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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G053510
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 14294849-14296857 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

723 bp · TkA07G053510|TK1151|cDNA

CTGCGTCCGACTGACGACCGACTAGAGACCGCCGCTTCTCTCACAGGCGCAACCACCGGCAAGTTCGATTTCAGACTAGAGACCGCCGCTACTCGATTTCAGATTACTCAAGTGTATGGATTTTATGATGAATGTCTTCGGAAGTATGGAAATGCTAATGTTTGGAAAACATTCACCGATCTTTTCGATTATTTCCCACTGACTGCATTGATCCCAGAACTGTATGGCCAGTCAAATTCTCCTCAGTTGGAATGCATTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

723 bp · TkA07G053510|TK1151|CDS

CTGCGTCCGACTGACGACCGACTAGAGACCGCCGCTTCTCTCACAGGCGCAACCACCGGCAAGTTCGATTTCAGACTAGAGACCGCCGCTACTCGATTTCAGATTACTCAAGTGTATGGATTTTATGATGAATGTCTTCGGAAGTATGGAAATGCTAATGTTTGGAAAACATTCACCGATCTTTTCGATTATTTCCCACTGACTGCATTGATCCCAGAACTGTATGGCCAGTCAAATTCTCCTCAGTTGGAATGCATTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

240 aa · TkA07G053510|TK1151|PROTEIN

LRPTDDRLETAASLTGATTGKFDFRLETAATRFQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKTFTDLFDYFPLTALIPELYGQSNSPQLECIASLDSHSSKIKCVLWWPSGRHDKLISIDEQNIFLWSLDSSTSESSIQFWDLRIMKKTNSIECSHVRNIDYDSKKKHMLVTAADESGIHIWDVRMSKAPVAELPGHSHWTWAVRSNPEYEGIILSAGTDSPVIPLAATAFIISGDICRRYCYDFL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G053510
TK1151 IDTkA07G053510
OH-1004 IDLXL04_015184
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 61.250 / OH-1004 52.023
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G053510
位置Chr07:14294849-14296857 (-)
描述Similar to DWA2: WD repeat-containing protein DWA2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g76260 CUL4-RBX1-DDB1-DWA1/DWA2 E3 泛素蛋白连接酶复合物的组成部分，在脱落酸 信号传导中充当负调节因子。
DWA1 and DWA2, two Arabidopsis DWD protein components of CUL4-based E3 ligases, act together as negative regulators in ABA signal transduction.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.073783

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XN40 丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶 PP2A-2 催化亚基。 暂无已核实直接文献
Os03g0805300 丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶 PP2A-2 催化亚基。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015184 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0032456 endocytic recycling 生物过程
GO:0051049 regulation of transport 生物过程
GO:1905281 positive regulation of retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程
GO:2001137 positive regulation of endocytic recycling 生物过程
GO:0000938 GARP complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G76260
gja:107122311
rno:362721
xtr:496745
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.449
排名 1 · TkA07G053510 · TK1151
细胞核0.431
排名 2 · TkA07G053510 · TK1151
细胞膜0.072
排名 3 · TkA07G053510 · TK1151
线粒体0.066
排名 4 · TkA07G053510 · TK1151
内质网0.063
排名 5 · TkA07G053510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00149Metallophos41-111 aa
PF23609Beta-prop_EIPR176-126 aa
PF24797Beta-prop_WDR35_TULP_N76-125 aa
PF24105Beta-prop_CAF1B_HIR177-205 aa
PF25047Beta-prop_TEP1_2nd79-198 aa
PF23383Beta-prop_IFT140_1st80-126 aa
PF23381Beta-prop_IFT122_1st82-128 aa
PF25172Beta-prop_WDR3_2nd82-182 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G053510PF00149Metallophos411110.001120.1
TkA07G053510PF23609Beta-prop_EIPR1761265.3e-41141.6
TkA07G053510PF24797Beta-prop_WDR35_TULP_N761250.06213.2
TkA07G053510PF24105Beta-prop_CAF1B_HIR1772050.0002321.0
TkA07G053510PF25047Beta-prop_TEP1_2nd791980.005616.6
TkA07G053510PF23383Beta-prop_IFT140_1st801260.0313.8
TkA07G053510PF23381Beta-prop_IFT122_1st821286.7e-0729.6
TkA07G053510PF25172Beta-prop_WDR3_2nd821820.001618.5
TkA07G053510PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd831128.6e-0522.4
TkA07G053510PF24814WD40_Prp19841246.4e-0729.4
TkA07G053510PF25173Beta-prop_WDR3_1st842156.4e-0730.0
TkA07G053510PF00400WD40841210.0001223.1
TkA07G053510PF23775Beta-prop_RIG_2nd841290.0004720.4
TkA07G053510PF23414Beta-prop_EML_2881220.04713.8
TkA07G053510PF25174Beta-prop_THOC3931941.2e-0731.7
TkA07G053510PF29037DSE1_N931280.0007419.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6NPN9拟南芥sp|Q6NPN9|DWA2_ARATH WD repeat-containing protein DWA256.100%Swiss-Prot中等置信
A2XN40水稻sp|A2XN40|PP2A2_ORYSI Serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit70.000%Swiss-Prot低置信
Q10BT5水稻sp|Q10BT5|PP2A2_ORYSJ Serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit70.000%Swiss-Prot低置信

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