TkA07G226620 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G226620

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 56798152-56800824 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1274 bp · TkA07G226620|TK1151|cDNA

GTTTCTCTTTATGCATTGAAACTCCAAAGAGCTAGATTGCAATCTTCCAACGTCAACAATACAATCGCATCAAGATCTGATATCCTACATCCTACTTGTTGGGCATATTATGAGCATCCGTGCCCCCTTTTGCGCCTCTGGACCTCTCCACTCCAACCTCCCGTCCAGGAATAACAATGTTGTTGGTGCCGACAATTTTGCAATTGAAAGTCATAAGATATGCTACTCAATCAACACGGAAAAGGGGAAGCTGATTCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

786 bp · TkA07G226620|TK1151|CDS

ATGAGCATCCGTGCCCCCTTTTGCGCCTCTGGACCTCTCCACTCCAACCTCCCGTCCAGGAATAACAATGTTGTTGGTGCCGACAATTTTGCAATTGAAAGTCATAAGATATGCTACTCAATCAACACGGAAAAGGGGAAGCTGATTCCGATTCTAAACGATTGTTCCCTCAAGATTCCTTCTGGCCAGTTTTGGATGCTGCTTGGCCCTAATGGATGTGGGAAATCAACTCTTTTGAAGATCTTGGCAGGTCTGCTAAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

261 aa · TkA07G226620|TK1151|PROTEIN

MSIRAPFCASGPLHSNLPSRNNNVVGADNFAIESHKICYSINTEKGKLIPILNDCSLKIPSGQFWMLLGPNGCGKSTLLKILAGLLSPTDGFVHVRKPRSFVFQNPDHQVVMPTVEADVAFGLGGFSLTNEETKFRVAKALTAVGMYDYLQRPVQTLSGGQKQRVAIAGALVQQCKVLLLDELTTFLDQTDQIGVIKAVKKTLSSCEDVSALWVTHRLEEMEYADGAVYMEDGRVVMHGKPSTIMDFIEARKASYTKTIN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G226620`
TK1151 ID	TkA07G226620
OH-1004 ID	LXL04_028817
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G226620

位置 Chr07:56798152-56800824 (+)

描述 Similar to ABCI10: ABC transporter I family member 10

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g33460`	ABC转运蛋白I家族成员10。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028817 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0043190 ATP-binding cassette (ABC) transporter complex 细胞组分

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能

GO:0042626 ATPase-coupled transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G33460

cac:CA_C3102

cdf:CD630_01000

ctc:CTC_02576

pdc:CDIF630_00170

tte:TTE2261

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.352

排名 1 · TkA07G226620 · TK1151

细胞质0.301

排名 2 · TkA07G226620 · TK1151

质体0.207

排名 3 · TkA07G226620 · TK1151

细胞核0.185

排名 4 · TkA07G226620 · TK1151

过氧化物酶体0.039

排名 5 · TkA07G226620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02456Adeno_IVa223-59 aa

PF00005ABC_tran52-184 aa

PF13514AAA_2753-107 aa

PF13481AAA_2559-79 aa

PF13191AAA_1660-93 aa

PF20703nSTAND161-116 aa

PF02463SMC_N62-104 aa

PF03215Rad1762-87 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G226620	`PF02456`	Adeno_IVa2	23	59	0.1	12.1
TkA07G226620	`PF00005`	ABC_tran	52	184	1.3e-29	104.3
TkA07G226620	`PF13514`	AAA_27	53	107	0.0066	16.8
TkA07G226620	`PF13481`	AAA_25	59	79	0.13	12.6
TkA07G226620	`PF13191`	AAA_16	60	93	0.25	12.6
TkA07G226620	`PF20703`	nSTAND1	61	116	0.1	12.9
TkA07G226620	`PF02463`	SMC_N	62	104	1.1e-06	28.9
TkA07G226620	`PF03215`	Rad17	62	87	0.0023	18.6
TkA07G226620	`PF13555`	AAA_29	62	89	0.0026	18.2
TkA07G226620	`PF03193`	RsgA_GTPase	62	84	0.11	13.0
TkA07G226620	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	62	87	0.19	12.2
TkA07G226620	`PF13401`	AAA_22	63	99	0.03	15.4
TkA07G226620	`PF13175`	AAA_15	64	95	0.0088	16.3
TkA07G226620	`PF01637`	ATPase_2	64	86	0.29	11.6
TkA07G226620	`PF13173`	AAA_14	65	87	0.2	12.4
TkA07G226620	`PF13304`	AAA_21	66	133	1.8e-09	38.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8H1R4`	拟南芥	sp\|Q8H1R4\|AB10I_ARATH ABC transporter I family member 10	66.300%	Swiss-Prot	高置信

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