCCACCAACAACTTTGCCGAATGCAATGTCCTTGGGGAAGGTGGATATGGTAAAGTTTACAAAGTGATGAAGAGAAGAAAAAAAATCCTTGTGTATGAGTATGCAGCAAACCAAAGCCTTGACTTTCATCTAGAGGACCGCACTTTCATGTGGATTCAACGTCTAAAGGTGTGTCTTGGGACTGCGCGTGGTTTGGAGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

480 bp · TkA07G304290|TK1151|CDS

ATGTCCTCTTTCAAGAGAGAGTTTGCGCACCTCAGAATTGCTCTAGAGTCCATACAGATTGCCACCAACAACTTTGCCGAATGCAATGTCCTTGGGGAAGGTGGATATGGTAAAGTTTACAAAGTGATGAAGAGAAGAAAAAAAATCCTTGTGTATGAGTATGCAGCAAACCAAAGCCTTGACTTTCATCTAGAGGACCGCACTTTCATGTGGATTCAACGTCTAAAGGTGTGTCTTGGGACTGCGCGTGGTTTGGAGTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

159 aa · TkA07G304290|TK1151|PROTEIN

MSSFKREFAHLRIALESIQIATNNFAECNVLGEGGYGKVYKVMKRRKKILVYEYAANQSLDFHLEDRTFMWIQRLKVCLGTARGLECLHNPRGKQRVLHCDIKSANILLDENWKAKIAYFCFSKYGPASQNRSYLITQAKTTLGFVGLLKAKLYLFTRI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G304290
TK1151 IDTkA07G304290
OH-1004 IDLXL04_037425
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)43.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.226 / OH-1004 15.975
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G304290
位置Chr07:76355291-76355915 (+)
描述Similar to CPK9: Calcium-dependent protein kinase 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g24400 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK2。 暂无已核实直接文献
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献
At3g04690 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037425 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50700
ath:AT3G20410
dosa:Os07g0515100
osa:4343373
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.603
排名 1 · TkA07G304290 · TK1151
细胞核0.233
排名 2 · TkA07G304290 · TK1151
细胞膜0.140
排名 3 · TkA07G304290 · TK1151
内质网0.095
排名 4 · TkA07G304290 · TK1151
线粒体0.068
排名 5 · TkA07G304290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase28-48 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr29-44 aa
PF24237INO80E36-53 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr42-128 aa
PF03109ABC145-131 aa
PF00069Pkinase49-137 aa
PF01636APH90-114 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G304290PF00069Pkinase28485.3e-1453.0
TkA07G304290PF07714PK_Tyr_Ser-Thr29442.5e-0937.6
TkA07G304290PF24237INO80E36530.1712.9
TkA07G304290PF07714PK_Tyr_Ser-Thr421282.5e-0937.6
TkA07G304290PF03109ABC1451310.07312.9
TkA07G304290PF00069Pkinase491375.3e-1453.0
TkA07G304290PF01636APH901140.1712.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK03拟南芥sp|Q9LK03|PERK2_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK231.100%Swiss-Prot中等置信
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR231.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FID9拟南芥sp|Q9FID9|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g3899041.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SR05拟南芥sp|Q9SR05|ANX1_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR132.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LK35拟南芥sp|Q9LK35|THE1_ARATH Receptor-like protein kinase THESEUS 144.300%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看