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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G284760
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 71441972-71447377 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2918 bp · TkA07G284760|TK1151|cDNA

AAATTTCCCGGTGTTAAAGTCGATCAGAAAGTCAGAAACCAACAAAATCGGCAAAAAGCAAGAGGGAATCTAGAGATAAACACAACCTCAGCAAACCTGACTGTAACATGTAACATGGTGATCGTTTCCCTGCCTTAAGCATCTTGCTTGGTGGGGTTTCTGTTTTTTCTTCTTTTTATTTTTATAAAATCTTTTGCCGGTTCAAAAAAAAAAAAAGCAAACCTGACTCTCGAACTCTCTTCCTCGCTCGTCGGAAACGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2130 bp · TkA07G284760|TK1151|CDS

ATGTCTCATATCAGAGAGTTTGAACACCTCAAAATAACGCTAGAAGCTATAAAATCTGCAACCAACAACTTTGCTCCTGAGAATTGTATAGGGAGAGGAGGATTTGGGAATGTGTATAAAGGAGAAATTGTCCATTCCAGGGGCCGTTCCATGGTTGCTTTTAAGCGCTTAGACTGTGCATTTGGGCAAGGAAACCCAGAGTTTTGGAAGGAAATCACAATGCTATCGATTTACAAGCATACAAATTTGGTTTGTCTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

709 aa · TkA07G284760|TK1151|PROTEIN

MSHIREFEHLKITLEAIKSATNNFAPENCIGRGGFGNVYKGEIVHSRGRSMVAFKRLDCAFGQGNPEFWKEITMLSIYKHTNLVCLLGFCDESDEKILVYEYASKRSLDLHLDSNDLTWTQRLKICIGVARGLSYLHNSETNVRVLHRDIKSSNILLDENWNAKLSDFGLSKFARADKFTFLFTCAVGTLGYCDPLYAETGFLTKESDIYSLGVVLFEVLCGRLCIDKKDGHPLTGLARHCYELNKVDSIIFSSMVDEIN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G284760
TK1151 IDTkA07G284760
OH-1004 IDLXL04_029207
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G284760
位置Chr07:71441972-71447377 (+)
描述Similar to TPR2: Protein TOPLESS-RELATED PROTEIN 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27030 转录共抑制因子。 暂无已核实直接文献
At3g16830 转录共抑制因子。 暂无已核实直接文献
At1g15750 转录共抑制因子。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0162100 转录核心抑制因子，参与分支形成调控，推测通过抑制主分支形成并促进次分支形成。
OsLIS-L1 encoding a lissencephaly type-1-like protein with WD40 repeats is required for plant height and male gametophyte formation in rice.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1532-7
Os01g0254100 可能是独脚金内酯信号通路的下游调控因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029207 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009867 jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010072 primary shoot apical meristem specification 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0062208 positive regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15750
ath:AT3G16830
ath:AT5G27030
dosa:Os01g0254100
dosa:Os08g0162100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.455
排名 1 · TkA07G284760 · TK1151
细胞核0.324
排名 2 · TkA07G284760 · TK1151
细胞膜0.307
排名 3 · TkA07G284760 · TK1151
溶酶体／液泡0.067
排名 4 · TkA07G284760 · TK1151
高尔基体0.061
排名 5 · TkA07G284760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase27-290 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr28-292 aa
PF23409Beta-prop_EML74-100 aa
PF23389Beta-prop_WDR19_1st87-144 aa
PF03109ABC193-176 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz115-150 aa
PF12894ANAPC4_WD40116-155 aa
PF12330Haspin_kinase118-174 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G284760PF00069Pkinase272902.4e-42145.9
TkA07G284760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr282924.3e-38131.8
TkA07G284760PF23409Beta-prop_EML741000.001418.9
TkA07G284760PF23389Beta-prop_WDR19_1st871440.1511.8
TkA07G284760PF03109ABC1931760.211.5
TkA07G284760PF24807WD40_CDC20-Fz1151505.1e-1453.0
TkA07G284760PF12894ANAPC4_WD401161550.000123.2
TkA07G284760PF12330Haspin_kinase1181740.02514.3
TkA07G284760PF12523DUF37251701920.212.7
TkA07G284760PF12523DUF37252693060.212.7
TkA07G284760PF23775Beta-prop_RIG_2nd3684112.2e-0628.0
TkA07G284760PF24780WD40_MABP1-WDR62_1st3924530.0002721.0
TkA07G284760PF24814WD40_Prp193985486.7e-1865.5
TkA07G284760PF24807WD40_CDC20-Fz4025395.1e-1453.0
TkA07G284760PF23869Beta-prop_WDR75_1st4115390.00119.2
TkA07G284760PF24817WD40_WDHD1_1st4126321.7e-1867.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84JM4拟南芥sp|Q84JM4|TPR3_ARATH Topless-related protein 357.400%Swiss-Prot高置信
Q9LRZ0拟南芥sp|Q9LRZ0|TPR2_ARATH Topless-related protein 255.000%Swiss-Prot高置信
Q94AI7拟南芥sp|Q94AI7|TPL_ARATH Protein TOPLESS53.900%Swiss-Prot高置信
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 146.400%Swiss-Prot中等置信
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970046.100%Swiss-Prot中等置信
Q0J7U6水稻sp|Q0J7U6|TPR2_ORYSJ Protein TOPLESS-RELATED PROTEIN 262.700%Swiss-Prot高置信
Q5NBT9水稻sp|Q5NBT9|TPR1_ORYSJ Protein TPR156.400%Swiss-Prot高置信

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