TkA07G151720 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G151720

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 39024852-39031055 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3226 bp · TkA07G151720|TK1151|cDNA

ATAAAACCATGTAAAAACCCGACCCGGTTACGATTGGGATTTCCAGCTCAGCTTTGGCCCGTCCTCGGGCCTTAATGGTGTCGACTGCGCAAAAATCATAATTCTAACCTTTACTTTAACCGGAGTTTATCGGCAATCGGCGATCCCCTACCGTCTCTGATCTTTCTCTGCCCAATTTCACGCACACAACACCAGAAACATATATACGCACATAGTGATCAACAAACAGAGGTTGTTCGTCTTTGAATTTGATAAATTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2499 bp · TkA07G151720|TK1151|CDS

ATGTGGTTTTCGTTCTGGAGATCCAAAGATCGATTCACTTTGGATGAACTCAGGTATTTAACTGACCAACTGATGAAAATTCAAGTTGTTAATGAAGTTAACAAGGATTTTGTGATAGAGGCACTGAGATCAATTGCAGAGTTGATAACATATGGCGACCAGCATGATGCCAATTTCTTTGAGTTTTTTATGGAGAAACAAATCATGGGGGAATTTGTACGGATATTAAAGATCAGTAAGAATGTGATTGTTTCAGTTCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

832 aa · TkA07G151720|TK1151|PROTEIN

MWFSFWRSKDRFTLDELRYLTDQLMKIQVVNEVNKDFVIEALRSIAELITYGDQHDANFFEFFMEKQIMGEFVRILKISKNVIVSVQLLQTMSIMIQNLKSDHSIYYLFSNEHINALITYSFDFRNEELLSYYISFLRAISGKLNKNTISLLVKTQNEDVVAFPLYVEAIRFAFHEEGMIRTAVRALTLNIYHVGDVVVNKYISSNPHADYFLNLVKFFREHCISLNGMVSPTTESQGTESTSSIFSAVDEIEDNLYYLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G151720`
TK1151 ID	TkA07G151720
OH-1004 ID	LXL04_028397
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G151720

位置 Chr07:39024852-39031055 (+)

描述 Similar to TT9: Protein TRANSPARENT TESTA 9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g28430`	通过液泡处的膜融合参与膜运输和液泡发育。	GFS9/TT9 contributes to intracellular membrane trafficking and flavonoid accumulation in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12637

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028397 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000423 mitophagy 生物过程

GO:0001708 cell fate specification 生物过程

GO:0006914 autophagy 生物过程

GO:0007034 vacuolar transport 生物过程

GO:0008333 endosome to lysosome transport 生物过程

GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程

GO:0009718 anthocyanin-containing compound biosynthetic process 生物过程

GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程

GO:0016197 endosomal transport 生物过程

GO:0031648 protein destabilization 生物过程

GO:0032434 regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

GO:0032435 negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G28430

ddi:DDB_G0289943

dme:Dmel_CG12753

hsa:23274

mmu:74374

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.485

排名 1 · TkA07G151720 · TK1151

细胞核0.262

排名 2 · TkA07G151720 · TK1151

高尔基体0.216

排名 3 · TkA07G151720 · TK1151

细胞膜0.172

排名 4 · TkA07G151720 · TK1151

溶酶体／液泡0.148

排名 5 · TkA07G151720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29709CLEC16A_helical14-40 aa

PF09758FPL42-192 aa

PF29709CLEC16A_helical249-331 aa

PF09758FPL307-341 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G151720	`PF29709`	CLEC16A_helical	14	40	8.5e-05	22.2
TkA07G151720	`PF09758`	FPL	42	192	1.3e-54	185.0
TkA07G151720	`PF29709`	CLEC16A_helical	249	331	8.5e-05	22.2
TkA07G151720	`PF09758`	FPL	307	341	1.3e-54	185.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W4P9`	拟南芥	sp\|Q8W4P9\|TT9_ARATH Protein TRANSPARENT TESTA 9	62.300%	Swiss-Prot	高置信

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