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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G176520
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 45139199-45141386 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1882 bp · TkA07G176520|TK1151|cDNA

TGGCAATGGTAGCCTGAAAATATATTTCCAAATACAAAAATACTGTGTTTGTAGAGGGGAAGGGTCGATGTTTCCAGATTGGGGTTTTTTTTGAACGTGAAACCGCTCTTTCAAGAGATTTTGCCCTCCCTTCCTCTACGGTATTGGTCGTCTCATGATCTGACCTCCGTTATCTCTCGAAATCGAAACCCCGAAGCAAACCCTTCTAAACTTTTCATCAAATCCCATTTGAAACCCAGTCTCCAAATTCTCAATGTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1338 bp · TkA07G176520|TK1151|CDS

ATGTCTTCGTCCACTGTCTCAATCACTGCGAACCCTTCTGGTGCTGTGCTGCGTAGACCTTTACTCACCGGTGAGAAAAAATCCGGCGTAGATTTGGGCGGCAGTGATGGAATTGAAGCATCTGCGCGAAGCGGCGGCGAAACTAGCAGAGGGAAAGATCTCAGCCATTCATTCAGAGCAGGAGCAGAAACCGTTCTCGAAAGATCTAGAGACGCTGTTCAAACGAAGAACCCCTTACCCACGAATTCAACCACCAAGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

445 aa · TkA07G176520|TK1151|PROTEIN

MSSSTVSITANPSGAVLRRPLLTGEKKSGVDLGGSDGIEASARSGGETSRGKDLSHSFRAGAETVLERSRDAVQTKNPLPTNSTTKTRKRTADKKVSVPSTTKAPWKRAVSVLMKNFALLVILLLLAQMIRKLAFNQGSGFDSILIPSSDYESQFAEVEARLKSTTQAMQFQVDVMNQKMVEEIVGLKTELTKRIADKGAELSSRVNDLDGKFQTMKKTLTTDWLSRDEFNRFVEDFKSKKGMDDVNKLNLDEVRAFAKE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G176520
TK1151 IDTkA07G176520
OH-1004 IDLXL04_028633
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.978 / OH-1004 74.150
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G176520
位置Chr07:45139199-45141386 (-)
描述Similar to SUN1: SUN domain-containing protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04990 含有 SUN 蛋白的多元复合物的组成部分，也称为 LINC 复合物，它通过为细胞骨架丝提供多功能的外核膜附着位点来连接核骨架和细胞骨架。
Dynamics of Arabidopsis SUN proteins during mitosis and their involvement in nuclear shaping.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04523.x
Absence of SUN1 and SUN2 proteins in Arabidopsis thaliana leads to a delay in meiotic progression and defects in synapsis and recombination.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12730
Plant nuclear shape is independently determined by the SUN-WIP-WIT2-myosin XI-i complex and CRWN1.2015 · DOI: 10.1080/19491034.2014.1003512
At3g10730 含有 SUN 蛋白的多元复合物的组成部分，也称为 LINC 复合物，它通过为细胞骨架丝提供多功能的外核膜附着位点来连接核骨架和细胞骨架。
Dynamics of Arabidopsis SUN proteins during mitosis and their involvement in nuclear shaping.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04523.x
Absence of SUN1 and SUN2 proteins in Arabidopsis thaliana leads to a delay in meiotic progression and defects in synapsis and recombination.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12730
Plant nuclear shape is independently determined by the SUN-WIP-WIT2-myosin XI-i complex and CRWN1.2015 · DOI: 10.1080/19491034.2014.1003512

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028633 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006997 nucleus organization 生物过程
GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程
GO:0051291 protein heterooligomerization 生物过程
GO:0070197 meiotic attachment of telomere to nuclear envelope 生物过程
GO:0090435 protein localization to nuclear envelope 生物过程
GO:2000769 regulation of establishment or maintenance of cell polarity regulating cell shape 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005637 nuclear inner membrane 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G10730
ath:AT5G04990
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.541
排名 1 · TkA07G176520 · TK1151
细胞核0.292
排名 2 · TkA07G176520 · TK1151
细胞质0.135
排名 3 · TkA07G176520 · TK1151
高尔基体0.131
排名 4 · TkA07G176520 · TK1151
细胞膜0.077
排名 5 · TkA07G176520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03938OmpH150-244 aa
PF02961SAM_BAF167-225 aa
PF19788DUF6272241-287 aa
PF07738Sad1_UNC311-440 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G176520PF03938OmpH1502440.1513.0
TkA07G176520PF02961SAM_BAF1672250.02715.7
TkA07G176520PF19788DUF62722412870.03714.4
TkA07G176520PF07738Sad1_UNC3114401.2e-38132.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FF75拟南芥sp|Q9FF75|SUN1_ARATH SUN domain-containing protein 143.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SG79拟南芥sp|Q9SG79|SUN2_ARATH SUN domain-containing protein 242.900%Swiss-Prot中等置信

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