TkA07G006880 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G006880

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 1909456-1918567 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1333 bp · TkA07G006880|TK1151|cDNA

TGCATATCTAAAGGGCCACCTCTATTACCCCACGCTAGCACTATATATAATCTTGTTCATTTAATGGATATAGTGAAGCTTCAAAAGACCTACAAGCTCTTGAATTCCCTCATAAACCCCAGAAATTAAGACTGGAATTTGTGTGATCAGCAATGGTGGCATTTGGGAAAAAGTTGAAGGAATTGCAGATCCAGGAATGGAAAGGATATTACATTGATTACAAGTTACTCAAGAAGAAAGTAAAGCAATACGCTCAACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2103 bp · TkA07G006880|TK1151|CDS

ATGGTGGCATTTGGGAAAAAGTTGAAGGAATTGCAGATCCAGGAATGGAAAGGATATTACATTGATTACAAGTTACTCAAGAAGAAAGTAAAGCAATACGCTCAACAAAAGGACGATGTAGTCCACGATCGCGATTACGTTCTACGCGATTTCTCCAAATTGCTCGATGAACAGATTGAGAAGGTAGTTCTGTTCTTACTGAAGCGACAAGGTCAACTTGCGACTAGGTTATCAGGTCTTGCTGACAATGGCGACGAGAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

700 aa · TkA07G006880|TK1151|PROTEIN

MVAFGKKLKELQIQEWKGYYIDYKLLKKKVKQYAQQKDDVVHDRDYVLRDFSKLLDEQIEKVVLFLLKRQGQLATRLSGLADNGDESLSHGRDHDSIVELREGYREVGRDLLRLLFFVEMNAIGLRKILKKFDKRFGYKFTNYYVKTRANHPYSQLRQVFKHVGISAVVGSISRNIADLKDDQTHYASIYDHPTLHISDPIIESIKSAENRLLNSTDFLHYLGKHAFIVQDNEFPFPETSPQENNMNERYHFMSLVLNLV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G006880`
TK1151 ID	TkA07G006880
OH-1004 ID	LXL04_026776
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 95.714 / OH-1004 70.675 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G006880

位置 Chr07:1909456-1918567 (+)

描述 Similar to At4g22990: SPX domain-containing membrane protein At4g22990

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g22990`	含SPX结构域的膜蛋白 At4g22990。	暂无已核实直接文献
`At4g11810`	含 SPX 结构域的膜蛋白 At4g11810。	暂无已核实直接文献
`At1g63010`	含SPX结构域的膜蛋白At1g63010。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8AT51`	含SPX结构域的膜蛋白 OsI_17046。	暂无已核实直接文献
`Os04g0573000`	含SPX结构域的膜蛋白 Os04g0573000。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2Y8U6`	含SPX结构域的膜蛋白OsI_21475。	暂无已核实直接文献
`Os06g0129400`	含SPX结构域的膜蛋白 Os06g0129400。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026776 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程

GO:1905011 transmembrane phosphate ion transport from cytosol to vacuole 生物过程

GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G11810

ath:AT4G22990

dosa:Os02g0678200

dosa:Os04g0573000

osa:4336724

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.366

排名 1 · TkA07G006880 · TK1151

高尔基体0.237

排名 2 · TkA07G006880 · TK1151

内质网0.199

排名 3 · TkA07G006880 · TK1151

细胞质0.196

排名 4 · TkA07G006880 · TK1151

细胞膜0.169

排名 5 · TkA07G006880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03105SPX4-37 aa

PF03105SPX49-82 aa

PF03105SPX109-147 aa

PF18735HEPN_RiboL-PSP125-167 aa

PF07690MFS_1260-633 aa

PF00083Sugar_tr266-426 aa

PF23417STING_TM295-336 aa

PF23417STING_TM401-447 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G006880	`PF03105`	SPX	4	37	4.9e-13	50.6
TkA07G006880	`PF03105`	SPX	49	82	4.9e-13	50.6
TkA07G006880	`PF03105`	SPX	109	147	4.9e-13	50.6
TkA07G006880	`PF18735`	HEPN_RiboL-PSP	125	167	0.067	13.8
TkA07G006880	`PF07690`	MFS_1	260	633	2.1e-18	67.1
TkA07G006880	`PF00083`	Sugar_tr	266	426	3.6e-06	26.9
TkA07G006880	`PF23417`	STING_TM	295	336	0.93	10.6
TkA07G006880	`PF23417`	STING_TM	401	447	0.93	10.6
TkA07G006880	`PF23417`	STING_TM	536	570	0.93	10.6
TkA07G006880	`PF00083`	Sugar_tr	559	619	3.6e-06	26.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q93ZQ5`	拟南芥	sp\|Q93ZQ5\|SPXM3_ARATH SPX domain-containing membrane protein At4g22990	67.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q9T050`	拟南芥	sp\|Q9T050\|SPXM2_ARATH SPX domain-containing membrane protein At4g11810	65.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q2V4F9`	拟南芥	sp\|Q2V4F9\|SPXM1_ARATH SPX domain-containing membrane protein At1g63010	65.600%	Swiss-Prot	高置信
`B8AT51`	水稻	sp\|B8AT51\|SPXM2_ORYSI SPX domain-containing membrane protein OsI_17046	64.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q0JAW2`	水稻	sp\|Q0JAW2\|SPXM2_ORYSJ SPX domain-containing membrane protein Os04g0573000	64.600%	Swiss-Prot	高置信
`A2Y8U6`	水稻	sp\|A2Y8U6\|SPXM3_ORYSI SPX domain-containing membrane protein OsI_21475	64.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q658H5`	水稻	sp\|Q658H5\|SPXM3_ORYSJ SPX domain-containing membrane protein Os06g0129400	64.400%	Swiss-Prot	高置信

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