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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G115790
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 30074384-30080793 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3341 bp · TkA07G115790|TK1151|cDNA

CGAAAATATATTTCTGCAACTTTTAGAGACCATTTACATCTAAAAAAACCGAGTTTGTAACTTTTTGGCGACTTATGATCAAAATTAAATTGTCTGCTTCATTCTCCCTCTCGATTTCCATGTTGTATCAAACAGCTCGTTCACTCGCTTTGCCGGAGTTATAGACTGTAATCGCCGATTTCAACTCCACTGCATCTCCCTTCGTGTTCTTGCTCAAATAGATAAAGCTTTGCACCGCTTCTGAAGCCCGTCAGCATTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1338 bp · TkA07G115790|TK1151|CDS

ATGAAAAGAGTGACAAAAAAGGTCGGGAAGTATGAGCTTGGGAGAACCATTGGTGAAGGCACATTTGCAAAGGTTAAATTTGCAAAAAATACAGAGACTGGGGAGTCAGTTGCCATTAAAGTTCTTCCAAAAAGCAGCATACTCAAGCACAAAATGGTGGATCAGATTAAAAGAGAGATCTCTATAACAAAGATGATGAGGCATCCTAATATTGTGAGACTCCATGAGGTTTTGTCAAGCCATACAAAGATATATATAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

445 aa · TkA07G115790|TK1151|PROTEIN

MKRVTKKVGKYELGRTIGEGTFAKVKFAKNTETGESVAIKVLPKSSILKHKMVDQIKREISITKMMRHPNIVRLHEVLSSHTKIYIILEFINGGELFDRIVHKGKLYEKEARDYFQQLIDAVAYCHGKGVYHRDLKPENLLLDSEGKLKVSDFGLSALPLQGVELLYTTCGTPNYIAPEVLSNNGYDGAAADIWSCGVILYVILAGYLPFEESDLPSLYKKVNVAEFSYPFWFPDNAKSLIDRILDPNPETRIGIDGVKE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G115790
TK1151 IDTkA07G115790
OH-1004 IDLXL04_028053
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 91.446
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G115790
位置Chr07:30074384-30080793 (-)
描述Similar to CIPK24: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g35410 可能参与细胞内 Na⁺、K⁺ 稳态及耐盐性的调控。
The Arabidopsis SOS2 protein kinase physically interacts with and is activated by the calcium-binding protein SOS3.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.7.3735
Regulation of SOS1, a plasma membrane Na+/H+ exchanger in Arabidopsis thaliana, by SOS2 and SOS3.2002 · DOI: 10.1073/pnas.122224699
The protein kinase SOS2 activates the Arabidopsis H(+)/Ca(2+) antiporter CAX1 to integrate calcium transport and salt tolerance.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m309084200
At4g24400 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0606000 可能参与细胞内 Na⁺、K⁺ 稳态及耐盐性的调控。
Conservation of the salt overly sensitive pathway in rice.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.092635
Os01g0536000 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0150700 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028053 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G24400
ath:AT5G35410
dosa:Os01g0536000
dosa:Os06g0606000
dosa:Os07g0150700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.542
排名 1 · TkA07G115790 · TK1151
细胞核0.381
排名 2 · TkA07G115790 · TK1151
细胞膜0.227
排名 3 · TkA07G115790 · TK1151
溶酶体／液泡0.054
排名 4 · TkA07G115790 · TK1151
高尔基体0.051
排名 5 · TkA07G115790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase11-264 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr12-256 aa
PF14531Kinase-like13-60 aa
PF03109ABC119-43 aa
PF02149KA157-74 aa
PF03109ABC163-156 aa
PF01636APH71-123 aa
PF12330Haspin_kinase79-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G115790PF00069Pkinase112645.7e-75252.8
TkA07G115790PF07714PK_Tyr_Ser-Thr122561.2e-35123.8
TkA07G115790PF14531Kinase-like13606.5e-0936.2
TkA07G115790PF03109ABC119430.0002221.2
TkA07G115790PF02149KA157740.08713.2
TkA07G115790PF03109ABC1631560.0002221.2
TkA07G115790PF01636APH711230.2112.0
TkA07G115790PF12330Haspin_kinase791690.1911.5
TkA07G115790PF06293Kdo881480.09412.9
TkA07G115790PF14531Kinase-like1082526.5e-0936.2
TkA07G115790PF01636APH1281480.2112.0
TkA07G115790PF03822NAF3063651.2e-1867.7
TkA07G115790PF02149KA13964230.08713.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDI3拟南芥sp|Q9LDI3|CIPKO_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 2470.600%Swiss-Prot高置信
Q9STV4拟南芥sp|Q9STV4|CIPK8_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 864.200%Swiss-Prot高置信
Q69Q47水稻sp|Q69Q47|CIPKO_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 2469.800%Swiss-Prot高置信
Q5JLD8水稻sp|Q5JLD8|CIPK8_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 864.800%Swiss-Prot高置信
Q6ZLP5水稻sp|Q6ZLP5|CIPKN_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 2359.400%Swiss-Prot高置信

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