RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G161300
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 41448993-41451351 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2023 bp · TkA07G161300|TK1151|cDNA

CAATTAATAAAATAGATAAAACTCGAAAACTCCCTTTCTGTTGGCCACTTATATCGAGCAAATGCAAAACTTTAAAAAGAAAAGAAAGAAAAACTCAGGCGCCGAAGACCAAATGTATCATTCCCCGTCTTCTTTCTAAAGTCTCACCGTGTTTTCATCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCGAACCCAACAACAAAAACCTCCACTCACAACTCACAAGCATAATTAACTCCATCGTTTTCCACAATCATCCATTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1221 bp · TkA07G161300|TK1151|CDS

ATGTTGGAGGGTCCGAATCCGAATATCACGGGATTGATCGGCCTAAACAGCAACTTTCAAGATACGACCCAAGGATTCTACCATAAACTCGATGACAACATGTCCATTGACAGTTTCAATAGCTTGCATATGAGCAACAATGGCGGATCAATAGCATTCTCCATCGTCAACAGTAGCGTAGACTCAAACGGCTCCAACACTCTGATGTTACCTCACCATGGTCCGAACCCATACACCGATGGCCATAGTGCTAACAACAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

406 aa · TkA07G161300|TK1151|PROTEIN

MLEGPNPNITGLIGLNSNFQDTTQGFYHKLDDNMSIDSFNSLHMSNNGGSIAFSIVNSSVDSNGSNTLMLPHHGPNPYTDGHSANNRGRVAHGLTTDALAQALLDPCFPTKGLQHYEKWTIELKKLNMGPAFAQGAFGKLYKGTYNGEDVAIKLLEKPEDNLDRANLMEQQFQQEVKMLARLKHPNIVRFIGGCYKPMVWCIVTEYAKGGSVRQFLNRRQNRAVPLKLAVKQAVDVAKGMEYVHGLGLIHRDLKSDNLLI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G161300
TK1151 IDTkA07G161300
OH-1004 IDLXL04_028478
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G161300
位置Chr07:41448993-41451351 (+)
描述Similar to STY13: Serine/threonine-protein kinase STY13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24360 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可磷酸化丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基上的蛋白质。
Genome-wide analysis and experimentation of plant serine/ threonine/tyrosine-specific protein kinases.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-4109-7
At1g62400 丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶，参与响应CO(2)的气孔运动控制。 暂无已核实直接文献
At4g38470 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
At4g35780 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774
At2g17700 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，可特异性磷酸化细胞质中可裂解前序列内的叶绿体前体蛋白。
A protein kinase family in Arabidopsis phosphorylates chloroplast precursor proteins.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m606580200
The cytosolic kinases STY8, STY17, and STY46 are involved in chloroplast differentiation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182774

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028478 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010344 seed oilbody biogenesis 生物过程
GO:0045995 regulation of embryonic development 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0071244 cellular response to carbon dioxide 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:2000030 regulation of response to red or far red light 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G62400
ath:AT2G17700
ath:AT2G24360
ath:AT4G35780
ath:AT4G38470
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.517
排名 1 · TkA07G161300 · TK1151
细胞膜0.426
排名 2 · TkA07G161300 · TK1151
细胞核0.262
排名 3 · TkA07G161300 · TK1151
高尔基体0.056
排名 4 · TkA07G161300 · TK1151
内质网0.035
排名 5 · TkA07G161300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase120-209 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr131-380 aa
PF03109ABC1132-155 aa
PF00069Pkinase134-378 aa
PF13095FTA2134-167 aa
PF17667Pkinase_fungal141-187 aa
PF03109ABC1171-275 aa
PF13095FTA2180-259 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G161300PF12330Haspin_kinase1202090.004616.8
TkA07G161300PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1313806e-67226.4
TkA07G161300PF03109ABC11321550.0001421.9
TkA07G161300PF00069Pkinase1343788.1e-55186.8
TkA07G161300PF13095FTA21341670.0514.0
TkA07G161300PF17667Pkinase_fungal1411870.01215.0
TkA07G161300PF03109ABC11712750.0001421.9
TkA07G161300PF13095FTA21802590.0514.0
TkA07G161300PF17667Pkinase_fungal2423160.01215.0
TkA07G161300PF01636APH2462740.1512.5
TkA07G161300PF12330Haspin_kinase2502800.004616.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZQ31拟南芥sp|Q9ZQ31|STY13_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY1368.800%Swiss-Prot高置信
Q2MHE4拟南芥sp|Q2MHE4|HT1_ARATH Serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT148.100%Swiss-Prot中等置信
F4JTP5拟南芥sp|F4JTP5|STY46_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY4648.700%Swiss-Prot中等置信
Q8RWL6拟南芥sp|Q8RWL6|STY17_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY1743.800%Swiss-Prot中等置信
O22558拟南芥sp|O22558|STY8_ARATH Serine/threonine-protein kinase STY843.100%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看