TkA07G056430 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G056430

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 15015678-15020314 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1702 bp · TkA07G056430|TK1151|cDNA

CGAAAATCATTGAAAATAAATTAAGTAAATTATATAATAAAAAAAAGTAAAGAATAGCGACGGATTAGAAAGGGGAATTCCCTTTGTTGTGTTCCCCCCTCGCCGATCCGTCTCTGATTTACGACTTCACTTACATTGTTTTTCCCCGTCACCACCGAATCACAAAACGTCGCAATTCAAACACATACGAAATTTCATTTTTAAGTATTTGAAGCTGAATCCATGAGTTGCTCAAAGCCCTTCTAAATCGTAAACCCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

411 bp · TkA07G056430|TK1151|CDS

ATGATGAAGATCAAAGATAAGAAAGACAGAGGAACTCTTTCAATCAAGGAGGCGTATGAAGAGGCTATTGTTGCTAAGTATGGCGATGATACTAGTTGTTATCCTCTGTTGGATAGTCAAATATGGCTAGAAGTTAGCGGAGGGAAAAAGAAAGGACGCGTTTTTGGATTTGGTTCGATTTCAGATCCGGAGAGCTTTTTGACGGGGACATCAAGTACCGCAACATCCCGAGAGAAAAAAGCTGCGGAAATGGAGGCAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

136 aa · TkA07G056430|TK1151|PROTEIN

MMKIKDKKDRGTLSIKEAYEEAIVAKYGDDTSCYPLLDSQIWLEVSGGKKKGRVFGFGSISDPESFLTGTSSTATSREKKAAEMEAKAAEMEVKHHKMCEELDAKAAALEVKQKQIDEKYERFEKMFYELQNMRES

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G056430`
TK1151 ID	TkA07G056430
OH-1004 ID	LXL04_013908
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	96.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 91.912 / OH-1004 5.428 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA07G056430`
位置	Chr07:15015678-15020314 (+)
描述	Similar to GLR3.6: Glutamate receptor 3.6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_013908` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006816 calcium ion transport 生物过程 GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程 GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程 GO:0009416 response to light stimulus 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009630 gravitropism 生物过程 GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ath:AT1G42540 ath:AT3G51480 osa:124544569 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.941

排名 1 · TkA07G056430 · TK1151

细胞质0.169

排名 2 · TkA07G056430 · TK1151

线粒体0.016

排名 3 · TkA07G056430 · TK1151

细胞膜0.011

排名 4 · TkA07G056430 · TK1151

细胞外0.009

排名 5 · TkA07G056430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03244PSI_PsaH7-35 aa

PF03004Transposase_2432-63 aa

PF10199Adaptin_binding53-135 aa

PF03244PSI_PsaH59-130 aa

PF28887PilO_N71-92 aa

PF00170bZIP_172-86 aa

PF18004RPN2_C73-133 aa

PF28121VPA126775-129 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G056430	`PF03244`	PSI_PsaH	7	35	0.15	12.3
TkA07G056430	`PF03004`	Transposase_24	32	63	0.00043	21.2
TkA07G056430	`PF10199`	Adaptin_binding	53	135	0.15	13.6
TkA07G056430	`PF03244`	PSI_PsaH	59	130	0.15	12.3
TkA07G056430	`PF28887`	PilO_N	71	92	1.6	9.4
TkA07G056430	`PF00170`	bZIP_1	72	86	0.37	11.6
TkA07G056430	`PF18004`	RPN2_C	73	133	0.25	11.9
TkA07G056430	`PF28121`	VPA1267	75	129	0.15	13.0
TkA07G056430	`PF16326`	ABC_tran_CTD	78	125	0.0042	18.0
TkA07G056430	`PF20667`	Sec10_N	78	130	0.13	13.1
TkA07G056430	`PF06936`	Selenoprotein_S	81	121	0.031	14.9
TkA07G056430	`PF28887`	PilO_N	87	130	1.6	9.4
TkA07G056430	`PF03004`	Transposase_24	91	91	0.00043	21.2
TkA07G056430	`PF00170`	bZIP_1	95	131	0.37	11.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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