TkA07G057870 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G057870

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 15358169-15358618 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

450 bp · TkA07G057870|TK1151|cDNA

ATGTCAATCGACGACCTTCTGAAATCAACAAACTGTTTCGATCAATCCAACATAATCGGGTGCGGAGGCTTCGGTCTCGTCTTCAAAGCCACACTTCCCGACGACGGGAAAGTCGCAATTAAACGTCTCTCCGGCGACGGCGGTCAAGTCGACCGGGAATTTCAAGCGGAAGTGGAAACCCTATCTAGGGCACAACATCCAAATCTCGTCCTCCTTCAAGGCTACTGCAAACACAAAAACGAAAGACTCCTCATATACTC...

CDS

下载 CDS FASTA

450 bp · TkA07G057870|TK1151|CDS

ATGTCAATCGACGACCTTCTGAAATCAACAAACTGTTTCGATCAATCCAACATAATCGGGTGCGGAGGCTTCGGTCTCGTCTTCAAAGCCACACTTCCCGACGACGGGAAAGTCGCAATTAAACGTCTCTCCGGCGACGGCGGTCAAGTCGACCGGGAATTTCAAGCGGAAGTGGAAACCCTATCTAGGGCACAACATCCAAATCTCGTCCTCCTTCAAGGCTACTGCAAACACAAAAACGAAAGACTCCTCATATACTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

149 aa · TkA07G057870|TK1151|PROTEIN

MSIDDLLKSTNCFDQSNIIGCGGFGLVFKATLPDDGKVAIKRLSGDGGQVDREFQAEVETLSRAQHPNLVLLQGYCKHKNERLLIYSFMENGSLECWLLHERPDGLSKLDWNTRQKIAQGAIRGLAYLHQSCDPHILHRDIKSSNILLD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G057870`
TK1151 ID	TkA07G057870
OH-1004 ID	LXL04_025852
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	95.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 14.439 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G057870

位置 Chr07:15358169-15358618 (-)

描述 Similar to PSKR: Phytosulfokine receptor 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g02220`	植物磺肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性和鸟苷酸环化酶活性。	Disruption and overexpression of Arabidopsis phytosulfokine receptor gene affects cellular longevity and potential for growth.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081109 The phytosulfokine (PSK) receptor is capable of guanylate cyclase activity and enabling cyclic GMP-dependent signaling in plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.168823 The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
`At5g53890`	具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的植物硫肽受体。	暂无已核实直接文献
`At1g72300`	酪氨酸硫酸化糖肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性。	Tyrosine-sulfated glycopeptide involved in cellular proliferation and expansion in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706403104 The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050 Receptor kinase-mediated control of primary active proton pumping at the plasma membrane.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12680
`At4g39400`	受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。	Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743 Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247 The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903 The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449 BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973 Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106 BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025852 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009791 post-embryonic development 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0031347 regulation of defense response 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0045851 pH reduction 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G55610

ath:AT1G72300

ath:AT2G02220

ath:AT5G53890

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.553

排名 1 · TkA07G057870 · TK1151

细胞膜0.315

排名 2 · TkA07G057870 · TK1151

细胞核0.288

排名 3 · TkA07G057870 · TK1151

内质网0.045

排名 4 · TkA07G057870 · TK1151

高尔基体0.043

排名 5 · TkA07G057870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase14-149 aa

PF17667Pkinase_fungal14-69 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr16-149 aa

PF03109ABC118-64 aa

PF00355Rieske54-98 aa

PF20748RecJ_C_Deinoc55-100 aa

PF03109ABC1114-148 aa

PF17667Pkinase_fungal119-148 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G057870	`PF00069`	Pkinase	14	149	3.7e-22	79.7
TkA07G057870	`PF17667`	Pkinase_fungal	14	69	0.14	11.6
TkA07G057870	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	16	149	3.6e-21	76.4
TkA07G057870	`PF03109`	ABC1	18	64	0.009	15.9
TkA07G057870	`PF00355`	Rieske	54	98	0.15	12.7
TkA07G057870	`PF20748`	RecJ_C_Deinoc	55	100	0.23	11.9
TkA07G057870	`PF03109`	ABC1	114	148	0.009	15.9
TkA07G057870	`PF17667`	Pkinase_fungal	119	148	0.14	11.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZVR7`	拟南芥	sp\|Q9ZVR7\|PSKR1_ARATH Phytosulfokine receptor 1	75.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FN37`	拟南芥	sp\|Q9FN37\|PSKR2_ARATH Phytosulfokine receptor 2	71.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C7S5`	拟南芥	sp\|Q9C7S5\|PSYR1_ARATH Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1	64.400%	Swiss-Prot	高置信
`O22476`	拟南芥	sp\|O22476\|BRI1_ARATH Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1	55.700%	Swiss-Prot	高置信

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