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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G002780
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 729992-733107 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1883 bp · TkA07G002780|TK1151|cDNA

CTAAAGGTTGTCTTTCATGGACAAGTATTGGAAACCAGCACAGCTTACTAATTTAAGAGTAGACTTTCTCTCTCCTCCTTCCTTCTTTCTCTCTCTCACACACATACACACCGTCGCCGGTAATTTCATAAACTATCGCCGGTTACACCACTCCGTTCCCGGCTAAGCTAACACTCAGTGGAGTCCAGCTCGCTTACACATGTTCCTCATCTCCTCTTCCTAGCTTCTGTATCTAACGCCTAAATGTCTATATACGATAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1434 bp · TkA07G002780|TK1151|CDS

ATGTCTATATACGATAAAGCATTCATGAACAGCGAGCTCTCAAAACCTACCTCTATATTCGGTCTCCGGCTATGGGTTGTCGTCGGGATCTTCGTCGGAGTTATCATAGTCCTCGTGCTTTTCCTCATCTCCGTCTGCATCACCTCCCGCCGTCGACACTCTCACTCGAGTAAAAAAAATGAACAAACCCTAACCCCTGCAGTATCGAAAGAAATACAAGAGATAGTCCACCACGAGTCGACTGCAGCTGTGGATCACCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

477 aa · TkA07G002780|TK1151|PROTEIN

MSIYDKAFMNSELSKPTSIFGLRLWVVVGIFVGVIIVLVLFLISVCITSRRRHSHSSKKNEQTLTPAVSKEIQEIVHHESTAAVDHRMSVPEIQIDIGKSEHRVVFSDRQSSGESRATSNDTASYCGGSGGSSLPQVSHLGWGRWYTLRELEAATNGLADENVIGEGGYGIVYSGILGDNTRVAVKNLLNNRGQAEREFKVEVEAIGRVRHKNLVRLLGYCVEGAYRMLVYEYVDNGNLDQWLHGDVGDVSPLSWSIRLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G002780
TK1151 IDTkA07G002780
OH-1004 IDLXL04_026705
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G002780
位置Chr07:729992-733107 (-)
描述Similar to At1g01540: Probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g01540 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。 暂无已核实直接文献
At4g34500 可能的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g34500。 暂无已核实直接文献
At2g42960 可能的受体样蛋白激酶 At2g42960。 暂无已核实直接文献
At5g18500 可能的受体样蛋白激酶At5g18500。 暂无已核实直接文献
At3g17420 可能的受体样蛋白激酶 At3g17420。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026705 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009514 glyoxysome 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01540
ath:AT2G42960
ath:AT3G17420
ath:AT4G34500
ath:AT5G18500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.790
排名 1 · TkA07G002780 · TK1151
细胞质0.157
排名 2 · TkA07G002780 · TK1151
细胞核0.133
排名 3 · TkA07G002780 · TK1151
内质网0.048
排名 4 · TkA07G002780 · TK1151
高尔基体0.026
排名 5 · TkA07G002780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03896TRAP_alpha3-62 aa
PF06196DUF99714-45 aa
PF16038TMIE19-48 aa
PF28792DUF846119-44 aa
PF27867Membra_charge22-77 aa
PF14851FAM17624-101 aa
PF06143Baculo_11_kDa24-64 aa
PF04478Mid226-52 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G002780PF03896TRAP_alpha3620.2711.1
TkA07G002780PF06196DUF99714450.5610.9
TkA07G002780PF16038TMIE19480.03214.7
TkA07G002780PF28792DUF846119441.79.8
TkA07G002780PF27867Membra_charge22770.1213.1
TkA07G002780PF14851FAM176241010.02515.1
TkA07G002780PF06143Baculo_11_kDa24640.08113.2
TkA07G002780PF04478Mid226520.1412.6
TkA07G002780PF27960NCMAP27640.1113.2
TkA07G002780PF14575EphA2_TM28610.2512.8
TkA07G002780PF15345TMEM51291080.04214.4
TkA07G002780PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1614284.6e-46157.9
TkA07G002780PF00069Pkinase1614272.8e-45155.5
TkA07G002780PF03109ABC11671860.04313.7
TkA07G002780PF03109ABC12693140.04313.7
TkA07G002780PF14851FAM1764474710.02515.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3EDL4拟南芥sp|Q3EDL4|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g0154075.300%Swiss-Prot高置信
Q6NKZ9拟南芥sp|Q6NKZ9|Y4345_ARATH Probable receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3450057.300%Swiss-Prot高置信
Q9SJG2拟南芥sp|Q9SJG2|Y2296_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g4296054.000%Swiss-Prot高置信
Q8LEB6拟南芥sp|Q8LEB6|Y5185_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g1850052.600%Swiss-Prot高置信
Q9LRP3拟南芥sp|Q9LRP3|Y3174_ARATH Probable receptor-like protein kinase At3g1742063.800%Swiss-Prot中等置信

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