RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G131370
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 33958235-33960995 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1656 bp · TkA07G131370|TK1151|cDNA

CTGAATTGGACATGTAAGAAACCACTGATTGAAGTGTCCATATTTAGCTCAGTACTTCTGAAACGACTTTTCTTCCCTTAACAAAGACCAAACACTGGGAACAAAATCATCAAAATTTTCATCAAAACTCACTTCTTCACACTCCAGTTCTGCAGATTCACCCATGGATGACGATAGTGATCGGAGTTCAGAAGCAACTGAATTGGAAAATTTTACAGTAGAAAGAAGGAGGCACGGTCACAACGACAACGCTGAAGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1224 bp · TkA07G131370|TK1151|CDS

ATGGATGACGATAGTGATCGGAGTTCAGAAGCAACTGAATTGGAAAATTTTACAGTAGAAAGAAGGAGGCACGGTCACAACGACAACGCTGAAGATTCCGGCACCCTAAATGAAGATGAATTCGATGACGATGAGACTGATGATCAGAGAGAGGTTAGTAATTTAGGGACTTCACCTATGGAAATCGACGCATATTCAAGAACTTGTCAATCTGAAACCCTAGTATCTGGCTTGGCGGAGGTCCCGATACAGTATGAGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

407 aa · TkA07G131370|TK1151|PROTEIN

MDDDSDRSSEATELENFTVERRRHGHNDNAEDSGTLNEDEFDDDETDDQREVSNLGTSPMEIDAYSRTCQSETLVSGLAEVPIQYEMRQEELEHLKNQFQGSHQEALAIVIAKAAESQSGSKIQLPIIPSLPSESSPISSIPKLNPQGEILLIEGKSDHKTVSTSRTVKTPIDGYNWRKYGQKQVKIPEGSRSYYKCTHNECEAKKIESCDQYNSITKIVYKGQHKHEQPKKVFTRRGKILSSSKGQDCNFSSNSMHCKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G131370
TK1151 IDTkA07G131370
OH-1004 IDLXL04_028215
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G131370
位置Chr07:33958235-33960995 (+)
描述Similar to WRKY32: Probable WRKY transcription factor 32
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30935 转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g03340 转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g13960 特异性结合W盒（5′-(T)TGAC[CT]-3′）的转录因子；W盒是一类常见的激发子应答顺式作用元件。
Roles of Arabidopsis WRKY3 and WRKY4 transcription factors in plant responses to pathogens.2008 · DOI: 10.1186/1471-2229-8-68
Structural basis for sequence-specific DNA recognition by an Arabidopsis WRKY transcription factor.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.279844
At2g38470 转录因子。
Functional characterization of Arabidopsis NaCl-inducible WRKY25 and WRKY33 transcription factors in abiotic stresses.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9408-3
Arabidopsis thaliana WRKY25, WRKY26, and WRKY33 coordinate induction of plant thermotolerance.2011 · DOI: 10.1007/s00425-011-1375-2
Phosphorylation of a WRKY transcription factor by two pathogen-responsive MAPKs drives phytoalexin biosynthesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084996
Arabidopsis sigma factor binding proteins are activators of the WRKY33 transcription factor in plant defense.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.090571
Arabidopsis WRKY33 is a key transcriptional regulator of hormonal and metabolic responses toward Botrytis cinerea infection.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.192641

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028215 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
GO:1900425 negative regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13960
ath:AT4G30935
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.946
排名 1 · TkA07G131370 · TK1151
细胞质0.182
排名 2 · TkA07G131370 · TK1151
线粒体0.021
排名 3 · TkA07G131370 · TK1151
细胞膜0.017
排名 4 · TkA07G131370 · TK1151
高尔基体0.007
排名 5 · TkA07G131370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08020DUF170683-110 aa
PF08020DUF1706165-190 aa
PF03106WRKY173-228 aa
PF23549Zn_ribbon_GRF_2191-203 aa
PF08020DUF1706311-325 aa
PF03106WRKY316-372 aa
PF23549Zn_ribbon_GRF_2335-343 aa
PF23549Zn_ribbon_GRF_2381-396 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G131370PF08020DUF1706831100.1512.7
TkA07G131370PF08020DUF17061651900.1512.7
TkA07G131370PF03106WRKY1732282.2e-43147.0
TkA07G131370PF23549Zn_ribbon_GRF_21912032.38.8
TkA07G131370PF08020DUF17063113250.1512.7
TkA07G131370PF03106WRKY3163722.2e-43147.0
TkA07G131370PF23549Zn_ribbon_GRF_23353432.38.8
TkA07G131370PF23549Zn_ribbon_GRF_23813962.38.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P59583拟南芥sp|P59583|WRK32_ARATH Probable WRKY transcription factor 3249.400%Swiss-Prot中等置信
Q9ZQ70拟南芥sp|Q9ZQ70|WRKY3_ARATH Probable WRKY transcription factor 339.000%Swiss-Prot中等置信
Q9XI90拟南芥sp|Q9XI90|WRKY4_ARATH Probable WRKY transcription factor 435.500%Swiss-Prot中等置信
Q8S8P5拟南芥sp|Q8S8P5|WRK33_ARATH Probable WRKY transcription factor 3340.400%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看