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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G006490
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 1805728-1809520 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3596 bp · TkA07G006490|TK1151|cDNA

CTTGCATTTAATAACTGCGTAAGGTCTAAAACATCATCTACACACATCCTTCTTTCCATTTATCAAACCTCTTTCTTCCACCATCTCGTTATTGCTTCTCTTTTCTTCCACCATCTATCAAAATGGCCGAAGCCTTAGTCACAATTGCTGCTGAAGGGATACTAGAAAGAGTGTTATCTTTAGCTACTAGCGAAATCGTCCTTGCTTGGGGTTATGAAGAGAAGTTAGCCGACCTTCATAGAACCTTGGAGCTCATTAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2979 bp · TkA07G006490|TK1151|CDS

ATGTTGTTGGTGAAGCTAATGATGTGTTGGATGAGATCCATTACGAGAAGACGCGAGGTAAAGAAACGAGACCTCATGGCAAGAAAGGTATCCACTCTCCCAAGTTTTAAAAAGCTTTCATTTCGATTAGAAATGGGTCATAAGATTGAAGATGTTAGCAAAAAGTTGTTTGAGATCAATAAACAAGCAAACGACTTAGGACTACAAAATGAACAACCGGGCGTTTTTCCAAATAGTCTTTTTCGGGAGACTGATCCTTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

992 aa · TkA07G006490|TK1151|PROTEIN

MLLVKLMMCWMRSITRRREVKKRDLMARKVSTLPSFKKLSFRLEMGHKIEDVSKKLFEINKQANDLGLQNEQPGVFPNSLFRETDPYLDEFKVVGRESDELHIVQLLTKSRKEEKLTIVPIVGMGGIGKTTLAKSIYNNSSIEQHFDVKVWLCVSVKVEVVEKLLAKIYESLAGEECKSEMRANLITSLQNKLGSKRYLIVLDDVWDEDGGFWDDFKTCMLKVNSKSGSGILVTTRSLQIGTKSMSEDFHALQSLTDDRC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G006490
TK1151 IDTkA07G006490
OH-1004 IDLXL04_026766
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)92.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.387 / OH-1004 91.714
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G006490
位置Chr07:1805728-1809520 (-)
描述Similar to RGA1: Putative disease resistance protein RGA1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14470 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026766 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G14470
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.568
排名 1 · TkA07G006490 · TK1151
细胞质0.263
排名 2 · TkA07G006490 · TK1151
细胞核0.212
排名 3 · TkA07G006490 · TK1151
内质网0.077
排名 4 · TkA07G006490 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA07G006490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05496RuvB_N88-140 aa
PF13191AAA_1692-205 aa
PF00931NB-ARC106-269 aa
PF25201nSTAND6114-151 aa
PF20720nSTAND3115-141 aa
PF00005ABC_tran117-141 aa
PF13401AAA_22119-205 aa
PF05729NACHT119-204 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G006490PF05496RuvB_N881400.1912.2
TkA07G006490PF13191AAA_16922050.0006920.9
TkA07G006490PF00931NB-ARC1062693.5e-35121.8
TkA07G006490PF25201nSTAND61141510.2512.1
TkA07G006490PF20720nSTAND31151410.2112.0
TkA07G006490PF00005ABC_tran1171410.2612.6
TkA07G006490PF13401AAA_221192050.01616.3
TkA07G006490PF05729NACHT1192040.1912.3
TkA07G006490PF00004AAA1211700.1313.5
TkA07G006490PF23952LRR_EndoS3103440.0007620.4
TkA07G006490PF23559WHD_DRP3564279.1e-2071.2
TkA07G006490PF00931NB-ARC3684003.5e-35121.8
TkA07G006490PF25019LRR_R13L1-DRL213854598.2e-38129.9
TkA07G006490PF23952LRR_EndoS4875390.0007620.4
TkA07G006490PF00004AAA4905270.1313.5
TkA07G006490PF25013LRR_Zer-14975610.0001322.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRR4拟南芥sp|Q9LRR4|R13L1_ARATH Putative disease resistance RPP13-like protein 129.700%Swiss-Prot低置信

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