TkA06G208200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G208200

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 54012286-54017140 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2626 bp · TkA06G208200|TK1151|cDNA

ATAACATCGATTATACTCAACATAAATTTGCTGCCCAATCGCTTTACAATTCCAATAATGACCATAATACCCTTTCATCGAACAACCACAGCTTCTGCCAAAAGAACCCCAACAACGTCTTTGAAAAAAATACCAACTCCATCCCATAATTATAAAATACCATAATTGCCCTCGAAACAGAAAAAGACTGTCAGATTGATCCCTTCCATTCAAGACAGAAACCCATCCAAAATTACAAATTTGCCCTTGCTGCCCCTTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1398 bp · TkA06G208200|TK1151|CDS

ATGATGGTGTTCGGTCACTCAAGCACCGGAGGAGGTTTCCTCCCCGCAAAACTACAGGTTTACCCAGTGGACTACGAGGCCGACGTCTCTCAACGCCTCCTTGAAGCTTCGTCCTGTGGCGATCTCAAATCGGCGTTAGACTGCATTGACGATCCCTACGTTGACGTCAACTATCTCGGCGCTGTTTCCTTGAAGGTTCGTATGGCGGAAGTTAACTGCCGCGATGAATCGGAGAATGTGGTGCGATTTGAGTACCAGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

465 aa · TkA06G208200|TK1151|PROTEIN

MMVFGHSSTGGGFLPAKLQVYPVDYEADVSQRLLEASSCGDLKSALDCIDDPYVDVNYLGAVSLKVRMAEVNCRDESENVVRFEYQDVKTDVTALFIAVHTGNATLVRKLLAGANINGMVQLGAWSWETVSGEEFKVGAGLAEPYGITWCAVEYFEASGTILQMLLQHIPLDTRHNSRTLLHHAVLCGNTGAVKTLINLGADVESVIKTNKGTETRPIHMAARLGFHSIILQLIAAGCDINSRTKNDNETAQMISSKFKQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G208200`
TK1151 ID	TkA06G208200
OH-1004 ID	LXL04_023846
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	76.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.634 / OH-1004 78.647 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G208200`
位置	Chr06:54012286-54017140 (-)
描述	Similar to Ank3: Ankyrin-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_023846` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程 GO:0006887 exocytosis 生物过程 GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0007009 plasma membrane organization 生物过程 GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0007528 neuromuscular junction development 生物过程 GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程 GO:0010650 positive regulation of cell communication by electrical coupling 生物过程 GO:0010765 positive regulation of sodium ion transport 生物过程 GO:0010960 magnesium ion homeostasis 生物过程 GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程
KEGG 基因交叉引用	hsa:286 mmu:11735 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.596

排名 1 · TkA06G208200 · TK1151

细胞核0.437

排名 2 · TkA06G208200 · TK1151

线粒体0.075

排名 3 · TkA06G208200 · TK1151

细胞膜0.043

排名 4 · TkA06G208200 · TK1151

内质网0.034

排名 5 · TkA06G208200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00023Ank66-75 aa

PF12796Ank_290-117 aa

PF13637Ank_490-111 aa

PF13857Ank_592-115 aa

PF00023Ank93-117 aa

PF13606Ank_393-117 aa

PF23745ANK_LRRK293-112 aa

PF12796Ank_2159-204 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G208200	`PF00023`	Ank	66	75	4.1e-36	121.7
TkA06G208200	`PF12796`	Ank_2	90	117	1.3e-39	135.3
TkA06G208200	`PF13637`	Ank_4	90	111	3.7e-25	88.1
TkA06G208200	`PF13857`	Ank_5	92	115	1.1e-26	93.3
TkA06G208200	`PF00023`	Ank	93	117	4.1e-36	121.7
TkA06G208200	`PF13606`	Ank_3	93	117	1e-25	87.3
TkA06G208200	`PF23745`	ANK_LRRK2	93	112	0.022	15.4
TkA06G208200	`PF12796`	Ank_2	159	204	1.3e-39	135.3
TkA06G208200	`PF13606`	Ank_3	160	168	1e-25	87.3
TkA06G208200	`PF00023`	Ank	161	167	4.1e-36	121.7
TkA06G208200	`PF13637`	Ank_4	162	197	3.7e-25	88.1
TkA06G208200	`PF13857`	Ank_5	166	203	1.1e-26	93.3
TkA06G208200	`PF23745`	ANK_LRRK2	177	210	0.022	15.4
TkA06G208200	`PF00023`	Ank	178	204	4.1e-36	121.7
TkA06G208200	`PF13606`	Ank_3	178	203	1e-25	87.3
TkA06G208200	`PF13637`	Ank_4	192	231	3.7e-25	88.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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