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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G084790
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 22139810-22143896 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2716 bp · TkA07G084790|TK1151|cDNA

TAGAAACATGACCAAAGCCTAGGGACCATTTGTGAAGCTTAATATTGGGCTTTGGCCTGGGCTCTTTATCTACTTTACAAATCTTTATTGGGCCGGACGTCTTATTCCATTTACGCGGGACCATCATTATTTTCCCGCCAGAACACTTCACTAACACCTCTGCTCTTCCCGCCCAAACAACACAACACATTTAGGGCAAAGTTTCACCTCTCTTCCTCTCTGCATCTTCTCGTCGTTCCCCGATCATCCTCTCTCTAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

2304 bp · TkA07G084790|TK1151|CDS

ATGGACATCAGCGAAGAACAAAGGGCTTCCAACAAAAAGGCTTTCAGCGAATTGTTCGACACAAACGATAGTCTAGATGAAGATATCAGGAGCATGATCCACAACCAGCGCCGTCGTTTGATTTTTCAGCTTTCCCACCTCTTTCAACGCGGAGCGGAGGATTTAGCTCGACGGTTACTACAGACTCCTAACGAATATATCCAGTCGCTGTCGGATTTCATAACGGAAAGAACACGGAGCATCGACCCGAAGTTTCTAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

767 aa · TkA07G084790|TK1151|PROTEIN

MDISEEQRASNKKAFSELFDTNDSLDEDIRSMIHNQRRRLIFQLSHLFQRGAEDLARRLLQTPNEYIQSLSDFITERTRSIDPKFLKEGEQVLVGFDGPFVSRKVTPRDLLSEFIGSMVKVEGIITKCSLVRPKVVKSVHFCPSTNQFTSREYRDITSTMGLPTGSVYPTRDDNGNLLVTEYGLCNYKDHQTLSMQEVPENSAPGQLPRTVDVIAEDDLVDSCKPGDRVAIVGVYKAIPGKSQGSVNGVFRTVLIANNVY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G084790
TK1151 IDTkA07G084790
OH-1004 IDLXL04_027668
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G084790
位置Chr07:22139810-22143896 (-)
描述Similar to MCM3: DNA replication licensing factor MCM3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g46280 MCM2-7 复合物的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。
Two E2F sites in the Arabidopsis MCM3 promoter have different roles in cell cycle activation and meristematic expression.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m205125200

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AZ99 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
Os05g0476200 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027668 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000727 double-strand break repair via break-induced replication 生物过程
GO:0006271 DNA strand elongation involved in DNA replication 生物过程
GO:1902975 mitotic DNA replication initiation 生物过程
GO:0000347 THO complex 细胞组分
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0042555 MCM complex 细胞组分
GO:0003678 DNA helicase activity 分子功能
GO:0003697 single-stranded DNA binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G46280
dosa:Os05g0476200
zma:542738
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.930
排名 1 · TkA07G084790 · TK1151
细胞质0.141
排名 2 · TkA07G084790 · TK1151
线粒体0.027
排名 3 · TkA07G084790 · TK1151
细胞膜0.016
排名 4 · TkA07G084790 · TK1151
内质网0.007
排名 5 · TkA07G084790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23191WHD_MCM3_C3-24 aa
PF14551MCM_N27-92 aa
PF17207MCM_OB108-239 aa
PF23191WHD_MCM3_C143-160 aa
PF00493MCM275-498 aa
PF01078Mg_chelatase330-356 aa
PF07728AAA_5333-449 aa
PF00004AAA334-447 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G084790PF23191WHD_MCM3_C3241.1e-0732.7
TkA07G084790PF14551MCM_N27928.6e-0626.8
TkA07G084790PF17207MCM_OB1082391.1e-29103.4
TkA07G084790PF23191WHD_MCM3_C1431601.1e-0732.7
TkA07G084790PF00493MCM2754981e-95319.8
TkA07G084790PF01078Mg_chelatase3303563.1e-0937.2
TkA07G084790PF07728AAA_53334490.007317.0
TkA07G084790PF00004AAA3344470.03315.4
TkA07G084790PF07726AAA_33704520.0005120.6
TkA07G084790PF00158Sigma54_activat3814460.01216.0
TkA07G084790PF01078Mg_chelatase3824493.1e-0937.2
TkA07G084790PF23191WHD_MCM3_C4054151.1e-0732.7
TkA07G084790PF17855MCM_lid5526354.3e-2795.1
TkA07G084790PF25830Ig_NFAM16076800.212.8
TkA07G084790PF14551MCM_N6376498.6e-0626.8
TkA07G084790PF23191WHD_MCM3_C6977641.1e-0732.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FL33拟南芥sp|Q9FL33|MCM3_ARATH DNA replication licensing factor MCM354.700%Swiss-Prot高置信
B8AZ99水稻sp|B8AZ99|MCM3_ORYSI DNA replication licensing factor MCM367.200%Swiss-Prot高置信
Q0DHC4水稻sp|Q0DHC4|MCM3_ORYSJ DNA replication licensing factor MCM367.200%Swiss-Prot高置信

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