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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G237160
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 60821543-60822365 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

570 bp · TkA06G237160|TK1151|cDNA

ATGCTGAAGGATGTAGTGAGAACCAAGACCTACCAAAATGTCATTTACAAGAACAAGTTTTTATTCAAGGACAAAATTGTCCTTGATGTTGGTGCTGAGACAGGAATATTATCCCTATTCTGTGCAAAAGCTGGTGCAAAGCATGTTTATGCTATTGAGTGCTCACAAATGGCTGACATGGCACAAGAGATTGTTAAAGCAAATGTCTTTTCAGATGGTATAACTGTATTGAAGGGAAAAGTTGAAATTGACCTTCAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

570 bp · TkA06G237160|TK1151|CDS

ATGCTGAAGGATGTAGTGAGAACCAAGACCTACCAAAATGTCATTTACAAGAACAAGTTTTTATTCAAGGACAAAATTGTCCTTGATGTTGGTGCTGAGACAGGAATATTATCCCTATTCTGTGCAAAAGCTGGTGCAAAGCATGTTTATGCTATTGAGTGCTCACAAATGGCTGACATGGCACAAGAGATTGTTAAAGCAAATGTCTTTTCAGATGGTATAACTGTATTGAAGGGAAAAGTTGAAATTGACCTTCAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

189 aa · TkA06G237160|TK1151|PROTEIN

MLKDVVRTKTYQNVIYKNKFLFKDKIVLDVGAETGILSLFCAKAGAKHVYAIECSQMADMAQEIVKANVFSDGITVLKGKVEIDLQIPQVDIIILEWTGYFLLYENMLNTVLYARDKWLVSDRSTMELSYSIHLTAIEDANILFYPFKKNLCFCYFTVWNNVYGFDMSCIRKQSMMEPLVDKMTGFSTG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G237160
TK1151 IDTkA06G237160
OH-1004 IDLXL04_001829
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)90.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 43.573
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G237160
位置Chr06:60821543-60822365 (+)
描述Similar to PRMT1: Probable protein arginine N-methyltransferase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g29510 甲基化存在于富含甘氨酸和精氨酸的结构域中的精氨酰残基的胍基氮。
Identification and characterization of two closely related histone H4 arginine 3 methyltransferases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1042/bj20070786
PRMT11: a new Arabidopsis MBD7 protein partner with arginine methyltransferase activity.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03238.x
At2g19670 甲基化存在于富含甘氨酸和精氨酸的结构域中的精氨酰残基的胍基氮。
Identification and characterization of two closely related histone H4 arginine 3 methyltransferases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1042/bj20070786

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Z0C0 精氨酸甲基转移酶，对靶蛋白中精氨酸残基的胍氮进行甲基化（单甲基和非对称双甲基化）。 暂无已核实直接文献
Os09g0359800 精氨酸甲基转移酶，对靶蛋白中精氨酸残基的胍氮进行甲基化（单甲基和非对称双甲基化）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001829 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0031514 motile cilium 细胞组分
GO:0016274 protein-arginine N-methyltransferase activity 分子功能
GO:0035241 protein-arginine omega-N monomethyltransferase activity 分子功能
GO:0035242 protein-arginine omega-N asymmetric methyltransferase activity 分子功能
GO:0042054 histone methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19670
ath:AT4G29510
cre:CHLRE_03g172550v5
dosa:Os09g0359800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.572
排名 1 · TkA06G237160 · TK1151
细胞核0.363
排名 2 · TkA06G237160 · TK1151
线粒体0.101
排名 3 · TkA06G237160 · TK1151
内质网0.063
排名 4 · TkA06G237160 · TK1151
细胞膜0.058
排名 5 · TkA06G237160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01728FtsJ17-63 aa
PF13489Methyltransf_2321-79 aa
PF06325PrmA22-94 aa
PF12847Methyltransf_1822-94 aa
PF05175MTS23-94 aa
PF13649Methyltransf_2527-95 aa
PF08241Methyltransf_1128-99 aa
PF22528PRMT_C48-77 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G237160PF01728FtsJ17630.0004720.8
TkA06G237160PF13489Methyltransf_2321790.001419.1
TkA06G237160PF06325PrmA22948.2e-0729.5
TkA06G237160PF12847Methyltransf_1822940.0913.5
TkA06G237160PF05175MTS23940.004617.3
TkA06G237160PF13649Methyltransf_2527950.0005521.3
TkA06G237160PF08241Methyltransf_1128990.005917.9
TkA06G237160PF22528PRMT_C48774.6e-0627.4
TkA06G237160PF22528PRMT_C1551854.6e-0627.4
TkA06G237160PF13489Methyltransf_231591730.001419.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SU94拟南芥sp|Q9SU94|ANM11_ARATH Protein arginine N-methyltransferase 1.170.900%Swiss-Prot高置信
O82210拟南芥sp|O82210|ANM12_ARATH Probable protein arginine N-methyltransferase 1.266.100%Swiss-Prot高置信
A2Z0C0水稻sp|A2Z0C0|ANM1_ORYSI Protein arginine N-methyltransferase 170.900%Swiss-Prot高置信
Q0J2C6水稻sp|Q0J2C6|ANM1_ORYSJ Protein arginine N-methyltransferase 170.900%Swiss-Prot高置信

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