TkA07G041010 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G041010

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 10977353-10980595 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1877 bp · TkA07G041010|TK1151|cDNA

AAAACGCGAACGTAGCAAAAGGAAAGCGTATCAATCTTTTTCCCCGAAAGCTTTTCTTTTCCCCTAAATTGAAATTCCCTTCTCCAAGGCACTAACGTCTACACTCTCCTTCGTCGTCTTCTTTCTCTTGGTTTCCATCAGTGTGTTTTGGAAGATTTAACAGAGAAAAATGGCAGTGAAAGATTTGAAGTCAAAGCAAGAGCTTGATACTCTTGTGAATGAAGGGTCGCCTGTCATGATTCACTTCTGGGCTTCATGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1470 bp · TkA07G041010|TK1151|CDS

ATGGCAGTGAAAGATTTGAAGTCAAAGCAAGAGCTTGATACTCTTGTGAATGAAGGGTCGCCTGTCATGATTCACTTCTGGGCTTCATGGTGTGAAGCTTCTAAGCACATGGATCAAGTCTTTTCTCATCTTTCCACTGATTTCCCTCATGCTCATTTCCTAAGGGTTGAAGCTGAAGAACAACCAGAAATATCCGAAGCATATTCAGTTTCCGCTGTCCCATACTTCGCTTTTATCAAGGGTGGCAAGATGGTTGACAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

489 aa · TkA07G041010|TK1151|PROTEIN

MAVKDLKSKQELDTLVNEGSPVMIHFWASWCEASKHMDQVFSHLSTDFPHAHFLRVEAEEQPEISEAYSVSAVPYFAFIKGGKMVDTLEGAYPSELANKIAKVVGSIHAGEPAAPASLGMAAGPTILQAIQEIAKTDTSSTTNSHSRPPNTGVTDTLKSRLEKLTRAHPIMLFMKGNPEDPKCGFSKKAVEILRAENVKFGTFDILGDNEVREGLKKFSNWPTYPQLYCKGELLGGSDIIIAMHEGGELKQAFQDRGVGD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G041010`
TK1151 ID	TkA07G041010
OH-1004 ID	LXL04_002029
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	45.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 20.245 / OH-1004 60.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G041010

位置 Chr07:10977353-10980595 (+)

描述 Similar to GRXS15: Monothiol glutaredoxin-S15, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g04950`	可能仅还原GSH-硫醇二硫化物，但不还原蛋白二硫化物（可能）。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os10g0500700`	可能仅还原 GSH-硫醇二硫键，但不还原蛋白二硫键。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002029 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程

GO:0009249 protein lipoylation 生物过程

GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程

GO:0044571 [2Fe-2S] cluster assembly 生物过程

GO:0045454 cell redox homeostasis 生物过程

GO:0051604 protein maturation 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:1990229 iron-sulfur cluster assembly complex 细胞组分

GO:0015036 disulfide oxidoreductase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G15660

dosa:Os01g0174900

dosa:Os01g0530400

hsa:51218

mmu:73046

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.737

排名 1 · TkA07G041010 · TK1151

细胞核0.351

排名 2 · TkA07G041010 · TK1151

细胞膜0.081

排名 3 · TkA07G041010 · TK1151

高尔基体0.081

排名 4 · TkA07G041010 · TK1151

线粒体0.071

排名 5 · TkA07G041010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00085Thioredoxin8-101 aa

PF13098Thioredoxin_210-97 aa

PF13899Thioredoxin_715-43 aa

PF13905Thioredoxin_820-48 aa

PF00462Glutaredoxin26-74 aa

PF07449HyaE40-92 aa

PF13905Thioredoxin_850-77 aa

PF13417GST_N_357-88 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G041010	`PF00085`	Thioredoxin	8	101	1.7e-15	57.6
TkA07G041010	`PF13098`	Thioredoxin_2	10	97	4.3e-06	27.7
TkA07G041010	`PF13899`	Thioredoxin_7	15	43	0.037	14.9
TkA07G041010	`PF13905`	Thioredoxin_8	20	48	0.24	12.5
TkA07G041010	`PF00462`	Glutaredoxin	26	74	1.1e-61	205.6
TkA07G041010	`PF07449`	HyaE	40	92	0.081	13.7
TkA07G041010	`PF13905`	Thioredoxin_8	50	77	0.24	12.5
TkA07G041010	`PF13417`	GST_N_3	57	88	1.4e-08	35.6
TkA07G041010	`PF22724`	NCAB1	156	219	0.00091	20.0
TkA07G041010	`PF07449`	HyaE	158	178	0.081	13.7
TkA07G041010	`PF13098`	Thioredoxin_2	169	189	4.3e-06	27.7
TkA07G041010	`PF00462`	Glutaredoxin	170	233	1.1e-61	205.6
TkA07G041010	`PF13417`	GST_N_3	181	242	1.4e-08	35.6
TkA07G041010	`PF00025`	Arf	181	216	0.22	11.7
TkA07G041010	`PF04908`	SH3BGR	188	219	2.7e-07	31.4
TkA07G041010	`PF17353`	DUF5381	190	217	0.19	12.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZPH2`	拟南芥	sp\|Q9ZPH2\|GRS17_ARATH Monothiol glutaredoxin-S17	69.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q0IWL9`	水稻	sp\|Q0IWL9\|GRS11_ORYSJ Monothiol glutaredoxin-S11	61.400%	Swiss-Prot	高置信

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