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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G213750
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 53730625-53741307 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4638 bp · TkA07G213750|TK1151|cDNA

ATTGAATATCGTGAATCATGATCGAGTGAACAACCCAGAATTGCCTTACAATGCTTCTGTTACTCTTGAGCGCATGATTTGCAAATTTTAACAGAGAAACGAAATAGGCGACTTTGGCCCCTGATCGAAGCATCGAAGAAAGCATATCCGAGTCTGACTATTCAACTCTCTCCATAAGAAAGCATATTCTCCTGGAAAGAAGCTCATATCCGATTTTTTGATGCGGCCGTGCTCGTGCGGCGCCTAATGTCCAAGAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2526 bp · TkA07G213750|TK1151|CDS

ATGAAGCGTTTTGTGTATGTCAATGACGACGATTCCTCCCATGAGCTTTACTGTGATAACCGTATATCCAACAGAAAGTACACATTGCTAAATTTTCTCCCCAAAAATCTATGGGAACAGTTCAGCCGGTTCATGAACCAATACTTTTTGTTGATCGCTTGTCTTCAACTATGGCCGCTTATAACGCCAGTAAACCCCGCTAGTACGTGGGGTCCGCTCATATTTATCTTCGCAGTCTCAGCAACAAAAGAGGCATGGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

841 aa · TkA07G213750|TK1151|PROTEIN

MKRFVYVNDDDSSHELYCDNRISNRKYTLLNFLPKNLWEQFSRFMNQYFLLIACLQLWPLITPVNPASTWGPLIFIFAVSATKEAWDDYNRYLSDKKANEKQVWVVRQGSKKLIQAQEIHVGNLVWLRENDEVPCDLVLLGTSEPQGVCYVETAALDGETDLKTRNIPPACMGIDSELLHKIKGVMECPLPDKDIRRFDANVRLFPPFLDNDVCPLSIKNTILQSCYLRNTEWACGVAVYTGNETKMGMSRGVAEPKLTA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G213750
TK1151 IDTkA07G213750
OH-1004 IDLXL04_028783
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.098 / OH-1004 75.361
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G213750
位置Chr07:53730625-53741307 (+)
描述Similar to ALA2: Phospholipid-transporting ATPase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44240 参与磷脂的运输。
Intracellular targeting signals and lipid specificity determinants of the ALA/ALIS P4-ATPase complex reside in the catalytic ALA alpha-subunit.2010 · DOI: 10.1091/mbc.e09-08-0656

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028783 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007030 Golgi organization 生物过程
GO:0030335 positive regulation of cell migration 生物过程
GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程
GO:0045332 phospholipid translocation 生物过程
GO:0061092 positive regulation of phospholipid translocation 生物过程
GO:0140331 aminophospholipid translocation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G44240
bta:317692
hsa:10396
hsa:79895
mmu:11980
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.388
排名 1 · TkA07G213750 · TK1151
内质网0.329
排名 2 · TkA07G213750 · TK1151
细胞质0.257
排名 3 · TkA07G213750 · TK1151
高尔基体0.232
排名 4 · TkA07G213750 · TK1151
溶酶体／液泡0.117
排名 5 · TkA07G213750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16209PhoLip_ATPase_N5-70 aa
PF10537WAC_Acf1_DNA_bd76-109 aa
PF00702Hydrolase86-115 aa
PF00122E1-E2_ATPase99-163 aa
PF16212PhoLip_ATPase_C274-288 aa
PF13637Ank_4335-351 aa
PF00702Hydrolase378-391 aa
PF13246Cation_ATPase429-615 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G213750PF16209PhoLip_ATPase_N5701.3e-2589.6
TkA07G213750PF10537WAC_Acf1_DNA_bd761090.212.8
TkA07G213750PF00702Hydrolase861157e-1350.1
TkA07G213750PF00122E1-E2_ATPase991632.3e-0731.3
TkA07G213750PF16212PhoLip_ATPase_C2742882.3e-1764.3
TkA07G213750PF13637Ank_43353510.001319.7
TkA07G213750PF00702Hydrolase3783917e-1350.1
TkA07G213750PF13246Cation_ATPase4296153.9e-1866.6
TkA07G213750PF08282Hydrolase_34665002.3e-0525.0
TkA07G213750PF10537WAC_Acf1_DNA_bd5295480.212.8
TkA07G213750PF00702Hydrolase5576967e-1350.1
TkA07G213750PF13344Hydrolase_66026430.1412.9
TkA07G213750PF13637Ank_46166530.001319.7
TkA07G213750PF10537WAC_Acf1_DNA_bd7087360.212.8
TkA07G213750PF00702Hydrolase7257647e-1350.1
TkA07G213750PF08282Hydrolase_37357682.3e-0525.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P98205拟南芥sp|P98205|ALA2_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 284.400%Swiss-Prot高置信

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