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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G100690
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 26232734-26234626 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

992 bp · TkA07G100690|TK1151|cDNA

CGTCAAGTCCGTGACTATTTGCGTAGCTCTAAATCAAAATTGCTGGGTATATAGGCGACGGCGCCGCTCAAAGCTTATTCCATGGCGCCGGAGAAAGCACAGTCTACGGTCGTCGAAGATACGATGATCATATGGGATTTTGATCGGACGATTATGGACGACGATAGTGATCGGTGGGTGGTGGTACACATGGGTTTGACTCAACTGTTCAATCAGCTTCGCGAAACATTGCCTTGGAATACTCTCATGGATAGAATGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

750 bp · TkA07G100690|TK1151|CDS

ATGGCGCCGGAGAAAGCACAGTCTACGGTCGTCGAAGATACGATGATCATATGGGATTTTGATCGGACGATTATGGACGACGATAGTGATCGGTGGGTGGTGGTACACATGGGTTTGACTCAACTGTTCAATCAGCTTCGCGAAACATTGCCTTGGAATACTCTCATGGATAGAATGATGGAAGAGCTACATTCTCAGGGAAAAACAATCGAAGATATCATAAACTGTTTAAATCGCGTTCCATTACATCCAAAAATCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

249 aa · TkA07G100690|TK1151|PROTEIN

MAPEKAQSTVVEDTMIIWDFDRTIMDDDSDRWVVVHMGLTQLFNQLRETLPWNTLMDRMMEELHSQGKTIEDIINCLNRVPLHPKIISAIKSAHTLGCDLKVLSDANTFFIETILKNHGVYDCFSEIISNPTFVDKEGRLRIFPYHGSTLPPHGCDLCPPNLCKGLVLNKIRDSNLESKKVIIYIGDGGGDFCPTLKLGEKDNVMPRKNFPLHGLILKSSVPIKPKVHEWSDGEELNRILIHLIRPGSE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G100690
TK1151 IDTkA07G100690
OH-1004 IDLXL04_008310
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)59.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.369 / OH-1004 80.488
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G100690
位置Chr07:26232734-26234626 (-)
描述Similar to At1g17710: Inorganic pyrophosphatase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g29530 HAD 样水解酶，在异源系统中具有单磷酸硫胺素磷酸酶活性。
Bacterial and plant HAD enzymes catalyse a missing phosphatase step in thiamin diphosphate biosynthesis.2016 · DOI: 10.1042/bj20150805
At1g73010 催化焦磷酸的特异性裂解。
The Arabidopsis thaliana phosphate starvation responsive gene AtPPsPase1 encodes a novel type of inorganic pyrophosphatase.2011 · DOI: 10.1016/j.bbagen.2010.11.006
At1g17710 催化焦磷酸的特异性切割。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006580 ethanolamine metabolic process 生物过程
GO:0009229 thiamine diphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0051262 protein tetramerization 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0065010 extracellular membrane-bounded organelle 细胞组分
GO:1903561 extracellular vesicle 细胞组分
GO:0004427 inorganic diphosphate phosphatase activity 分子功能
GO:0016462 pyrophosphatase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17710
ath:AT1G73010
ath:AT4G29530
dre:100002812
xtr:493318
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.681
排名 1 · TkA07G100690 · TK1151
细胞核0.371
排名 2 · TkA07G100690 · TK1151
线粒体0.087
排名 3 · TkA07G100690 · TK1151
细胞膜0.065
排名 4 · TkA07G100690 · TK1151
内质网0.058
排名 5 · TkA07G100690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06888Put_Phosphatase15-244 aa
PF12710HAD16-140 aa
PF13419HAD_216-130 aa
PF10949DUF277735-84 aa
PF00702Hydrolase69-129 aa
PF13419HAD_2171-191 aa
PF00702Hydrolase177-189 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G100690PF06888Put_Phosphatase152442.7e-87292.8
TkA07G100690PF12710HAD161401.7e-0526.0
TkA07G100690PF13419HAD_2161300.001419.4
TkA07G100690PF10949DUF277735840.212.2
TkA07G100690PF00702Hydrolase691290.001719.5
TkA07G100690PF13419HAD_21711910.001419.4
TkA07G100690PF00702Hydrolase1771890.001719.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SU92拟南芥sp|Q9SU92|PPSP3_ARATH Thiamine phosphate phosphatase-like protein59.500%Swiss-Prot高置信
Q67YC0拟南芥sp|Q67YC0|PPSP1_ARATH Inorganic pyrophosphatase 156.300%Swiss-Prot高置信
Q9FZ62拟南芥sp|Q9FZ62|PPSP2_ARATH Inorganic pyrophosphatase 253.900%Swiss-Prot高置信

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