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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G272890
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 68215146-68221249 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3062 bp · TkA07G272890|TK1151|cDNA

CTCTTCTTCACATGCTTTCTCTCTCTACATTCTCAATGCTCCATTGATTCAACTCTTTGTTTACTCATTGACTGCTTATTTCCACGAGCCACTTTACAGATCTACACAGAAAGAATAGTCTTCTTCAATATGAATTTCAAGAATTGAATAACCGGTATCCCTCATATACGCCAAGACCTACAAATTCATTGAATACAAACATATCTCATGTTTATCCAACTGTTATAAACTGGTGTAAAAAATGGAAGACGACAATGCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

2664 bp · TkA07G272890|TK1151|CDS

ATGGAAGACGACAATGCCGAGGATATGGAGGTCGAAGCCTTGTCTTCAATGTGGCCGGAAGACATTGATGCCGCCGGAAAAAAGTTCAACGTGGAAACACCAGGCGCCGATCAAGATTTATTAGAGGACGTCACTATCATCGAAGAGCCAACAATCGTGGATTTTAAACGACTACTCGAGCTTACAAATTATAGCGAAAAGGGGTCGTCTCAGTTATCTTACCTCGTGAAAAACTGGGAATGGAAACAAGAAAACGCCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

887 aa · TkA07G272890|TK1151|PROTEIN

MEDDNAEDMEVEALSSMWPEDIDAAGKKFNVETPGADQDLLEDVTIIEEPTIVDFKRLLELTNYSEKGSSQLSYLVKNWEWKQENAVRLLREELETLSKQQQEVELKKLEILEEHRFEDASYGGDKRPISILDEVYEIVPNAPNPKRRNDVIYQGQRLEIDGEDDTETVKYWKQRALNLETLLQLSINREQILMEKLEESIEKLKKQSSPVEELSQILKRADNFLHFVLQNAPVVIGHQDKELRYRFIYNHFPSLGEQDI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G272890
TK1151 IDTkA07G272890
OH-1004 IDLXL04_029115
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.436 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G272890
位置Chr07:68215146-68221249 (+)
描述Similar to AHK5: Histidine kinase 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10720 作为组氨酸激酶发挥作用，并将应激信号传递至下游 MAPK 级联。
AHK5 histidine kinase regulates root elongation through an ETR1-dependent abscisic acid and ethylene signaling pathway in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcl065
The histidine kinase AHK5 integrates endogenous and environmental signals in Arabidopsis guard cells.2008 · DOI: 10.1371/journal.pone.0002491
Arabidopsis histidine kinase 5 regulates salt sensitivity and resistance against bacterial and fungal infection.2012 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2011.04033.x
Modulation of ROS production and hormone levels by AHK5 during abiotic and biotic stress signaling.2012 · DOI: 10.4161/psb.20692

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YFR6 与细菌双组分调控器相关的细胞分裂素受体。 暂无已核实直接文献
Os06g0654300 与细菌双组分调控器相关的细胞分裂素受体。 暂无已核实直接文献
Os01g0923700 与细菌双组分调控器相关的细胞分裂素受体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029115 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0070301 cellular response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0071219 cellular response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0071732 cellular response to nitric oxide 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G10720
dosa:Os01g0923700
dosa:Os06g0654300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.492
排名 1 · TkA07G272890 · TK1151
细胞核0.332
排名 2 · TkA07G272890 · TK1151
细胞膜0.158
排名 3 · TkA07G272890 · TK1151
高尔基体0.102
排名 4 · TkA07G272890 · TK1151
内质网0.085
排名 5 · TkA07G272890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00512HisKA87-103 aa
PF06050HGD-D167-223 aa
PF00512HisKA192-208 aa
PF08448PAS_4230-336 aa
PF17202sCache_3_3289-334 aa
PF06050HGD-D341-399 aa
PF08659KR361-411 aa
PF00512HisKA372-435 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G272890PF00512HisKA871032.6e-1866.5
TkA07G272890PF06050HGD-D1672232.38.3
TkA07G272890PF00512HisKA1922082.6e-1866.5
TkA07G272890PF08448PAS_42303360.1213.3
TkA07G272890PF17202sCache_3_32893340.08114.0
TkA07G272890PF06050HGD-D3413992.38.3
TkA07G272890PF08659KR3614111.59.4
TkA07G272890PF00512HisKA3724352.6e-1866.5
TkA07G272890PF02518HATPase_c4816134.8e-2898.5
TkA07G272890PF08659KR5335461.59.4
TkA07G272890PF08659KR5756021.59.4
TkA07G272890PF00072Response_reg7398067.4e-2175.1
TkA07G272890PF08448PAS_48058270.1213.3
TkA07G272890PF00072Response_reg8318777.4e-2175.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3S4A7拟南芥sp|Q3S4A7|AHK5_ARATH Histidine kinase 559.100%Swiss-Prot高置信
A2YFR6水稻sp|A2YFR6|OHK1_ORYSI Probable histidine kinase 152.700%Swiss-Prot高置信
A3BE68水稻sp|A3BE68|OHK1_ORYSJ Probable histidine kinase 152.500%Swiss-Prot高置信
A1A696水稻sp|A1A696|OHK3_ORYSJ Probable histidine kinase 329.200%Swiss-Prot低置信

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