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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G120500
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 31259707-31262913 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1805 bp · TkA07G120500|TK1151|cDNA

CGGCTGTGAATTAGCAATAACTGATCTTTAAATCTGCCACCATACGCCAGCATTCTTCTAACAACGACGAATGGTATCATTCCAGCATAAAACCCTTTCTCTCTCCTCTATTTTAGTACCCGATTCCCTTGTGTCTTTGTCAATTGTCGACATAAGTTCTAATTCTCCGCCGGCAACGACCTGTATAAACTTTCCGTTGTATGTATATCGGCGGTGGTGGAGGATGGTGATGACGGTGGCGTCGCCTAAAAACTCGTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1527 bp · TkA07G120500|TK1151|CDS

ATGGTATCATTCCAGCATAAAACCCTTTCTCTCTCCTCTATTTTAGTACCCGATTCCCTTGTGTCTTTGTCAATTGTCGACATAAGTTCTAATTCTCCGCCGGCAACGACCTGTATAAACTTTCCGTTGTATGTATATCGGCGGTGGTGGAGGATGGTGATGACGGTGGCGTCGCCTAAAAACTCGTTAAAGACAGTGTTCGAGAGAGTCGGAGTTTATGGATTTGGCGGCGGGAGTAGCAACAGGCAGAAAAGAGTAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

508 aa · TkA07G120500|TK1151|PROTEIN

MVSFQHKTLSLSSILVPDSLVSLSIVDISSNSPPATTCINFPLYVYRRWWRMVMTVASPKNSLKTVFERVGVYGFGGGSSNRQKRVRYEIHEEDHDNMEMVQLGANRTKNVLILMSDTGGGHRASAEAIRDAFKIEFGDEYKIFVKDVWKEYTGWPLNDMENQYKFMVKHVQLWSVAFHGTSPRWIHGVYLAAIAAFYAKEVEAGLMEYKPDIIISVHPMMQHIPLWVLKWQGLQKKVVFVTVITDLNTCHRTWFHPRVK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G120500
TK1151 IDTkA07G120500
OH-1004 IDLXL04_028090
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G120500
位置Chr07:31259707-31262913 (-)
描述Similar to MGD2: Monogalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g20410 参与单半乳糖基二酰基甘油的合成，光合膜的主要结构成分以及叶绿体包膜的生物发生。
Two types of MGDG synthase genes, found widely in both 16:3 and 18:3 plants, differentially mediate galactolipid syntheses in photosynthetic and nonphotosynthetic tissues in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1073/pnas.181331498
Type-B monogalactosyldiacylglycerol synthases are involved in phosphate starvation-induced lipid remodeling, and are crucial for low-phosphate adaptation.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03692.x
Lipid remodeling under acidic conditions and its interplay with low Pi stress in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1007/s11103-019-00891-1
At2g11810 参与单半乳糖基二酰基甘油的合成，光合膜的主要结构成分以及叶绿体包膜的生物发生。
Two types of MGDG synthase genes, found widely in both 16:3 and 18:3 plants, differentially mediate galactolipid syntheses in photosynthetic and nonphotosynthetic tissues in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1073/pnas.181331498
Type-B monogalactosyldiacylglycerol synthases are involved in phosphate starvation-induced lipid remodeling, and are crucial for low-phosphate adaptation.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03692.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0802700 参与光合膜主要结构成分的合成。 暂无已核实直接文献
Os08g0299400 参与光合膜主要结构成分的合成。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YTP9 参与光合膜主要结构成分的合成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028090 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0009247 glycolipid biosynthetic process 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0019374 galactolipid metabolic process 生物过程
GO:0019375 galactolipid biosynthetic process 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009707 chloroplast outer membrane 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0035250 UDP-galactosyltransferase activity 分子功能
GO:0046509 1,2-diacylglycerol 3-beta-galactosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G11810
ath:AT5G20410
dosa:Os02g0802700
dosa:Os08g0299400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.938
排名 1 · TkA07G120500 · TK1151
细胞质0.042
排名 2 · TkA07G120500 · TK1151
线粒体0.034
排名 3 · TkA07G120500 · TK1151
细胞膜0.034
排名 4 · TkA07G120500 · TK1151
过氧化物酶体0.031
排名 5 · TkA07G120500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06925MGDG_synth46-69 aa
PF06925MGDG_synth122-290 aa
PF13439Glyco_transf_4197-287 aa
PF04101Glyco_tran_28_C317-415 aa
PF13692Glyco_trans_1_4353-423 aa
PF06722EryCIII-like_C372-472 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G120500PF06925MGDG_synth46693.3e-62210.2
TkA07G120500PF06925MGDG_synth1222903.3e-62210.2
TkA07G120500PF13439Glyco_transf_41972870.2112.3
TkA07G120500PF04101Glyco_tran_28_C3174153.2e-0937.8
TkA07G120500PF13692Glyco_trans_1_43534230.06714.2
TkA07G120500PF06722EryCIII-like_C3724720.000820.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O82730拟南芥sp|O82730|MGDG2_ARATH Monogalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic80.500%Swiss-Prot高置信
Q9SI93拟南芥sp|Q9SI93|MGDG3_ARATH Monogalactosyldiacylglycerol synthase 3, chloroplastic78.000%Swiss-Prot高置信
Q0DWQ1水稻sp|Q0DWQ1|MGDG3_ORYSJ Probable monogalactosyldiacylglycerol synthase 3, chloroplastic77.500%Swiss-Prot高置信
Q6UTZ2水稻sp|Q6UTZ2|MGDG2_ORYSJ Probable monogalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic64.900%Swiss-Prot高置信
A2YTP9水稻sp|A2YTP9|MGDG2_ORYSI Probable monogalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic64.900%Swiss-Prot高置信

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