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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G156820
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 40259491-40268523 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3117 bp · TkA07G156820|TK1151|cDNA

GGCAAACTCCGTCCTTCCCAAGCCTACTCTCCAGTCTCCACCCACCCCATCGGCACTATAAATAAACCACCCTCTCTTCTCACCGCTACCATTTACTTCGCTCCTCTGTTCTTCTCACCTACTCTCCGCTTTTTTGCCGCAAAATCTTCCATCACTCCTCTAATCGGAATTTACTCAGCGGTTTGTGATATACAGATATGAAAGAAGATGCGCCAAATGATTTGCAAAAAAGCTATTTCGATGTGTTGGGATTATGTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2841 bp · TkA07G156820|TK1151|CDS

ATGAAAGAAGATGCGCCAAATGATTTGCAAAAAAGCTATTTCGATGTGTTGGGATTATGTTGTTCATCGGAGGTACCACTTATCGAGAAGATCCTTAAACCTCTTGAAGGTGTTCACCATGTCTCCGTCATCGTTCCTTCCAGAACTGTAATTGTGCTTCACGACGCGGCCCTCATTTCTCAGTTTCAAATCGTTAAGGCGCTAAACCAAGCACGATTGGAAGCAAATGTGAGGATGAAAGGAGTTCAAAGCTACGGGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

946 aa · TkA07G156820|TK1151|PROTEIN

MKEDAPNDLQKSYFDVLGLCCSSEVPLIEKILKPLEGVHHVSVIVPSRTVIVLHDAALISQFQIVKALNQARLEANVRMKGVQSYGNKWPSPYAVVCGVLLLLSFLKYVYSPFKWLALGAVAVGIIPLTLKAVASLRIFRFDINVLMLIAVGGSIFLKDYWEAGTIVFLLTISEWLETRASHKATAVMSSLMSIAPQKAVLADTGEEVNANEVKVNTRLAVKAGTMIPIDGIVVEGKCEVDEKALTGESFPVCKQVDSIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G156820
TK1151 IDTkA07G156820
OH-1004 IDLXL04_028444
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G156820
位置Chr07:40259491-40268523 (-)
描述Similar to HMA2: Cadmium/zinc-transporting ATPase HMA2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30110 在锌的运输和稳态中起重要作用。
P-type ATPase heavy metal transporters with roles in essential zinc homeostasis in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.020487
At2g19110 参与镉/锌的运输。 暂无已核实直接文献
UniProt: P0CW78 在异源系统中，参与镉和铅的转运，但不参与锌的转运。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0700700 锌/镉转运蛋白，在促进锌和镉从根向茎的转运中起关键作用。
Cadmium retention in rice roots is influenced by cadmium availability, chelation and translocation.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02299.x
Mutations in rice (Oryza sativa) heavy metal ATPase 2 (OsHMA2) restrict the translocation of zinc and cadmium.2012 · DOI: 10.1093/pcp/pcr166
The OsHMA2 transporter is involved in root-to-shoot translocation of Zn and Cd in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2012.02527.x
Preferential delivery of zinc to developing tissues in rice is mediated by P-type heavy metal ATPase OsHMA2.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.216564
Os07g0232900 根特异性镉 (Cd) 转运蛋白，可介导根液泡中的 Cd 外排。
Gene limiting cadmium accumulation in rice.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005396107
OsHMA3, a P1B-type of ATPase affects root-to-shoot cadmium translocation in rice by mediating efflux into vacuoles.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03459.x
Overexpression of OsHMA3 enhances Cd tolerance and expression of Zn transporter genes in rice.2014 · DOI: 10.1093/jxb/eru340
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028444 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006829 zinc ion transport 生物过程
GO:0006882 intracellular zinc ion homeostasis 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0015691 cadmium ion transport 生物过程
GO:0030001 metal ion transport 生物过程
GO:0032025 response to cobalt ion 生物过程
GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0071585 detoxification of cadmium ion 生物过程
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19110
ath:AT4G30110
dosa:Os06g0700650
dosa:Os07g0232900
osa:4342783
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.321
排名 1 · TkA07G156820 · TK1151
细胞膜0.288
排名 2 · TkA07G156820 · TK1151
细胞质0.220
排名 3 · TkA07G156820 · TK1151
高尔基体0.163
排名 4 · TkA07G156820 · TK1151
溶酶体／液泡0.120
排名 5 · TkA07G156820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00403HMA14-70 aa
PF00122E1-E2_ATPase202-292 aa
PF00702Hydrolase389-603 aa
PF00403HMA519-533 aa
PF13419HAD_2524-598 aa
PF08282Hydrolase_3526-558 aa
PF00122E1-E2_ATPase536-557 aa
PF08282Hydrolase_3584-627 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G156820PF00403HMA14700.0002122.3
TkA07G156820PF00122E1-E2_ATPase2022929.9e-2277.4
TkA07G156820PF00702Hydrolase3896036.3e-29102.4
TkA07G156820PF00403HMA5195330.0002122.3
TkA07G156820PF13419HAD_25245980.02415.3
TkA07G156820PF08282Hydrolase_35265580.1712.3
TkA07G156820PF00122E1-E2_ATPase5365579.9e-2277.4
TkA07G156820PF08282Hydrolase_35846270.1712.3
TkA07G156820PF00403HMA8258400.0002122.3
TkA07G156820PF08282Hydrolase_38628980.1712.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZW4拟南芥sp|Q9SZW4|HMA2_ARATH Cadmium/zinc-transporting ATPase HMA267.000%Swiss-Prot高置信
O64474拟南芥sp|O64474|HMA4_ARATH Putative cadmium/zinc-transporting ATPase HMA467.500%Swiss-Prot高置信
P0CW78拟南芥sp|P0CW78|HMA3B_ARATH Cadmium/zinc-transporting ATPase HMA362.200%Swiss-Prot高置信
A3BF39水稻sp|A3BF39|HMA2_ORYSJ Cadmium/zinc-transporting ATPase HMA262.800%Swiss-Prot高置信
Q8H384水稻sp|Q8H384|HMA3_ORYSJ Cadmium/zinc-transporting ATPase HMA356.500%Swiss-Prot高置信

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