TkA07G117480 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G117480

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 30518714-30519811 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

947 bp · TkA07G117480|TK1151|cDNA

GTAAGATTATATAACTCATAACTAATATGTTAGTGACTTCCCTTTGGAAACTACTCATCAAACTAGCTCTTTGCATCAACCGCCGCCGTGCATCTCTTCGATTCCTCTTCTACTTCACTTCGATTATTAACCGCCGCCGTACGCTGCTGCTTCTTTCCGATTTCTCCATGTTCTTGGATCGCTGTTCAACCGTGGACAAGAATTCAACGATTTAACCTCTCTTCCATTGTAAAACCCACAACCATTGTCTATTTGATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

468 bp · TkA07G117480|TK1151|CDS

ATGGATTCAGCATCAGTGACAAAGTCCTTGGATACGCCGCTGCATGCAATCGGCTTTCAGATCGATGAGTTATCGCCACACAAGGTCACCGGTCGGCTTCAGGTCTCCGAGAAGTCATGTCAGCCGTTTAAGGTGTTACACGGGGGAGTATCGGCGTTAATATCAGAGGCGATGGCGAGTGCGGGAGCATTTGCGGCGTCGGGATGGAACAGAGTTGCCGGAGTACAGCTCAGCATCAATCACCTCAAACGTGCTGACGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

155 aa · TkA07G117480|TK1151|PROTEIN

MDSASVTKSLDTPLHAIGFQIDELSPHKVTGRLQVSEKSCQPFKVLHGGVSALISEAMASAGAFAASGWNRVAGVQLSINHLKRADVGDLVFAEATPLHVGNTIQVWEVRLWKIDPRNSESRLIISTSRVTLITNLPVPDNAKDVVQSFKKYAKL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G117480`
TK1151 ID	TkA07G117480
OH-1004 ID	LXL04_028069
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	94.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G117480

位置 Chr07:30518714-30519811 (+)

描述 Similar to DHNAT1: 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA thioesterase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g48320`	催化过氧化物酶体中1,4-二羟基-2-萘酰辅酶A（DHNA-CoA）的硫酯键水解，这是形成叶绿醌（维生素K1）萘醌环的必要步骤。	暂无已核实直接文献
`At5g48950`	催化过氧化物酶体中1,4-二羟基-2-萘酰辅酶A（DHNA-CoA）的硫酯键水解，这是形成叶绿醌（维生素K1）萘醌环的必要步骤。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028069 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009234 menaquinone biosynthetic process 生物过程

GO:0042372 phylloquinone biosynthetic process 生物过程

GO:0051289 protein homotetramerization 生物过程

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0061522 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA thioesterase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G48320

ath:AT5G48950

hin:HI_1161

lmt:LMRG_02730

pmu:PM0788

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.619

排名 1 · TkA07G117480 · TK1151

线粒体0.277

排名 2 · TkA07G117480 · TK1151

细胞质0.134

排名 3 · TkA07G117480 · TK1151

质体0.097

排名 4 · TkA07G117480 · TK1151

细胞核0.066

排名 5 · TkA07G117480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30808DUF874616-29 aa

PF09989DUF222935-56 aa

PF030614HBT44-117 aa

PF136224HBT_345-113 aa

PF30808DUF874661-99 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G117480	`PF30808`	DUF8746	16	29	0.039	15.0
TkA07G117480	`PF09989`	DUF2229	35	56	0.23	11.8
TkA07G117480	`PF03061`	4HBT	44	117	5.3e-15	56.2
TkA07G117480	`PF13622`	4HBT_3	45	113	0.0027	18.6
TkA07G117480	`PF30808`	DUF8746	61	99	0.039	15.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SX65`	拟南芥	sp\|Q9SX65\|DNAT1_ARATH 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA thioesterase 1	66.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FI76`	拟南芥	sp\|Q9FI76\|DNAT2_ARATH 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA thioesterase 2	55.300%	Swiss-Prot	高置信

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