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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G110470
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 28602422-28604579 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1942 bp · TkA07G110470|TK1151|cDNA

AGATAAGATATTTGTATTATCTTCTGGATAAAAATAATACAAGGTTATAATAATTATTTAGCGAAGATAACATTATTGAACGATTAAATATTAAGTATGATATATCACTCATATATGTTCTTCTAGATCCTCACGTGCAATTCGTATCTCATCTTCTTCCTCGCATCGTTGAGAAAAATAAGCACAAAATTTCAAAACCCTAAAAGTTCGAACAATCTGTAAATAAAATGGATCCAGCTCCGCCGTCAACCACCAAGAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1410 bp · TkA07G110470|TK1151|CDS

ATGGATCCAGCTCCGCCGTCAACCACCAAGAGCTGGAGCATACATACCCGCCGGGAGATCACCTGCAAGTACGAGATTCAAAACCGAATCGGATCCGGTGCCTACTCCGACGTATACAAAGCTCGCCGTCTCTCGGACGATCTTACAGTCGCATTGAAGGAAGTTCACGATTATCAATCCGCTTTCCGAGAGATCGAAGCACTTCAATCTCTACAACATTCTCCGAATGTCGTCGAGTTGCACGAGTACTTCTGGAGCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

469 aa · TkA07G110470|TK1151|PROTEIN

MDPAPPSTTKSWSIHTRREITCKYEIQNRIGSGAYSDVYKARRLSDDLTVALKEVHDYQSAFREIEALQSLQHSPNVVELHEYFWSEDEDAVLVLEYLPTDLASVIRTAKKEWKGLSVGEIKRWIIQILLAVDACHRSSIIHRDLKPANLLISANGVLKLADFGQARIRLAPGFLSVHDNTQPQVQEPSLFHQQKNIPESEPVTNEPRPHLTEPPLRTIEEYTPSYDIRPKDPIDELDKDTNFPDVDTSCLATFTTSDIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G110470
TK1151 IDTkA07G110470
OH-1004 IDLXL04_027976
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G110470
位置Chr07:28602422-28604579 (+)
描述Similar to CDKF-1: Cyclin-dependent kinase F-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g28980 CDK 激活激酶，通过 T 环磷酸化调节 CDKD-2 和 CDKD-3 活性。
Comparison of Cak1p-like cyclin-dependent kinase-activating kinases.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m205537200
At1g66750 与细胞周期蛋白 CYCH1-1 形成稳定复合物，可磷酸化人类 CDK2 及 RNA 聚合酶 II 大亚基的 C 端结构域 (CTD)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0334400 细胞周期蛋白dependent kinase F-1。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YCH5 细胞周期蛋白dependent kinase F-1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027976 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005929 cilium 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008353 RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G28980
dosa:Os06g0334400
hsa:23552
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.622
排名 1 · TkA07G110470 · TK1151
细胞核0.568
排名 2 · TkA07G110470 · TK1151
细胞膜0.041
排名 3 · TkA07G110470 · TK1151
线粒体0.038
排名 4 · TkA07G110470 · TK1151
内质网0.031
排名 5 · TkA07G110470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26324HopBF1_kinase21-83 aa
PF00069Pkinase24-167 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr25-167 aa
PF03109ABC130-56 aa
PF03109ABC145-166 aa
PF01163RIO160-166 aa
PF06293Kdo61-179 aa
PF12330Haspin_kinase81-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G110470PF26324HopBF1_kinase21830.04414.0
TkA07G110470PF00069Pkinase241671.4e-54186.0
TkA07G110470PF07714PK_Tyr_Ser-Thr251672.3e-2177.0
TkA07G110470PF03109ABC130561.8e-0524.7
TkA07G110470PF03109ABC1451661.8e-0524.7
TkA07G110470PF01163RIO1601660.1212.7
TkA07G110470PF06293Kdo611790.05413.6
TkA07G110470PF12330Haspin_kinase811690.02714.2
TkA07G110470PF01636APH1121670.002918.1
TkA07G110470PF00069Pkinase2784101.4e-54186.0
TkA07G110470PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2863212.3e-2177.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80345拟南芥sp|O80345|CDKF1_ARATH Cyclin-dependent kinase F-155.500%Swiss-Prot高置信
Q9C9M7拟南芥sp|Q9C9M7|CDKD2_ARATH Cyclin-dependent kinase D-228.900%Swiss-Prot低置信
Q5Z754水稻sp|Q5Z754|CDKF1_ORYSJ Cyclin-dependent kinase F-150.600%Swiss-Prot高置信
A2YCH5水稻sp|A2YCH5|CDKF1_ORYSI Cyclin-dependent kinase F-150.400%Swiss-Prot高置信

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