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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G000370
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 91884-95609 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1769 bp · TkA07G000370|TK1151|cDNA

CTTAACGCTCGTACACGTGTCTGGTGACGTGGAGTGTTGCCTTGCCGCCCTTCTCTCTCTGCCTCCTCTCTCTACAAGCTGCAAAAAGCCCACACTTCTTCCCTCCTCCCTTCCCATACCTCGTTTTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTCTAGAGAGAGAAAATGCAGTTCTGAATTTTCTTCTTACTCAGTGGAGTAAGCAGGTATATAAAGTCAAACATTGTAGTTGAGTGTTGACCAGTGCTTGAATTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1053 bp · TkA07G000370|TK1151|CDS

ATGGGCCACTGTGAAGAGATAAAGACTTGTAAGCCAGAAAAACCATCTTCACCACCACCTGAGCATCAGCAGACCGGTGTTCACGCATACCCCGATTGGGCCGCCATGCAGGCTTATTATGGTCCTAGAATGCCTGTACCCCCATATTTCAACTCATCTGTTGCATCCGGTCATCCTCCTCCACCTTACATGTGGGCACCACCACAGCATATGATGCCACCTTATGCTGCAATGTATCCACATCCTGGAGTCCATCTTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

350 aa · TkA07G000370|TK1151|PROTEIN

MGHCEEIKTCKPEKPSSPPPEHQQTGVHAYPDWAAMQAYYGPRMPVPPYFNSSVASGHPPPPYMWAPPQHMMPPYAAMYPHPGVHLASPMSIDSPAKSSGNSERGLMKKLKGFDGLAMSIGNGNENGISHSHSGETEGSSEGSDGNTTSGKRTIPPGKVSKTEPVSGNFFSNEASKKATALTVVTPPNPNSDSEIKKSPSMMPNEALLQNERELKRERRKQSNRESARRSRLRKQAEAEELAIKVDALTTENLTLKTEIN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G000370
TK1151 IDTkA07G000370
OH-1004 IDLXL04_026665
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)89.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G000370
位置Chr07:91884-95609 (+)
描述Similar to CPRF1: Common plant regulatory factor 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g46270 结合rbcS-1A基因启动子的G盒基序（5′-CCACGTGG-3′）。 暂无已核实直接文献
At4g01120 结合rbcS-1A基因启动子的G盒基序（5′-CCACGTGG-3′）。 暂无已核实直接文献
At4g36730 结合rbcS-1A基因启动子的G盒基序（5′-CCACGTGG-3′）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026665 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G46270
ath:AT4G01120
ath:AT4G36730
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.978
排名 1 · TkA07G000370 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA07G000370 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA07G000370 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA07G000370 · TK1151
线粒体0.006
排名 5 · TkA07G000370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07777MFMR1-85 aa
PF16596MFMR_assoc103-167 aa
PF02183HALZ204-217 aa
PF25450Rab11-FIP3208-294 aa
PF16596MFMR_assoc209-231 aa
PF00170bZIP_1211-273 aa
PF03131bZIP_Maf212-276 aa
PF07716bZIP_2213-263 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G000370PF07777MFMR1854.4e-2485.6
TkA07G000370PF16596MFMR_assoc1031676.1e-1040.4
TkA07G000370PF02183HALZ2042170.01715.9
TkA07G000370PF25450Rab11-FIP32082940.007117.4
TkA07G000370PF16596MFMR_assoc2092316.1e-1040.4
TkA07G000370PF00170bZIP_12112737.7e-2174.7
TkA07G000370PF03131bZIP_Maf2122760.00717.6
TkA07G000370PF07716bZIP_22132635.7e-0936.6
TkA07G000370PF02183HALZ2392650.01715.9
TkA07G000370PF07716bZIP_22672855.7e-0936.6
TkA07G000370PF02183HALZ2682800.01715.9
TkA07G000370PF00170bZIP_12722887.7e-2174.7
TkA07G000370PF03131bZIP_Maf2792920.00717.6
TkA07G000370PF07777MFMR2852884.4e-2485.6
TkA07G000370PF16596MFMR_assoc3013366.1e-1040.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42776拟南芥sp|P42776|GBF3_ARATH G-box-binding factor 348.000%Swiss-Prot中等置信
P42775拟南芥sp|P42775|GBF2_ARATH G-box-binding factor 239.300%Swiss-Prot中等置信
P42774拟南芥sp|P42774|GBF1_ARATH G-box-binding factor 138.200%Swiss-Prot中等置信

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